MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium tetani E88 chromosome

Total Repeats: 12597

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_004557	T	6	6	593133	593138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_004557	CCT	2	6	593186	593191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3003	NC_004557	T	6	6	593225	593230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_004557	TAT	2	6	593232	593237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_004557	ATT	2	6	593287	593292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_004557	A	6	6	593299	593304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_004557	CTT	2	6	593333	593338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_004557	TATTTT	2	12	593339	593350	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_004557	TCC	2	6	596501	596506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3010	NC_004557	TAA	2	6	596523	596528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_004557	TAT	2	6	596532	596537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_004557	A	7	7	596538	596544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_004557	AT	3	6	596547	596552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_004557	ATTAT	2	10	596559	596568	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_004557	AATTA	2	10	596571	596580	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_004557	TA	3	6	596584	596589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_004557	AT	3	6	596593	596598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_004557	ATG	2	6	596605	596610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_004557	AT	3	6	596625	596630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_004557	TAT	2	6	596635	596640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_004557	ACAAT	2	10	596647	596656	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3022	NC_004557	TTA	2	6	596676	596681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_004557	AT	3	6	596685	596690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_004557	TAT	2	6	596693	596698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_004557	TA	3	6	596702	596707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_004557	TTA	2	6	596725	596730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_004557	TA	3	6	596729	596734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_004557	AAT	2	6	596737	596742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_004557	ATA	2	6	596746	596751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_004557	AAGA	2	8	596786	596793	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_004557	AAAG	2	8	596800	596807	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_004557	A	6	6	596839	596844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_004557	ATT	2	6	596849	596854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_004557	TAAAT	2	10	597288	597297	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_004557	TAA	2	6	597301	597306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3037	NC_004557	A	6	6	597388	597393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_004557	TAA	2	6	597403	597408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_004557	AAT	2	6	599123	599128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_004557	TA	3	6	599163	599168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_004557	ATA	2	6	599188	599193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_004557	ATA	2	6	603596	603601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_004557	GGA	2	6	603651	603656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3045	NC_004557	AATAT	2	10	605283	605292	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_004557	TATT	2	8	607748	607755	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_004557	TC	3	6	609340	609345	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3048	NC_004557	T	6	6	609355	609360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_004557	CCT	2	6	609408	609413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3050	NC_004557	TA	3	6	609420	609425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_004557	TAA	2	6	609431	609436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_004557	ATAG	2	8	609443	609450	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_004557	AAAAT	2	10	609460	609469	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_004557	TAA	2	6	609473	609478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_004557	ATT	2	6	609513	609518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3057	NC_004557	AT	3	6	609584	609589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_004557	TAC	2	6	609614	609619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3059	NC_004557	AATT	2	8	609664	609671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_004557	A	6	6	609676	609681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_004557	TTAAT	2	10	609689	609698	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_004557	ATA	2	6	609702	609707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_004557	AGG	2	6	609753	609758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3065	NC_004557	AT	4	8	610329	610336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_004557	A	7	7	610350	610356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_004557	GAG	2	6	610366	610371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3069	NC_004557	TA	3	6	611630	611635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_004557	TGT	2	6	611657	611662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_004557	AAT	2	6	613247	613252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_004557	AT	4	8	613268	613275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_004557	TA	3	6	613283	613288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_004557	ATA	2	6	613348	613353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3079	NC_004557	TAC	2	6	614178	614183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3082	NC_004557	TA	5	10	614695	614704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_004557	TTAAA	2	10	614738	614747	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_004557	TA	3	6	618771	618776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_004557	AGT	2	6	618782	618787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3087	NC_004557	AT	3	6	618801	618806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_004557	ATA	2	6	618815	618820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_004557	TA	3	6	618819	618824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_004557	TAC	2	6	618840	618845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3091	NC_004557	AAT	2	6	618859	618864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_004557	AAT	2	6	618934	618939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_004557	TAAAA	2	10	618961	618970	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_004557	AATA	2	8	618983	618990	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3098	NC_004557	TA	3	6	621464	621469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_004557	TTTAA	2	10	621480	621489	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_004557	CTA	2	6	621500	621505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_004557	T	7	7	621511	621517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_004557	T	6	6	621547	621552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_004557	TATAA	2	10	621592	621601	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_004557	AGGG	2	8	621619	621626	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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3107	NC_004557	TA	3	6	625050	625055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_004557	ATAA	2	8	625070	625077	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_004557	TTA	2	6	625161	625166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_004557	CAA	2	6	625176	625181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3111	NC_004557	TAT	2	6	625257	625262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_004557	AATA	2	8	625293	625300	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3115	NC_004557	A	6	6	625356	625361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_004557	CTT	2	6	625364	625369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_004557	T	6	6	625368	625373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_004557	CTC	2	6	625404	625409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3119	NC_004557	T	7	7	625432	625438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_004557	TCT	2	6	625452	625457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_004557	ACC	2	6	625822	625827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3122	NC_004557	ATA	2	6	625841	625846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_004557	TAC	2	6	625863	625868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3124	NC_004557	ACT	2	6	625870	625875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3127	NC_004557	TAG	2	6	625940	625945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_004557	CCT	2	6	626009	626014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3129	NC_004557	ATTAA	2	10	626035	626044	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_004557	AGG	2	6	626052	626057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_004557	TAAA	2	8	626501	626508	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_004557	TTTA	2	8	626535	626542	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_004557	ATTT	2	8	626616	626623	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_004557	AT	3	6	626631	626636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_004557	TA	3	6	626640	626645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_004557	TTA	2	6	626651	626656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3137	NC_004557	AGA	2	6	626660	626665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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