MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium perfringens str. 13 chromosome

Total Repeats: 16618

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_003366	ACA	2	6	328721	328726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2502	NC_003366	TAA	2	6	329106	329111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_003366	TTTATA	2	12	329355	329366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_003366	TATT	2	8	329374	329381	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_003366	ATT	2	6	329444	329449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_003366	AT	4	8	329483	329490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_003366	AAAAT	2	10	329495	329504	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_003366	GTT	2	6	329579	329584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_003366	ACT	2	6	329588	329593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2510	NC_003366	T	7	7	329593	329599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_003366	ACT	2	6	329622	329627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2512	NC_003366	ATG	2	6	329651	329656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_003366	AAG	2	6	330224	330229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2514	NC_003366	TGA	2	6	330243	330248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_003366	TAA	2	6	330269	330274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_003366	T	7	7	330294	330300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_003366	TAA	2	6	330435	330440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_003366	TAT	2	6	330492	330497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_003366	ATTTAA	2	12	330524	330535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_003366	AGA	2	6	330567	330572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_003366	AT	4	8	332380	332387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_003366	A	6	6	332408	332413	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_003366	TA	4	8	332449	332456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_003366	AAC	2	6	332458	332463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2525	NC_003366	AATA	2	8	332470	332477	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_003366	GT	3	6	332481	332486	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_003366	ATT	2	6	332504	332509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2528	NC_003366	ATT	2	6	332529	332534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_003366	ATT	2	6	332572	332577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2530	NC_003366	ATA	2	6	332582	332587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_003366	TAA	2	6	332660	332665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_003366	TTG	2	6	332694	332699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2533	NC_003366	A	6	6	333031	333036	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2534	NC_003366	TAA	2	6	334372	334377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2535	NC_003366	AT	3	6	334380	334385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_003366	ATTT	2	8	334396	334403	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_003366	TA	3	6	334438	334443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_003366	ATA	2	6	334459	334464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2539	NC_003366	GAT	2	6	334465	334470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2540	NC_003366	TAA	2	6	334482	334487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_003366	A	6	6	334486	334491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_003366	TA	3	6	334527	334532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_003366	TAG	2	6	334534	334539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_003366	AT	3	6	334547	334552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_003366	TTAA	2	8	334891	334898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_003366	TA	3	6	334960	334965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_003366	TA	3	6	335026	335031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_003366	AAT	2	6	335049	335054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_003366	CCT	2	6	335766	335771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2550	NC_003366	TA	3	6	335772	335777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_003366	AAAT	2	8	335779	335786	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_003366	TAA	2	6	335817	335822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_003366	TAA	2	6	335918	335923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_003366	ATT	2	6	335948	335953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_003366	ATTA	2	8	336022	336029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_003366	ATTA	2	8	336034	336041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_003366	A	6	6	336065	336070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_003366	T	7	7	338651	338657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_003366	T	6	6	338669	338674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_003366	TTTTA	2	10	338685	338694	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_003366	TA	3	6	338750	338755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_003366	AAT	3	9	338786	338794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_003366	AAT	2	6	338798	338803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_003366	TAT	2	6	338807	338812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2565	NC_003366	TCG	2	6	338850	338855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2566	NC_003366	GA	3	6	338858	338863	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_003366	CA	3	6	338864	338869	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2568	NC_003366	AAC	2	6	338870	338875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2569	NC_003366	ATAA	2	8	338884	338891	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2570	NC_003366	A	6	6	338901	338906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2571	NC_003366	GTT	2	6	338907	338912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2572	NC_003366	CGA	3	9	338958	338966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2574	NC_003366	GGC	2	6	339086	339091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2576	NC_003366	CAT	3	9	339239	339247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2581	NC_003366	GCA	2	6	339438	339443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2582	NC_003366	CGC	2	6	339445	339450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2583	NC_003366	GTGA	2	8	339451	339458	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2589	NC_003366	GAA	2	6	339733	339738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2590	NC_003366	CT	3	6	339757	339762	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2591	NC_003366	GCC	2	6	339876	339881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2593	NC_003366	GGT	2	6	340069	340074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2594	NC_003366	GTC	2	6	340083	340088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2595	NC_003366	TCGTG	2	10	340092	340101	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2596	NC_003366	GTTA	2	8	340142	340149	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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2600	NC_003366	AG	3	6	340271	340276	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_003366	AC	3	6	340414	340419	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2602	NC_003366	AGG	2	6	340473	340478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_003366	CAG	2	6	340479	340484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2604	NC_003366	CCT	2	6	340555	340560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2605	NC_003366	GAT	2	6	340590	340595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_003366	ATA	2	6	340608	340613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2607	NC_003366	GA	3	6	340629	340634	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2608	NC_003366	TAC	2	6	340650	340655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2609	NC_003366	A	6	6	340656	340661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_003366	ATA	2	6	340692	340697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2613	NC_003366	CCA	2	6	340877	340882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2614	NC_003366	TAAT	2	8	340904	340911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2618	NC_003366	TAG	2	6	341220	341225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2619	NC_003366	GCGA	2	8	341228	341235	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2620	NC_003366	ACATA	2	10	341279	341288	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2621	NC_003366	ACC	2	6	341427	341432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2622	NC_003366	TAC	2	6	341446	341451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2623	NC_003366	TGA	2	6	341453	341458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2624	NC_003366	GGGAG	2	10	341503	341512	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
2625	NC_003366	TGA	2	6	341567	341572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2626	NC_003366	GGA	2	6	341742	341747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2628	NC_003366	AGT	2	6	341866	341871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2631	NC_003366	CATT	2	8	342091	342098	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2632	NC_003366	GA	3	6	342126	342131	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2633	NC_003366	ACC	2	6	342164	342169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2634	NC_003366	CGT	2	6	342209	342214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2635	NC_003366	TTA	2	6	342427	342432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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