MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium perfringens str. 13 plasmid pCP13

Total Repeats: 18

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003042	TTTTA	2	10	602	611	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003042	CAAAT	2	10	4847	4856	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_003042	TACAT	2	10	8367	8376	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_003042	TAATT	2	10	10395	10404	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003042	TTTAT	2	10	11146	11155	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003042	AATTG	2	10	13617	13626	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003042	TTAAT	2	10	15469	15478	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003042	TTTTA	2	10	15682	15691	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_003042	TTTAT	2	10	15786	15795	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003042	AGAAT	2	10	18463	18472	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003042	ATATA	2	10	18532	18541	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_003042	AAAAT	2	10	20563	20572	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_003042	ATTTA	2	10	20629	20638	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003042	CTTTC	2	10	24553	24562	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_003042	TTTAA	2	10	27480	27489	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_003042	TAAAA	2	10	43620	43629	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003042	TTCTT	2	10	44323	44332	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_003042	AAATT	2	10	51083	51092	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.