MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium tetani E88 chromosome

Total Repeats: 1565

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004557	TAAT	2	8	2328	2335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004557	TTTA	2	8	2462	2469	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004557	TATT	2	8	3941	3948	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004557	GGTG	2	8	4015	4022	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004557	ATTA	2	8	4556	4563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004557	TTTA	2	8	4572	4579	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004557	TTAT	2	8	5152	5159	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004557	AATT	2	8	5227	5234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004557	TCAG	2	8	5584	5591	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_004557	ACCT	2	8	6804	6811	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_004557	ACTC	2	8	7174	7181	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_004557	GTCT	2	8	8133	8140	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_004557	AAAT	2	8	8167	8174	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004557	TCGC	2	8	8198	8205	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_004557	GAAG	2	8	10148	10155	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004557	TGTC	2	8	10346	10353	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_004557	ATTT	2	8	10414	10421	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004557	CTTT	2	8	10503	10510	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_004557	TATT	2	8	11699	11706	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004557	AAAT	2	8	11993	12000	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004557	TCTT	2	8	12011	12018	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_004557	TTAT	2	8	12356	12363	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004557	TATT	2	8	13260	13267	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004557	TTTA	2	8	17585	17592	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004557	ATAC	2	8	17601	17608	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_004557	ATTT	2	8	17619	17626	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004557	TTTA	2	8	17642	17649	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004557	TATT	2	8	17668	17675	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_004557	TAAA	2	8	17685	17692	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004557	TTTA	3	12	17700	17711	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004557	ATAA	2	8	17721	17728	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004557	GTAT	2	8	17781	17788	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004557	TTTA	2	8	19972	19979	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004557	AAAT	2	8	20257	20264	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004557	AATT	2	8	20270	20277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004557	TGAA	2	8	20306	20313	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004557	ATTA	2	8	23640	23647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004557	TTAA	2	8	23752	23759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004557	TAAA	2	8	23844	23851	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004557	ATTA	2	8	24729	24736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004557	TATT	2	8	25436	25443	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004557	TTTA	2	8	26143	26150	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004557	ATTT	2	8	26295	26302	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_004557	TAAA	2	8	26392	26399	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004557	TTAA	2	8	28666	28673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004557	AAAT	2	8	30138	30145	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004557	ACCA	2	8	30159	30166	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_004557	TCAG	2	8	38670	38677	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_004557	ACCT	2	8	39890	39897	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_004557	ACTC	2	8	40260	40267	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_004557	GTCT	2	8	41219	41226	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_004557	AAAT	2	8	41253	41260	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_004557	TCGC	2	8	41284	41291	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_004557	GAAG	2	8	43234	43241	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_004557	TGTC	2	8	43432	43439	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_004557	ATTT	2	8	43500	43507	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004557	TATC	3	12	49627	49638	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_004557	TATC	2	8	49826	49833	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_004557	TTCA	2	8	52913	52920	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_004557	AAAG	3	12	53117	53128	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004557	CTTT	2	8	55148	55155	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_004557	TTAA	2	8	55172	55179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004557	TTTA	2	8	64143	64150	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004557	AAAT	2	8	64155	64162	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004557	AAGG	2	8	64281	64288	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004557	CATC	2	8	65507	65514	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_004557	TAGA	2	8	65700	65707	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004557	AAAG	2	8	66300	66307	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004557	ATAA	2	8	66355	66362	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_004557	AAAG	2	8	66434	66441	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004557	GTAT	2	8	66615	66622	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004557	ATTA	2	8	72370	72377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004557	ATAG	2	8	76042	76049	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004557	GGAT	2	8	76083	76090	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004557	TAAT	2	8	76857	76864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_004557	CAAT	2	8	76908	76915	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_004557	ATTA	2	8	78469	78476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004557	TAAA	2	8	78718	78725	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004557	TAAA	2	8	80942	80949	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_004557	TAAA	2	8	82227	82234	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_004557	ACAT	2	8	82682	82689	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_004557	ATGT	2	8	82693	82700	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004557	ATTT	2	8	87548	87555	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_004557	CTAA	2	8	95590	95597	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_004557	TAAA	2	8	95662	95669	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_004557	ATAA	2	8	97658	97665	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_004557	ATTT	2	8	98894	98901	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004557	TAAA	2	8	99439	99446	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_004557	TTTA	2	8	100945	100952	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_004557	GACT	2	8	102412	102419	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_004557	AAAT	2	8	102659	102666	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_004557	ATTA	2	8	102677	102684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_004557	TTTA	2	8	106607	106614	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_004557	ATTT	2	8	107177	107184	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_004557	TATT	2	8	111300	111307	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_004557	CAAG	2	8	114988	114995	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_004557	TATT	2	8	115036	115043	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004557	CTTT	2	8	116746	116753	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_004557	TTTG	2	8	119442	119449	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_004557	TTAG	2	8	119463	119470	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_004557	ACTA	2	8	119766	119773	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_004557	TAAA	2	8	119974	119981	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_004557	TAAA	2	8	120028	120035	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_004557	ATAA	2	8	120052	120059	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_004557	TAAT	2	8	127844	127851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_004557	TAAA	2	8	129007	129014	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_004557	ATTA	2	8	130885	130892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_004557	TAAA	2	8	130958	130965	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_004557	TTTA	2	8	133457	133464	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_004557	AAGA	2	8	133537	133544	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_004557	ATCT	2	8	141030	141037	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_004557	ATTA	2	8	141038	141045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_004557	GTTT	2	8	142225	142232	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_004557	AATA	2	8	142289	142296	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_004557	ATAA	2	8	142493	142500	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_004557	AAAT	2	8	144946	144953	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_004557	TTAA	2	8	157100	157107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_004557	AAAG	2	8	157185	157192	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_004557	AAAG	2	8	157390	157397	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_004557	AGGC	2	8	157589	157596	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_004557	GGAT	2	8	157761	157768	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_004557	TTTA	2	8	158359	158366	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_004557	TAAA	2	8	159719	159726	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_004557	ATAA	2	8	160085	160092	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_004557	TAAA	2	8	172089	172096	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_004557	TTTC	2	8	172432	172439	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_004557	TTTA	2	8	173946	173953	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_004557	TAAA	2	8	175787	175794	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_004557	GACA	2	8	175983	175990	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_004557	CTTC	2	8	176181	176188	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_004557	AGAA	2	8	178102	178109	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_004557	GCGA	2	8	178131	178138	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_004557	ATTT	2	8	178162	178169	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_004557	AGAC	2	8	178196	178203	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_004557	GAGT	2	8	179155	179162	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_004557	AGGT	2	8	179525	179532	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_004557	CTGA	2	8	180745	180752	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_004557	TAAA	2	8	181135	181142	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_004557	AAAT	2	8	182942	182949	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_004557	AAAT	2	8	189719	189726	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_004557	TAAT	2	8	189926	189933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_004557	TTTA	2	8	191519	191526	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_004557	TTTA	2	8	194725	194732	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_004557	ATTA	2	8	195133	195140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_004557	GAAA	2	8	195890	195897	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_004557	ATAA	2	8	196075	196082	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_004557	AAAG	2	8	196093	196100	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_004557	ATTT	2	8	197400	197407	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_004557	TAAT	2	8	198626	198633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_004557	GCAA	2	8	198667	198674	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_004557	TAGG	2	8	198806	198813	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_004557	TAGA	2	8	201187	201194	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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