MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium diphtheriae NCTC 13129 chromosome

Total Repeats: 226

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002935	AGCGA	2	10	2150	2159	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_002935	TGTGA	2	10	19432	19441	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002935	GTTTG	2	10	27170	27179	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002935	ACACC	2	10	42707	42716	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
5	NC_002935	GACCC	2	10	61854	61863	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6	NC_002935	GAAAT	2	10	62800	62809	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_002935	TTGTT	2	10	72814	72823	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_002935	AAAGG	2	10	73137	73146	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_002935	CAAGC	2	10	73230	73239	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_002935	GCCTA	2	10	87976	87985	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_002935	CCGCA	2	10	100533	100542	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
12	NC_002935	AGCCA	2	10	100890	100899	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_002935	TGCAC	2	10	115456	115465	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_002935	TCGAA	2	10	119265	119274	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_002935	GATCT	2	10	119526	119535	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_002935	GAGGC	2	10	120981	120990	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
17	NC_002935	CTGTT	2	10	121126	121135	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_002935	TTAGC	2	10	141537	141546	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_002935	GCCAA	2	10	195937	195946	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_002935	TTGGG	2	10	233838	233847	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
21	NC_002935	AGCCA	2	10	234146	234155	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_002935	CACGA	2	10	274013	274022	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_002935	ATAAC	2	10	276177	276186	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_002935	GAAAA	2	10	299440	299449	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_002935	GCTTC	2	10	308131	308140	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_002935	CCAGT	2	10	308299	308308	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_002935	GATTT	2	10	308437	308446	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_002935	TTTGG	2	10	308755	308764	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_002935	ATGTT	2	10	308839	308848	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_002935	GTCTG	2	10	313219	313228	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_002935	TCGCT	2	10	315834	315843	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
32	NC_002935	TCCTT	2	10	333045	333054	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
33	NC_002935	TGATG	2	10	334630	334639	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_002935	CCAGA	2	10	346444	346453	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_002935	TTGCC	2	10	346621	346630	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_002935	CAGGC	2	10	347087	347096	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
37	NC_002935	GTGCT	2	10	394753	394762	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_002935	CACAC	2	10	397235	397244	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
39	NC_002935	CTTCG	2	10	422162	422171	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
40	NC_002935	GCAAG	2	10	422925	422934	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_002935	ATGAG	2	10	423614	423623	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_002935	TCTGC	2	10	428281	428290	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
43	NC_002935	GGGGT	2	10	451769	451778	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002935	TATAA	2	10	459807	459816	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002935	TGATG	2	10	478347	478356	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_002935	TTTCC	2	10	485886	485895	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
47	NC_002935	CGCTA	2	10	512713	512722	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
48	NC_002935	AGGAA	2	10	517396	517405	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_002935	TGATG	2	10	577977	577986	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_002935	TTTTG	2	10	589599	589608	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_002935	GCCTT	2	10	597832	597841	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_002935	GTTTT	2	10	605572	605581	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002935	CTTTC	2	10	614400	614409	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
54	NC_002935	TGAGC	2	10	625709	625718	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_002935	TTTTG	2	10	632823	632832	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_002935	ACCTC	2	10	633298	633307	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
57	NC_002935	GAGGT	2	10	633316	633325	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
58	NC_002935	TTTTG	2	10	635318	635327	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_002935	GGGAA	2	10	678588	678597	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
60	NC_002935	TTTTG	2	10	727538	727547	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002935	TTGGT	2	10	741977	741986	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_002935	TGGGG	2	10	743051	743060	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
63	NC_002935	TCGTG	2	10	744398	744407	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_002935	CGTCA	2	10	744734	744743	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_002935	TGTTT	2	10	744910	744919	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_002935	GGGAG	2	10	745807	745816	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
67	NC_002935	TGGCA	2	10	748420	748429	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_002935	GGGGT	2	10	748773	748782	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
69	NC_002935	ATGCG	2	10	755649	755658	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_002935	GTTCG	2	10	779565	779574	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_002935	CCGGG	2	10	792050	792059	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
72	NC_002935	TAGTG	2	10	799312	799321	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_002935	CCTGT	2	10	809591	809600	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
74	NC_002935	CTTTC	2	10	824336	824345	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
75	NC_002935	TGCTG	2	10	848799	848808	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_002935	TTTCC	2	10	862561	862570	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
77	NC_002935	GGAGG	2	10	864572	864581	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
78	NC_002935	GAAAG	2	10	896907	896916	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_002935	GGAGT	2	10	903351	903360	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
80	NC_002935	TGCGG	2	10	979274	979283	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
81	NC_002935	GAGAA	2	10	1025413	1025422	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_002935	TGGCT	2	10	1043451	1043460	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
83	NC_002935	GCACT	2	10	1061523	1061532	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
84	NC_002935	GCCTC	2	10	1085668	1085677	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
85	NC_002935	TGTGC	2	10	1094212	1094221	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_002935	AACCT	2	10	1106269	1106278	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
87	NC_002935	GATTC	2	10	1111978	1111987	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_002935	CACTA	2	10	1120166	1120175	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_002935	ACACT	2	10	1142136	1142145	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
90	NC_002935	ATCCC	2	10	1149202	1149211	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
91	NC_002935	CTTGG	2	10	1155474	1155483	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_002935	CATTT	2	10	1164762	1164771	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_002935	TCGTG	2	10	1171358	1171367	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_002935	CGTCA	2	10	1171694	1171703	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
95	NC_002935	TGTTT	2	10	1171870	1171879	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_002935	GGGAG	2	10	1172767	1172776	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
97	NC_002935	TGGCA	2	10	1175380	1175389	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
98	NC_002935	TTTTC	2	10	1175583	1175592	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_002935	AGGGA	2	10	1187495	1187504	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
100	NC_002935	CCTAC	2	10	1228616	1228625	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
101	NC_002935	CTTAC	2	10	1252547	1252556	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
102	NC_002935	TCATC	2	10	1270931	1270940	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
103	NC_002935	GCAAC	2	10	1275663	1275672	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
104	NC_002935	TCAAG	2	10	1290131	1290140	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_002935	AAAAG	2	10	1298731	1298740	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_002935	GCCAT	2	10	1311336	1311345	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
107	NC_002935	ACCGT	2	10	1311437	1311446	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
108	NC_002935	CGACG	2	10	1332526	1332535	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
109	NC_002935	CAAAT	2	10	1335521	1335530	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_002935	AAAAT	2	10	1360103	1360112	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_002935	TCATT	2	10	1373486	1373495	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_002935	AAACA	2	10	1395351	1395360	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_002935	TTTAT	2	10	1396348	1396357	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_002935	AGCAA	2	10	1409517	1409526	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_002935	GAACG	2	10	1409625	1409634	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_002935	TCTCT	2	10	1409716	1409725	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
117	NC_002935	TGTTT	2	10	1422745	1422754	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_002935	GCATT	2	10	1425455	1425464	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_002935	AGAAT	2	10	1454458	1454467	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_002935	AGTGG	2	10	1464079	1464088	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
121	NC_002935	AATTG	2	10	1464143	1464152	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_002935	GCGCC	2	10	1464166	1464175	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
123	NC_002935	CAGTA	2	10	1471411	1471420	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_002935	CAAAA	2	10	1475952	1475961	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_002935	ACAGC	2	10	1511616	1511625	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
126	NC_002935	AAGTT	2	10	1532816	1532825	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_002935	AAACC	2	10	1543016	1543025	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
128	NC_002935	TAACC	2	10	1545580	1545589	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
129	NC_002935	GCAGC	2	10	1555599	1555608	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
130	NC_002935	AGACA	2	10	1564353	1564362	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_002935	AGCAC	2	10	1600215	1600224	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
132	NC_002935	CTTTA	2	10	1625326	1625335	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_002935	ACCAA	2	10	1640813	1640822	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
134	NC_002935	TTTAT	2	10	1672547	1672556	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_002935	CGTTT	2	10	1675100	1675109	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_002935	AGCAC	2	10	1681839	1681848	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
137	NC_002935	CCGTT	2	10	1681925	1681934	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
138	NC_002935	ACAAG	2	10	1683554	1683563	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_002935	TTTCA	2	10	1694142	1694151	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_002935	GAGTT	2	10	1695251	1695260	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
141	NC_002935	TTAGG	2	10	1704718	1704727	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
142	NC_002935	ATCAC	2	10	1713927	1713936	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
143	NC_002935	AGAAA	2	10	1722606	1722615	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_002935	TTCAA	2	10	1747687	1747696	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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185	NC_002935	GGCTC	2	10	2134829	2134838	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
186	NC_002935	TGGCG	2	10	2137616	2137625	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
187	NC_002935	TAATC	2	10	2139132	2139141	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
188	NC_002935	GCGCT	2	10	2140001	2140010	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
189	NC_002935	CTGCC	2	10	2140220	2140229	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
190	NC_002935	CTAGA	2	10	2166698	2166707	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
191	NC_002935	CAGCA	2	10	2172847	2172856	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
192	NC_002935	GAACC	2	10	2182120	2182129	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
193	NC_002935	TGTGG	2	10	2182252	2182261	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
194	NC_002935	TGCCA	2	10	2184843	2184852	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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198	NC_002935	CACGA	2	10	2188864	2188873	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
199	NC_002935	GTGCA	2	10	2206098	2206107	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.