MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydophila abortus S26/3

Total Repeats: 3282

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004552	A	8	8	203897	203904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_004552	TAAA	2	8	203922	203929	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_004552	TTG	2	6	203943	203948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_004552	TCT	2	6	204918	204923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_004552	AAT	2	6	204985	204990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_004552	T	7	7	204990	204996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_004552	GAT	2	6	205005	205010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_004552	CAAA	2	8	205045	205052	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
509	NC_004552	TAG	2	6	205082	205087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_004552	TTTA	2	8	205491	205498	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_004552	ATA	2	6	206001	206006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_004552	TTG	2	6	210047	210052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_004552	ACC	2	6	210085	210090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
514	NC_004552	AT	3	6	210192	210197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_004552	A	6	6	210198	210203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_004552	TTAA	2	8	210246	210253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_004552	A	6	6	210252	210257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_004552	T	6	6	210265	210270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_004552	TTTTTA	2	12	210298	210309	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_004552	CAAA	2	8	210340	210347	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
521	NC_004552	GAA	2	6	210349	210354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_004552	GAT	2	6	210396	210401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_004552	GAT	2	6	210412	210417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_004552	GCA	2	6	210487	210492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_004552	AGA	2	6	210558	210563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_004552	TTG	2	6	210678	210683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_004552	GTC	2	6	210898	210903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_004552	T	7	7	210953	210959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_004552	T	6	6	210986	210991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_004552	T	6	6	211713	211718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_004552	TTAG	2	8	215135	215142	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
532	NC_004552	TAA	2	6	215182	215187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_004552	T	7	7	215215	215221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_004552	AT	3	6	215260	215265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_004552	GA	3	6	215321	215326	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
536	NC_004552	GT	3	6	215361	215366	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
537	NC_004552	CT	3	6	215398	215403	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
538	NC_004552	T	6	6	215489	215494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_004552	T	6	6	215535	215540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_004552	A	6	6	215586	215591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_004552	AG	3	6	215625	215630	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
542	NC_004552	TC	3	6	215684	215689	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
543	NC_004552	TTG	2	6	217173	217178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_004552	ACA	2	6	217220	217225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_004552	GC	3	6	217241	217246	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
546	NC_004552	ATA	2	6	222707	222712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_004552	A	6	6	222712	222717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_004552	AAGA	2	8	222724	222731	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
549	NC_004552	ATGC	2	8	222786	222793	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
550	NC_004552	AGA	2	6	225687	225692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_004552	ATAAA	2	10	225693	225702	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_004552	T	8	8	225769	225776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_004552	G	6	6	225834	225839	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
554	NC_004552	C	6	6	226167	226172	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
555	NC_004552	AACA	2	8	226544	226551	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
556	NC_004552	ATTTT	2	10	226552	226561	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_004552	TTA	2	6	226562	226567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_004552	A	8	8	226600	226607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_004552	TAA	2	6	226625	226630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_004552	GAA	2	6	226644	226649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_004552	TAA	2	6	226661	226666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_004552	A	6	6	226704	226709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_004552	A	6	6	228089	228094	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_004552	T	6	6	228095	228100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_004552	AGA	2	6	228128	228133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_004552	TAT	2	6	228143	228148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_004552	CCTTAA	2	12	229039	229050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_004552	AAT	2	6	229051	229056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_004552	CCT	2	6	229526	229531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
570	NC_004552	AAT	2	6	229556	229561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_004552	T	8	8	229601	229608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_004552	ATC	2	6	231959	231964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_004552	GAA	2	6	231966	231971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_004552	ATTAA	2	10	232024	232033	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_004552	A	6	6	232032	232037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_004552	TA	4	8	232051	232058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_004552	T	7	7	232062	232068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_004552	T	6	6	232099	232104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_004552	TGG	2	6	232115	232120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
580	NC_004552	GCG	2	6	232130	232135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_004552	AG	3	6	236776	236781	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
582	NC_004552	AT	3	6	236846	236851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_004552	CCCT	2	8	236895	236902	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
584	NC_004552	CTA	2	6	236957	236962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_004552	CTTG	2	8	237952	237959	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
586	NC_004552	GAAT	2	8	238003	238010	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
587	NC_004552	GAA	3	9	238017	238025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_004552	T	6	6	238040	238045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_004552	AAG	2	6	238049	238054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_004552	T	7	7	238064	238070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_004552	AAG	2	6	238103	238108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
592	NC_004552	CAC	2	6	238121	238126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
593	NC_004552	GAT	2	6	238183	238188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_004552	TTTC	2	8	238242	238249	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
595	NC_004552	GTT	2	6	238270	238275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_004552	A	8	8	238310	238317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_004552	AAT	2	6	238336	238341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_004552	AGA	2	6	238352	238357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_004552	CT	3	6	238393	238398	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
600	NC_004552	AATTAT	2	12	239474	239485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_004552	TAAT	2	8	239498	239505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_004552	A	6	6	239511	239516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_004552	T	6	6	239937	239942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_004552	GTTT	2	8	240665	240672	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
605	NC_004552	TAC	2	6	240720	240725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_004552	GAG	2	6	240753	240758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
607	NC_004552	A	6	6	240825	240830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_004552	AG	3	6	240866	240871	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
609	NC_004552	TAT	2	6	240882	240887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_004552	ATA	2	6	240909	240914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_004552	TGT	2	6	242430	242435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_004552	T	6	6	243780	243785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_004552	TTGAAT	2	12	243787	243798	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
614	NC_004552	AGGA	2	8	243823	243830	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
615	NC_004552	T	6	6	243844	243849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_004552	GTTT	2	8	247464	247471	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
617	NC_004552	T	6	6	247481	247486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_004552	AAT	2	6	247575	247580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_004552	CAA	2	6	247590	247595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_004552	A	7	7	247604	247610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_004552	TCA	2	6	247612	247617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_004552	AAG	2	6	247619	247624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_004552	TACA	2	8	249516	249523	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
624	NC_004552	ATG	2	6	249953	249958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_004552	T	6	6	249993	249998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_004552	TGT	2	6	250034	250039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_004552	GAA	2	6	252052	252057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_004552	AGAA	2	8	252079	252086	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
629	NC_004552	T	8	8	252101	252108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_004552	TTG	2	6	252800	252805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_004552	TAGT	2	8	252820	252827	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
632	NC_004552	TAG	2	6	252875	252880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
633	NC_004552	T	7	7	252882	252888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_004552	T	7	7	252930	252936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_004552	T	6	6	252952	252957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_004552	A	6	6	252960	252965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_004552	TAT	2	6	255609	255614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_004552	TTG	2	6	255639	255644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
639	NC_004552	TTTAA	2	10	255651	255660	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_004552	AAGAT	2	10	255725	255734	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
641	NC_004552	GTAG	2	8	261373	261380	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
642	NC_004552	ATT	2	6	261489	261494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
643	NC_004552	A	6	6	261515	261520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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961	NC_004552	A	6	6	331249	331254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
962	NC_004552	GA	3	6	331294	331299	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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