MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium tetani E88 chromosome

Total Repeats: 667

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004557	AGCTT	2	10	6911	6920	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_004557	ACTTA	2	10	7394	7403	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_004557	CTCCC	2	10	7922	7931	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
4	NC_004557	CACTT	2	10	8536	8545	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_004557	CACGA	2	10	9178	9187	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_004557	TTACC	2	10	9968	9977	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
7	NC_004557	TTTTA	2	10	11520	11529	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004557	AATTT	2	10	11572	11581	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004557	ATTAT	2	10	12398	12407	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004557	AAATT	2	10	13301	13310	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004557	TAATT	2	10	13533	13542	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004557	TAAAA	2	10	16235	16244	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_004557	TTTAA	2	10	19597	19606	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004557	TATTT	2	10	19943	19952	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004557	TATAT	2	10	27062	27071	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004557	ATTAT	2	10	27097	27106	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004557	ATTAT	2	10	27132	27141	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004557	AATAA	2	10	28176	28185	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004557	ACGGT	2	10	28489	28498	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_004557	AGCTT	2	10	39997	40006	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_004557	ACTTA	2	10	40480	40489	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_004557	CTCCC	2	10	41008	41017	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
23	NC_004557	CACTT	2	10	41622	41631	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
24	NC_004557	CACGA	2	10	42264	42273	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_004557	TTACC	2	10	43054	43063	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_004557	TATAA	2	10	49647	49656	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004557	ATAAA	2	10	53488	53497	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004557	ATTAA	2	10	53624	53633	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_004557	CATAA	2	10	64183	64192	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_004557	TATAT	2	10	65393	65402	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004557	TTAAA	2	10	76839	76848	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004557	AATTA	2	10	78478	78487	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004557	ATAAA	2	10	80915	80924	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004557	GTATA	2	10	100250	100259	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004557	TAAAA	2	10	102374	102383	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004557	ATTTA	2	10	102845	102854	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004557	TAAAA	2	10	109119	109128	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004557	AAAGA	2	10	118487	118496	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004557	TTTAA	2	10	119926	119935	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004557	TTAAT	2	10	120789	120798	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004557	TAAAA	2	10	121329	121338	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004557	TAAAA	2	10	127728	127737	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004557	AGCAA	2	10	127793	127802	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_004557	TATTC	2	10	137082	137091	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_004557	AAAAT	2	10	139493	139502	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004557	ATTTA	2	10	141072	141081	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004557	TAGAA	2	10	141109	141118	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_004557	TAATT	2	10	152179	152188	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004557	ATTAA	2	10	158908	158917	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004557	AAAAG	2	10	166613	166622	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004557	GAAGT	2	10	174112	174121	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004557	TAAAT	2	10	174125	174134	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_004557	GGTAA	2	10	176359	176368	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004557	TCGTG	2	10	177149	177158	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_004557	AAGTG	2	10	177791	177800	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004557	GGGAG	2	10	178405	178414	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004557	TAAGT	2	10	178933	178942	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004557	TCGTA	2	10	179125	179134	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_004557	AAGCT	2	10	179416	179425	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_004557	AGGAA	2	10	181151	181160	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004557	TCTAT	2	10	191571	191580	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_004557	ATTTT	2	10	191588	191597	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004557	TTTAA	2	10	194618	194627	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004557	TACTA	2	10	195093	195102	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_004557	ATATT	2	10	198498	198507	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004557	TGAAA	2	10	198549	198558	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_004557	GTAAT	2	10	198680	198689	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004557	TTTAA	2	10	203390	203399	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004557	TAATA	2	10	213411	213420	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_004557	TGCAT	2	10	218409	218418	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_004557	CTTAA	2	10	222009	222018	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_004557	ATATA	2	10	231182	231191	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004557	GAAAA	2	10	235949	235958	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004557	AAATA	2	10	245343	245352	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004557	ATTAA	2	10	254631	254640	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_004557	GATGT	2	10	256925	256934	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_004557	TACTA	2	10	257696	257705	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_004557	GTTTT	2	10	258294	258303	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004557	ATAAA	2	10	261542	261551	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_004557	TTAGA	2	10	261764	261773	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_004557	ACAGT	2	10	261826	261835	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_004557	AAAAC	2	10	262013	262022	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_004557	GAATT	2	10	262210	262219	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_004557	AAATA	2	10	268529	268538	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004557	ATTAA	2	10	275871	275880	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_004557	ATAAA	2	10	278449	278458	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_004557	GCAAA	2	10	278465	278474	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_004557	ATTAT	2	10	281317	281326	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_004557	TGTAG	2	10	284357	284366	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_004557	TATAA	2	10	294350	294359	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004557	CAAAG	2	10	301256	301265	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_004557	TATAA	2	10	302646	302655	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_004557	ATATA	2	10	304779	304788	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_004557	ATATA	2	10	304791	304800	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_004557	TTAAT	2	10	309091	309100	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_004557	ATGTA	2	10	310597	310606	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_004557	TTATT	2	10	313282	313291	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004557	TAAAA	2	10	318077	318086	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_004557	TTTAA	2	10	318176	318185	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_004557	TTATG	2	10	321091	321100	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_004557	TATTT	2	10	331333	331342	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_004557	TCTTT	2	10	342361	342370	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_004557	AATGA	2	10	349489	349498	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_004557	ATATT	2	10	356078	356087	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_004557	TTAAA	2	10	364627	364636	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_004557	ATATT	2	10	364717	364726	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_004557	TACAT	2	10	364901	364910	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_004557	AATTA	2	10	366352	366361	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_004557	TAAAA	2	10	374008	374017	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_004557	AATTA	2	10	374019	374028	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_004557	ATAAA	2	10	376097	376106	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_004557	TATTT	2	10	376156	376165	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_004557	ATATA	2	10	379531	379540	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_004557	TATAA	2	10	380318	380327	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_004557	TGTTC	2	10	380567	380576	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_004557	ATTTA	2	10	390692	390701	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_004557	AAAAT	2	10	393110	393119	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_004557	TTTAA	2	10	396470	396479	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_004557	TATAA	2	10	406420	406429	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_004557	AATTA	2	10	411578	411587	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_004557	ATTAT	2	10	418851	418860	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_004557	AGAAA	2	10	429249	429258	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_004557	TATTG	2	10	430290	430299	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_004557	AACAA	2	10	434039	434048	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_004557	TTTGT	2	10	434317	434326	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_004557	ATATT	2	10	434366	434375	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_004557	TTTTA	2	10	436520	436529	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_004557	ATACT	2	10	436666	436675	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_004557	AATTA	2	10	439975	439984	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_004557	TTTTG	2	10	441750	441759	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_004557	AATAA	2	10	441951	441960	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_004557	AAGCA	2	10	442417	442426	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_004557	ATTAA	2	10	443530	443539	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_004557	TCTAT	2	10	447996	448005	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_004557	ATATG	2	10	453701	453710	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_004557	TAAAA	2	10	457694	457703	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_004557	ATTCT	2	10	458289	458298	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_004557	AGTAA	2	10	463663	463672	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_004557	ATTTA	2	10	469925	469934	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_004557	ATAAA	2	10	471233	471242	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_004557	AAAAT	2	10	471561	471570	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_004557	TAAAA	2	10	471657	471666	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_004557	CTAAT	2	10	473930	473939	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_004557	ATTTT	2	10	473971	473980	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_004557	TAAAA	2	10	474065	474074	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_004557	TATAA	2	10	476972	476981	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_004557	TAATT	2	10	478654	478663	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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149	NC_004557	TACTG	2	10	497943	497952	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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