MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium tetani E88 chromosome

Total Repeats: 12597

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_004557	GAAGT	2	10	174112	174121	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_004557	TAAAT	2	10	174125	174134	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_004557	TAA	2	6	174141	174146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_004557	T	7	7	174168	174174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_004557	AAG	2	6	174177	174182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_004557	ATT	2	6	174246	174251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_004557	TAA	2	6	174254	174259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_004557	ATA	2	6	175677	175682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_004557	TA	3	6	175721	175726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_004557	AAC	2	6	175728	175733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_004557	TAAA	2	8	175787	175794	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_004557	CAA	2	6	175819	175824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_004557	GTT	2	6	175861	175866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_004557	GA	3	6	175867	175872	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_004557	AAC	2	6	175874	175879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_004557	A	8	8	175924	175931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_004557	A	8	8	175946	175953	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_004557	GACA	2	8	175983	175990	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1019	NC_004557	A	6	6	176047	176052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_004557	TA	4	8	176079	176086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_004557	GGC	2	6	176144	176149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_004557	CTTC	2	8	176181	176188	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1023	NC_004557	GCG	2	6	176202	176207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_004557	AGG	2	6	176263	176268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_004557	GGTAA	2	10	176359	176368	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_004557	CGA	2	6	176382	176387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_004557	GCA	2	6	176456	176461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_004557	GCA	2	6	176496	176501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_004557	CGC	2	6	176503	176508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1030	NC_004557	TGA	2	6	176514	176519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_004557	CAG	2	6	176599	176604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_004557	GAA	2	6	176791	176796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_004557	AGG	2	6	176914	176919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_004557	AGC	2	6	177017	177022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_004557	GAA	2	6	177052	177057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_004557	GGT	2	6	177126	177131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_004557	GTC	2	6	177140	177145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_004557	TCGTG	2	10	177149	177158	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1039	NC_004557	TTA	3	9	177194	177202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_004557	GGA	2	6	177252	177257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_004557	ATC	2	6	177276	177281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_004557	AC	3	6	177303	177308	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1043	NC_004557	AG	3	6	177328	177333	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_004557	AC	3	6	177471	177476	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1045	NC_004557	CCT	2	6	177612	177617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_004557	GA	3	6	177661	177666	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_004557	TAA	2	6	177735	177740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_004557	AGT	2	6	177775	177780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_004557	AAGTG	2	10	177791	177800	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_004557	AGC	2	6	177801	177806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_004557	AGC	2	6	177829	177834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_004557	GGA	2	6	178094	178099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_004557	AGAA	2	8	178102	178109	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_004557	TAG	2	6	178123	178128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_004557	GCGA	2	8	178131	178138	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1056	NC_004557	ATTT	2	8	178162	178169	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_004557	CAT	2	6	178188	178193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_004557	AGAC	2	8	178196	178203	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1059	NC_004557	AG	3	6	178213	178218	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_004557	A	6	6	178258	178263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_004557	ACC	2	6	178329	178334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1062	NC_004557	GGGAG	2	10	178405	178414	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_004557	TG	3	6	178464	178469	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_004557	GGA	2	6	178643	178648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_004557	ACA	2	6	178806	178811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_004557	AAC	2	6	178899	178904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_004557	TAAGT	2	10	178933	178942	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_004557	AGC	2	6	178989	178994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_004557	ACC	2	6	179068	179073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1070	NC_004557	TCGTA	2	10	179125	179134	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1071	NC_004557	GAGT	2	8	179155	179162	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_004557	TG	3	6	179373	179378	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_004557	AAGCT	2	10	179416	179425	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1074	NC_004557	AGGT	2	8	179525	179532	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_004557	GAG	2	6	179533	179538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1077	NC_004557	CGT	2	6	180470	180475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_004557	GAA	2	6	180694	180699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_004557	GCA	2	6	180729	180734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_004557	CTGA	2	8	180745	180752	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1081	NC_004557	ATT	2	6	180779	180784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_004557	ATT	2	6	180807	180812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_004557	CTT	2	6	180826	180831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_004557	CCA	2	6	181084	181089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1085	NC_004557	TAAA	2	8	181135	181142	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_004557	AGGAA	2	10	181151	181160	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_004557	TAA	2	6	181164	181169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_004557	TA	4	8	181945	181952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_004557	TA	3	6	181956	181961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_004557	AGG	2	6	181980	181985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_004557	AT	3	6	182784	182789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_004557	A	6	6	182893	182898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1094	NC_004557	AAAT	2	8	182942	182949	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_004557	TTA	2	6	183006	183011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_004557	ATA	2	6	183055	183060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_004557	TAA	2	6	183121	183126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_004557	AGG	2	6	183133	183138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_004557	AT	3	6	183673	183678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_004557	T	6	6	183694	183699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_004557	AT	3	6	184913	184918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_004557	AT	4	8	184953	184960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_004557	AG	3	6	184961	184966	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_004557	GAG	2	6	184993	184998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_004557	GAA	2	6	185009	185014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_004557	AGA	2	6	185108	185113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_004557	AT	3	6	185159	185164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_004557	TTG	2	6	186616	186621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_004557	AGG	2	6	187384	187389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_004557	TTA	2	6	187406	187411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_004557	GAT	3	9	187426	187434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_004557	TAG	2	6	187445	187450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_004557	TTA	2	6	187453	187458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_004557	CTA	2	6	187490	187495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_004557	AGG	2	6	187497	187502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_004557	TAC	2	6	187521	187526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_004557	GAA	2	6	187579	187584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_004557	GTT	2	6	187606	187611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_004557	ACA	2	6	187612	187617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_004557	GGA	2	6	187678	187683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_004557	GTA	2	6	187696	187701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_004557	TGT	2	6	189666	189671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_004557	A	6	6	189679	189684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_004557	TAA	2	6	189693	189698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_004557	AAAT	2	8	189719	189726	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_004557	ATG	2	6	189755	189760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_004557	TGG	2	6	189785	189790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_004557	TA	3	6	189894	189899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_004557	AGG	2	6	189900	189905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_004557	AAT	2	6	189912	189917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_004557	TAAT	2	8	189926	189933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_004557	GTA	2	6	190009	190014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_004557	AAT	2	6	190082	190087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_004557	A	8	8	190088	190095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_004557	T	7	7	190112	190118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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