MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni RM1221

Total Repeats: 249

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003912	TTTTA	2	10	6525	6534	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003912	TAAAA	2	10	6617	6626	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003912	AAAAT	2	10	17915	17924	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003912	AAAAT	2	10	21740	21749	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003912	GTTAA	2	10	21767	21776	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003912	TATAT	2	10	36864	36873	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003912	TATAT	2	10	36877	36886	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003912	CTTTT	2	10	37169	37178	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_003912	GGTAA	2	10	37649	37658	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003912	TCGTG	2	10	38445	38454	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_003912	TCTTT	2	10	39471	39480	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_003912	TAACT	2	10	39485	39494	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_003912	CCGTA	2	10	41478	41487	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_003912	AAGAA	2	10	42922	42931	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_003912	AGCTT	2	10	50936	50945	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_003912	AATAA	2	10	65498	65507	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003912	AAAAT	2	10	66554	66563	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003912	TTTAT	2	10	69108	69117	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_003912	TCTCT	2	10	75447	75456	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_003912	ATTTT	2	10	82217	82226	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003912	TAAGA	2	10	82633	82642	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003912	TTAAT	2	10	82942	82951	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_003912	TATTT	2	10	83010	83019	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_003912	TATAA	2	10	83027	83036	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003912	TTAAA	2	10	87771	87780	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_003912	AAGAT	2	10	93225	93234	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003912	TTAAA	2	10	95050	95059	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_003912	TTAAT	2	10	145311	145320	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003912	TATTT	2	10	150819	150828	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003912	TTTTA	2	10	164574	164583	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_003912	TATTT	2	10	177304	177313	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_003912	TAAAA	2	10	187496	187505	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_003912	AAAAT	2	10	191664	191673	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_003912	AAGTG	2	10	194549	194558	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_003912	AGGAT	2	10	195734	195743	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003912	TAAAA	2	10	197090	197099	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_003912	TAGAT	2	10	206756	206765	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_003912	AAAAT	2	10	210068	210077	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_003912	GCTTT	2	10	210085	210094	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_003912	TTTTG	2	10	234287	234296	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_003912	TAAAT	2	10	238191	238200	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003912	TTTTA	2	10	244133	244142	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_003912	AAAAT	2	10	244176	244185	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003912	ATTTT	2	10	244223	244232	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003912	AAAAT	2	10	259446	259455	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_003912	AAATT	2	10	261280	261289	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_003912	TCTTT	2	10	261324	261333	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_003912	ATTTT	2	10	262608	262617	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_003912	ATTAA	2	10	262781	262790	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_003912	TAAAT	2	10	263623	263632	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_003912	CATAA	2	10	269205	269214	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_003912	ATTAA	2	10	284977	284986	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_003912	TTAAT	2	10	286892	286901	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_003912	AAGCG	2	10	303965	303974	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_003912	AAGTA	2	10	304232	304241	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_003912	ATAAA	2	10	305254	305263	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_003912	TTAAA	2	10	337676	337685	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_003912	TAGAG	2	10	344323	344332	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_003912	TTTTA	2	10	358451	358460	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_003912	ATTAA	2	10	374524	374533	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_003912	ATTAA	2	10	377016	377025	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_003912	TTATT	2	10	425721	425730	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_003912	ATTTT	2	10	426571	426580	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_003912	CTTTT	2	10	431984	431993	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_003912	GGTAA	2	10	432464	432473	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_003912	TCGTG	2	10	433260	433269	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_003912	TCTTT	2	10	434286	434295	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_003912	TAACT	2	10	434300	434309	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_003912	CCGTA	2	10	436293	436302	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
70	NC_003912	AAGAA	2	10	437737	437746	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_003912	CTTAT	2	10	443353	443362	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_003912	TCAAA	2	10	450523	450532	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_003912	AAGGT	2	10	451519	451528	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_003912	CAAAT	2	10	452010	452019	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_003912	TTGGT	2	10	452215	452224	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_003912	ATAGA	2	10	452229	452238	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_003912	GATGG	2	10	452496	452505	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
78	NC_003912	AAGCA	2	10	455828	455837	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_003912	TAAAT	2	10	469167	469176	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_003912	TTGCT	2	10	472527	472536	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_003912	TGATT	2	10	488461	488470	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_003912	TTTAT	2	10	495285	495294	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_003912	GATTT	2	10	495808	495817	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_003912	AAAAT	2	10	501920	501929	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_003912	TTTTG	2	10	507904	507913	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_003912	AATTT	2	10	507948	507957	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_003912	TTTAT	2	10	513469	513478	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_003912	ACTAA	2	10	527956	527965	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_003912	AAATT	2	10	538694	538703	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_003912	TTTTA	2	10	543606	543615	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_003912	TTGTG	2	10	543825	543834	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_003912	CTTTT	2	10	543978	543987	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_003912	TTTTA	2	10	564087	564096	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_003912	AAAAT	2	10	588528	588537	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_003912	GTTTT	2	10	591603	591612	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_003912	AAATA	2	10	591912	591921	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_003912	CATTC	2	10	592629	592638	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
98	NC_003912	TTTTA	2	10	600919	600928	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_003912	AAAAT	2	10	600953	600962	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_003912	TGATA	2	10	601272	601281	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_003912	GAGTT	2	10	601629	601638	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_003912	ATGCA	2	10	601945	601954	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_003912	AATTA	2	10	603412	603421	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_003912	ATCAA	2	10	607582	607591	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_003912	GAAAT	2	10	608478	608487	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_003912	TTTGA	2	10	616500	616509	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_003912	ATTTG	2	10	617660	617669	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_003912	TAAAA	2	10	631522	631531	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_003912	AATAA	2	10	663907	663916	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_003912	GAAAA	2	10	675781	675790	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_003912	TTTGC	2	10	679303	679312	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_003912	TGATT	2	10	693956	693965	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_003912	AATTA	2	10	695336	695345	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_003912	ATGAT	2	10	696124	696133	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_003912	TTTAG	2	10	696285	696294	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_003912	TTTAA	2	10	704321	704330	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_003912	AGGAT	2	10	705922	705931	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
118	NC_003912	ATTTT	2	10	706247	706256	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_003912	AGAAA	2	10	706966	706975	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_003912	TTTTA	2	10	708067	708076	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_003912	TTTTA	2	10	711644	711653	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_003912	ATTTA	2	10	718611	718620	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_003912	TAAAA	3	15	734756	734770	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_003912	ATAAA	2	10	735579	735588	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_003912	TTTAA	2	10	744493	744502	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_003912	TAAAA	2	10	767568	767577	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_003912	AAAAT	2	10	767638	767647	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_003912	ATTTT	2	10	767659	767668	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_003912	ATTTT	2	10	767731	767740	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_003912	AAAAT	2	10	768819	768828	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_003912	AAATA	2	10	770005	770014	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_003912	CTTTT	2	10	774943	774952	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_003912	GGTAA	2	10	775423	775432	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_003912	TCGTG	2	10	776219	776228	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
135	NC_003912	TCTTT	2	10	777245	777254	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_003912	TAACT	2	10	777259	777268	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_003912	CCGTA	2	10	779252	779261	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
138	NC_003912	AAGAA	2	10	780696	780705	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_003912	TTAAT	2	10	781022	781031	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_003912	TTTAT	2	10	781213	781222	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_003912	GCAAA	2	10	781893	781902	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_003912	AATCA	2	10	782031	782040	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_003912	ATTTT	2	10	783588	783597	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_003912	AATAA	2	10	789695	789704	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_003912	ATTTA	2	10	792480	792489	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_003912	TTTTC	2	10	822843	822852	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_003912	TTTTA	2	10	888690	888699	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_003912	ATTCA	2	10	891698	891707	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_003912	TTTCA	2	10	893043	893052	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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152	NC_003912	AAAAT	2	10	932670	932679	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_003912	TTTAT	2	10	1269824	1269833	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_003912	ATTTA	2	10	1273868	1273877	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_003912	TATTT	2	10	1289849	1289858	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_003912	TTTAT	2	10	1289897	1289906	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.