MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Colwellia psychrerythraea 34H chromosome

Total Repeats: 259

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003910	TAAAAA	2	12	1462	1473	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003910	TCTACA	2	12	20766	20777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_003910	CTTGAA	2	12	20829	20840	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_003910	GTAACT	2	12	25389	25400	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_003910	ATTATA	2	12	56196	56207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003910	TAAAGT	2	12	56317	56328	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003910	ACTTTA	2	12	57674	57685	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_003910	TTTTCA	2	12	120825	120836	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_003910	CTTATC	2	12	129814	129825	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_003910	TAAAAT	2	12	129863	129874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003910	TTATAA	2	12	138607	138618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_003910	GAATAA	2	12	149881	149892	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_003910	AACAGT	2	12	189526	189537	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_003910	GTATTT	2	12	211361	211372	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_003910	TAAAAA	2	12	216520	216531	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_003910	TATTTT	2	12	253455	253466	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003910	TTTAGA	2	12	349580	349591	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003910	TTCCTC	2	12	367181	367192	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_003910	CTCGTC	2	12	367210	367221	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
20	NC_003910	TTTTTG	2	12	467063	467074	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003910	AAAAAT	2	12	469811	469822	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003910	ATTTGT	2	12	485208	485219	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_003910	GTTTTA	2	12	518535	518546	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_003910	TAAATT	2	12	520766	520777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003910	AAATAG	2	12	597170	597181	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_003910	AGAATA	2	12	666916	666927	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003910	AAAATC	2	12	692057	692068	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_003910	TTGTAA	2	12	698370	698381	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003910	TCATTA	2	12	698389	698400	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_003910	ATCAAT	2	12	700102	700113	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_003910	TAACTC	2	12	719858	719869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_003910	TTTATT	2	12	723752	723763	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_003910	AGGAAG	2	12	737963	737974	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_003910	ATTTTT	2	12	738309	738320	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_003910	ATGCTA	2	12	770015	770026	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_003910	AATAGT	2	12	770355	770366	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_003910	TCTCCT	2	12	784898	784909	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_003910	AAACCT	2	12	812395	812406	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_003910	CAAAAA	2	12	820122	820133	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_003910	ATGCAT	2	12	820710	820721	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_003910	ATTTTA	2	12	884256	884267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003910	TTTGTT	2	12	884708	884719	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_003910	TTCCTC	2	12	889018	889029	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_003910	CTCGTC	2	12	889047	889058	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
45	NC_003910	GTTTTT	2	12	936563	936574	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_003910	TATTTT	2	12	1022683	1022694	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_003910	TAAAGC	2	12	1068715	1068726	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_003910	ATAGTG	2	12	1073741	1073752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_003910	ATTAAA	2	12	1098480	1098491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_003910	GCTTAA	2	12	1105873	1105884	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_003910	TTAAAA	2	12	1116907	1116918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_003910	TGATTT	2	12	1128022	1128033	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_003910	GATAAT	2	12	1159570	1159581	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_003910	TCCGTA	2	12	1171795	1171806	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_003910	GAATCA	2	12	1189688	1189699	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_003910	GTTCAA	2	12	1198661	1198672	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_003910	AAATAA	2	12	1217936	1217947	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_003910	AAAATA	2	12	1230537	1230548	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_003910	AAACTT	2	12	1271577	1271588	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_003910	TTACTA	2	12	1292202	1292213	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_003910	CCTATA	6	36	1295149	1295184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_003910	GAAAGC	2	12	1301927	1301938	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_003910	TTTTTA	2	12	1328773	1328784	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_003910	ACTGTT	2	12	1329720	1329731	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_003910	AAAGTT	2	12	1332351	1332362	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_003910	GATCTT	2	12	1342346	1342357	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_003910	AGAAAA	2	12	1365270	1365281	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_003910	ACTAGC	2	12	1381153	1381164	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_003910	ATCATT	2	12	1385145	1385156	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_003910	AATAAC	2	12	1389208	1389219	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_003910	GTAAAT	2	12	1390837	1390848	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_003910	ATTATC	2	12	1430761	1430772	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_003910	CCATCC	2	12	1444198	1444209	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_003910	CAGTTT	2	12	1474414	1474425	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_003910	TTCTAC	2	12	1477330	1477341	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_003910	ATTTGC	2	12	1521034	1521045	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_003910	TTAACT	2	12	1529685	1529696	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_003910	TTTATA	2	12	1538413	1538424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_003910	AAAATG	2	12	1563146	1563157	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_003910	TAAATA	2	12	1566613	1566624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_003910	TTATTT	2	12	1590873	1590884	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_003910	ACTAAG	2	12	1623301	1623312	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_003910	AAACAA	2	12	1633118	1633129	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_003910	AAACAA	2	12	1633377	1633388	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_003910	TACTTT	2	12	1671377	1671388	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_003910	GAAGTG	2	12	1694232	1694243	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_003910	ATAAAA	2	12	1695207	1695218	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_003910	ACTTTT	2	12	1707638	1707649	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_003910	TTAGCG	2	12	1722803	1722814	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_003910	AAAAAT	2	12	1811410	1811421	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_003910	ACGAAT	2	12	1812811	1812822	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_003910	AAACAA	2	12	1814942	1814953	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_003910	ATTTTT	2	12	1859085	1859096	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_003910	CTAAAC	3	18	1861716	1861733	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_003910	TATCCG	2	12	1862084	1862095	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_003910	GTAAAT	2	12	1904985	1904996	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_003910	TTTTAT	2	12	1922044	1922055	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_003910	GTTTTT	2	12	1932160	1932171	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_003910	TAAATT	2	12	1959902	1959913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_003910	AGACTA	2	12	1986849	1986860	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_003910	ATGAAT	2	12	2025061	2025072	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_003910	TCAGTA	2	12	2061962	2061973	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_003910	TTTTTA	2	12	2081553	2081564	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_003910	AATAGT	2	12	2086549	2086560	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_003910	AATATA	2	12	2094502	2094513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_003910	TAAATA	2	12	2096039	2096050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_003910	TCTAAT	2	12	2175240	2175251	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_003910	AGAAAG	2	12	2182551	2182562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_003910	AGATAT	2	12	2190843	2190854	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_003910	TAGCGA	2	12	2224496	2224507	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_003910	GTTATT	2	12	2230409	2230420	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_003910	ACTGTT	2	12	2269447	2269458	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_003910	ATTTAC	2	12	2305750	2305761	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_003910	TTAAAA	2	12	2324096	2324107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_003910	TAAAAA	3	18	2366112	2366129	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_003910	ATTAAT	2	12	2372006	2372017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_003910	ATTTAT	2	12	2374701	2374712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_003910	CTATAG	2	12	2413941	2413952	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_003910	CTTGAA	2	12	2425654	2425665	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_003910	ATAAGT	2	12	2441632	2441643	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_003910	ATAATT	2	12	2522631	2522642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_003910	ATCTTG	2	12	2523016	2523027	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_003910	TTCAAG	2	12	2583611	2583622	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_003910	GAAAAA	2	12	2623935	2623946	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_003910	TAAGGT	2	12	2650003	2650014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_003910	TAAATA	2	12	2650516	2650527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_003910	AGCTCA	2	12	2669192	2669203	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_003910	AATTGT	2	12	2684309	2684320	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_003910	GCACAA	2	12	2692911	2692922	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_003910	AGCCTT	2	12	2700527	2700538	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_003910	CAAAAA	2	12	2705513	2705524	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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243	NC_003910	ATGAAA	2	12	5025675	5025686	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
244	NC_003910	TACAAA	2	12	5056285	5056296	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
245	NC_003910	ATTTTA	2	12	5059897	5059908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
246	NC_003910	TTATAG	2	12	5089646	5089657	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
247	NC_003910	CTATTT	2	12	5108038	5108049	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
248	NC_003910	AGTATT	4	24	5118471	5118494	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
249	NC_003910	AAGATG	2	12	5134355	5134366	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
250	NC_003910	TTAAAA	3	18	5174826	5174843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
251	NC_003910	AAACAA	2	12	5176189	5176200	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
252	NC_003910	TTCAAG	2	12	5211845	5211856	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
253	NC_003910	AATTTC	2	12	5232760	5232771	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
254	NC_003910	CATATC	2	12	5234111	5234122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
255	NC_003910	TAAGAA	2	12	5292567	5292578	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
256	NC_003910	ATAAAA	2	12	5314662	5314673	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
257	NC_003910	AAATAA	2	12	5319875	5319886	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_003910	TTTATT	2	12	5347633	5347644	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
259	NC_003910	ATTAAT	2	12	5354982	5354993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.