MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydophila caviae GPIC chromosome

Total Repeats: 2987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_003361	GTT	2	6	373442	373447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_003361	TGC	2	6	374166	374171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_003361	AACT	2	8	374193	374200	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1004	NC_003361	TGT	2	6	374270	374275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_003361	ATT	2	6	374292	374297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_003361	GTG	2	6	374509	374514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_003361	GAG	2	6	375725	375730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_003361	CAAT	2	8	378828	378835	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1009	NC_003361	T	7	7	378903	378909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_003361	TTC	3	9	378915	378923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_003361	TGATC	2	10	378971	378980	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1012	NC_003361	TA	3	6	378987	378992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_003361	AGG	2	6	379045	379050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_003361	TGT	2	6	379058	379063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_003361	T	6	6	379063	379068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_003361	A	6	6	379085	379090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_003361	AGA	2	6	379170	379175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_003361	GAA	2	6	379228	379233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_003361	AAAG	2	8	379236	379243	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_003361	AAC	2	6	379257	379262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_003361	GAT	2	6	379268	379273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_003361	AAG	2	6	379323	379328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_003361	CAG	2	6	379333	379338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_003361	GAA	2	6	379385	379390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_003361	TTCC	2	8	379427	379434	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1026	NC_003361	GAA	2	6	379442	379447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_003361	GAA	2	6	379466	379471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_003361	A	6	6	379494	379499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_003361	GA	3	6	379525	379530	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_003361	GAA	2	6	379590	379595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_003361	ATTTT	2	10	379702	379711	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_003361	T	6	6	379813	379818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_003361	AGG	2	6	379846	379851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_003361	GAA	2	6	379879	379884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_003361	GAT	2	6	379909	379914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_003361	T	6	6	379958	379963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_003361	AAT	2	6	379986	379991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_003361	CGT	2	6	380010	380015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1040	NC_003361	TC	3	6	380138	380143	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1041	NC_003361	GAT	2	6	380170	380175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1043	NC_003361	TGT	2	6	380248	380253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_003361	TGT	3	9	380257	380265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_003361	AG	3	6	380348	380353	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_003361	TGT	3	9	380371	380379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_003361	GAG	2	6	384923	384928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_003361	T	7	7	384929	384935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_003361	TTA	2	6	384957	384962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_003361	CA	3	6	384992	384997	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1051	NC_003361	AT	3	6	385075	385080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_003361	ATT	2	6	385140	385145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_003361	AT	3	6	385156	385161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_003361	TTAA	2	8	385189	385196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1056	NC_003361	AGTA	2	8	388028	388035	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_003361	TAT	2	6	388039	388044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_003361	GAAA	2	8	388078	388085	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_003361	AG	3	6	388114	388119	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_003361	TTG	2	6	388183	388188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_003361	CTT	2	6	388667	388672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_003361	T	6	6	388716	388721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_003361	TTTA	2	8	388726	388733	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_003361	A	7	7	388782	388788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_003361	GAG	2	6	388794	388799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1067	NC_003361	TAA	2	6	388873	388878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_003361	CCT	2	6	388902	388907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_003361	AGA	2	6	388928	388933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_003361	AAG	2	6	388936	388941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_003361	TTCA	2	8	388962	388969	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1072	NC_003361	G	6	6	388983	388988	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_003361	CTT	2	6	389500	389505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_003361	T	6	6	389549	389554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_003361	TTTA	2	8	389558	389565	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_003361	GTTT	2	8	389573	389580	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_003361	A	6	6	389597	389602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_003361	AAGGA	2	10	389690	389699	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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1082	NC_003361	T	6	6	390356	390361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_003361	TTTA	2	8	390365	390372	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_003361	AGAT	2	8	390373	390380	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1089	NC_003361	TCA	2	6	390670	390675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1091	NC_003361	CAG	2	6	391672	391677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1093	NC_003361	CA	3	6	391699	391704	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1094	NC_003361	GTT	2	6	391705	391710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_003361	T	7	7	394557	394563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_003361	TTATG	2	10	395144	395153	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1098	NC_003361	GTA	2	6	397009	397014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_003361	TGA	2	6	397146	397151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_003361	TAA	2	6	397821	397826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_003361	TTTAA	2	10	397828	397837	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_003361	ATT	2	6	398804	398809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_003361	A	6	6	400490	400495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_003361	TTG	2	6	400502	400507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_003361	TGG	2	6	400511	400516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_003361	T	9	9	401866	401874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_003361	TTG	2	6	401904	401909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_003361	ATTA	3	12	401928	401939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_003361	TATT	2	8	401973	401980	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_003361	AG	3	6	403750	403755	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_003361	T	6	6	405028	405033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_003361	ATG	2	6	408696	408701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_003361	GAA	2	6	408735	408740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_003361	T	7	7	408745	408751	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_003361	TCC	3	9	408770	408778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1116	NC_003361	T	6	6	408799	408804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_003361	C	6	6	408830	408835	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1118	NC_003361	AG	3	6	411009	411014	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_003361	CT	3	6	411020	411025	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1120	NC_003361	CTT	2	6	411045	411050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_003361	T	6	6	411053	411058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_003361	T	6	6	411081	411086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_003361	A	7	7	413537	413543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_003361	T	6	6	413561	413566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_003361	T	9	9	413582	413590	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_003361	ATTG	2	8	418246	418253	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_003361	T	7	7	418298	418304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_003361	CAT	2	6	418471	418476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_003361	TTTG	2	8	418492	418499	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_003361	TTCC	2	8	418504	418511	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1131	NC_003361	T	6	6	418569	418574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_003361	GAC	2	6	418588	418593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_003361	T	6	6	418627	418632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_003361	AG	3	6	418715	418720	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_003361	TCTA	2	8	418769	418776	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1136	NC_003361	ATA	2	6	422015	422020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_003361	ATT	2	6	422048	422053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_003361	TC	3	6	422095	422100	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1423	NC_003361	A	6	6	535561	535566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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