MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Non-Coding Repeats of Coxiella burnetii RSA 493 plasmid pQpH1

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004704	T	6	6	1400	1405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004704	T	7	7	1469	1475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004704	G	6	6	1569	1574	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004704	A	6	6	1638	1643	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004704	A	6	6	1698	1703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004704	T	6	6	1716	1721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004704	A	6	6	2126	2131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004704	T	6	6	2163	2168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004704	T	6	6	2482	2487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004704	A	7	7	3624	3630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004704	T	7	7	3647	3653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004704	A	7	7	3708	3714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_004704	A	6	6	4918	4923	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004704	T	7	7	5027	5033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004704	A	6	6	5095	5100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004704	C	6	6	5358	5363	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17	NC_004704	A	6	6	5834	5839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004704	A	7	7	6632	6638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004704	A	6	6	6657	6662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004704	T	6	6	6750	6755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004704	A	7	7	7487	7493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004704	A	6	6	8000	8005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004704	A	7	7	9058	9064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004704	A	7	7	9403	9409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004704	G	6	6	10378	10383	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
26	NC_004704	A	6	6	10739	10744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004704	G	6	6	10827	10832	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004704	A	6	6	13169	13174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_004704	T	6	6	14064	14069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004704	A	6	6	14084	14089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004704	T	6	6	14323	14328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004704	T	6	6	15184	15189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004704	A	6	6	15192	15197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004704	A	6	6	15309	15314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004704	T	9	9	15428	15436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004704	T	6	6	15460	15465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004704	A	6	6	15860	15865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004704	A	8	8	15943	15950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004704	T	7	7	16152	16158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004704	A	6	6	18014	18019	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004704	A	7	7	18047	18053	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004704	A	6	6	18152	18157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004704	A	7	7	18366	18372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_004704	A	7	7	18662	18668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004704	A	6	6	18967	18972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004704	A	8	8	19056	19063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004704	A	6	6	19117	19122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_004704	A	8	8	19143	19150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004704	A	7	7	19279	19285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004704	A	6	6	19661	19666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004704	T	9	9	19710	19718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004704	T	7	7	21720	21726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_004704	T	6	6	22019	22024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004704	A	7	7	23482	23488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_004704	T	6	6	23655	23660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004704	A	7	7	24724	24730	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004704	A	8	8	24853	24860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004704	A	6	6	25233	25238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_004704	A	6	6	25276	25281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004704	T	6	6	26345	26350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004704	T	6	6	27200	27205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_004704	T	6	6	27334	27339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004704	A	6	6	27616	27621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004704	T	6	6	27910	27915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004704	T	7	7	28161	28167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004704	T	6	6	28221	28226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_004704	T	6	6	29611	29616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004704	A	7	7	29617	29623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004704	T	6	6	30735	30740	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_004704	T	6	6	30887	30892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004704	A	7	7	32656	32662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004704	A	6	6	32703	32708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004704	A	6	6	32722	32727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004704	T	6	6	32735	32740	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004704	G	6	6	36390	36395	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.