MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydophila caviae GPIC chromosome

Total Repeats: 284

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003361	TA	3	6	1	6	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003361	AT	3	6	6734	6739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003361	TG	3	6	6795	6800	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003361	AG	3	6	17613	17618	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003361	AT	3	6	31816	31821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003361	AG	3	6	33189	33194	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003361	AT	3	6	43305	43310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003361	TA	3	6	52083	52088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_003361	CT	3	6	54620	54625	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_003361	AG	3	6	54651	54656	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003361	TG	3	6	63123	63128	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_003361	TA	3	6	77181	77186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_003361	TA	3	6	77214	77219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003361	GA	3	6	96742	96747	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_003361	AG	3	6	98527	98532	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_003361	TG	3	6	98905	98910	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003361	TC	3	6	107840	107845	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_003361	GT	4	8	111929	111936	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_003361	TA	4	8	123703	123710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003361	AC	3	6	123731	123736	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_003361	TA	3	6	124967	124972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003361	AC	3	6	128196	128201	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_003361	AT	3	6	129812	129817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_003361	TC	3	6	130084	130089	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_003361	CT	3	6	130193	130198	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_003361	CT	3	6	130325	130330	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_003361	GA	3	6	133913	133918	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_003361	GT	3	6	142653	142658	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003361	GC	3	6	147289	147294	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_003361	CG	3	6	147319	147324	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_003361	AG	3	6	157017	157022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_003361	TA	3	6	169902	169907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_003361	TC	3	6	169997	170002	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_003361	CT	3	6	170379	170384	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_003361	AG	3	6	170413	170418	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003361	AT	3	6	184828	184833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_003361	AT	3	6	184894	184899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_003361	AG	3	6	195505	195510	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_003361	AC	3	6	198156	198161	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_003361	GT	3	6	214503	214508	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_003361	CT	4	8	214538	214545	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_003361	CT	3	6	214823	214828	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_003361	GT	3	6	214838	214843	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003361	CT	3	6	228213	228218	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_003361	AG	4	8	235961	235968	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_003361	GA	3	6	237555	237560	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_003361	GA	3	6	254935	254940	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_003361	CT	3	6	260733	260738	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_003361	AT	3	6	276034	276039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_003361	TA	3	6	280167	280172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_003361	TA	3	6	281098	281103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_003361	CT	3	6	290659	290664	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_003361	TC	3	6	305987	305992	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_003361	GA	4	8	306332	306339	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003361	TC	3	6	306364	306369	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_003361	AG	4	8	329452	329459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_003361	GT	3	6	329975	329980	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_003361	AG	3	6	330313	330318	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_003361	AG	3	6	330764	330769	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_003361	AG	3	6	331127	331132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_003361	TC	3	6	331194	331199	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_003361	GC	3	6	331542	331547	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_003361	TA	3	6	331906	331911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_003361	AT	3	6	333012	333017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_003361	CT	3	6	333328	333333	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_003361	AG	3	6	333951	333956	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_003361	TC	3	6	335340	335345	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_003361	GA	3	6	335557	335562	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_003361	TA	3	6	335669	335674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_003361	TA	3	6	344171	344176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_003361	GA	3	6	344213	344218	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_003361	CT	3	6	348948	348953	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_003361	TA	3	6	349025	349030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_003361	TA	3	6	350312	350317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_003361	GT	3	6	350358	350363	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_003361	AG	3	6	373263	373268	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_003361	TA	3	6	378987	378992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_003361	GA	3	6	379525	379530	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_003361	TC	3	6	380138	380143	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_003361	AG	3	6	380348	380353	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_003361	CA	3	6	384992	384997	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_003361	AT	3	6	385075	385080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_003361	AT	3	6	385156	385161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_003361	AG	4	8	387499	387506	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_003361	AG	3	6	388114	388119	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_003361	GT	3	6	389833	389838	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_003361	AG	3	6	390502	390507	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_003361	CA	3	6	391699	391704	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_003361	AG	3	6	403750	403755	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_003361	AG	3	6	411009	411014	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_003361	CT	3	6	411020	411025	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_003361	AG	3	6	418715	418720	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_003361	TC	3	6	422095	422100	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_003361	AG	3	6	425749	425754	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_003361	TA	3	6	425988	425993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_003361	TG	3	6	444105	444110	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_003361	TA	3	6	448172	448177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_003361	AG	3	6	450227	450232	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_003361	TC	3	6	456070	456075	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_003361	GA	3	6	456095	456100	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_003361	GT	3	6	461196	461201	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_003361	GA	3	6	465717	465722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_003361	AG	3	6	465974	465979	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_003361	CT	3	6	465980	465985	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_003361	AT	3	6	465993	465998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_003361	AG	3	6	470908	470913	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_003361	TA	3	6	477658	477663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_003361	AG	3	6	477762	477767	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_003361	TA	3	6	478994	478999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_003361	AT	3	6	480267	480272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_003361	AG	3	6	481627	481632	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_003361	AT	4	8	482285	482292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_003361	AG	4	8	490166	490173	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_003361	TA	3	6	490280	490285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_003361	CT	3	6	493562	493567	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_003361	CT	3	6	494547	494552	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_003361	AT	3	6	514287	514292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_003361	AT	3	6	514325	514330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_003361	AG	3	6	521029	521034	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_003361	AT	3	6	535568	535573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_003361	GA	3	6	540001	540006	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_003361	GA	3	6	543580	543585	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_003361	GA	3	6	543691	543696	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_003361	AT	3	6	543940	543945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_003361	AT	3	6	544536	544541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_003361	CT	3	6	546248	546253	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_003361	GA	3	6	555998	556003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_003361	AT	3	6	557295	557300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_003361	AT	3	6	561416	561421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_003361	GT	3	6	565268	565273	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_003361	TG	3	6	566751	566756	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_003361	AG	3	6	585410	585415	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_003361	CT	3	6	585508	585513	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_003361	AG	4	8	586875	586882	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_003361	GA	3	6	587315	587320	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_003361	AC	3	6	587633	587638	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_003361	GA	3	6	590125	590130	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_003361	TG	3	6	590231	590236	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_003361	TA	3	6	590448	590453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_003361	GT	3	6	602160	602165	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_003361	TC	3	6	605185	605190	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_003361	AT	3	6	605280	605285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_003361	CT	3	6	610858	610863	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_003361	AG	3	6	622484	622489	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_003361	CT	3	6	623858	623863	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_003361	GA	3	6	623873	623878	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_003361	AG	3	6	624043	624048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_003361	AC	3	6	628977	628982	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_003361	TA	3	6	630783	630788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_003361	GA	3	6	644046	644051	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_003361	GA	3	6	644574	644579	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_003361	AT	3	6	644739	644744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_003361	AT	3	6	654920	654925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.