MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium diphtheriae NCTC 13129 chromosome

Total Repeats: 741

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002935	ATCA	2	8	2289	2296	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_002935	CAGG	2	8	14715	14722	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_002935	CCGG	2	8	15003	15010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_002935	CCAG	2	8	20305	20312	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_002935	TAAC	2	8	25771	25778	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_002935	ATAA	2	8	26574	26581	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_002935	AGAT	2	8	27196	27203	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_002935	AGTG	2	8	27452	27459	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_002935	GAAG	2	8	27542	27549	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_002935	TAAT	2	8	34296	34303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_002935	GGGT	2	8	34305	34312	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
12	NC_002935	TTAA	2	8	34365	34372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002935	AAGG	2	8	40579	40586	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_002935	ACCC	2	8	42658	42665	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
15	NC_002935	CTTG	2	8	53341	53348	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_002935	CAAC	2	8	61230	61237	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_002935	TTCT	2	8	61653	61660	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_002935	CGCA	2	8	62160	62167	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_002935	CCGA	2	8	62409	62416	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_002935	CCTG	2	8	66088	66095	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_002935	TGGG	2	8	66153	66160	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
22	NC_002935	TAGT	2	8	71140	71147	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_002935	GAGG	2	8	71305	71312	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002935	TAAT	2	8	78152	78159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_002935	GGTG	2	8	82185	82192	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
26	NC_002935	ATTG	2	8	87803	87810	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_002935	CCAT	2	8	100468	100475	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_002935	TAGC	2	8	116442	116449	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_002935	ATGT	2	8	117917	117924	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_002935	CCGG	2	8	119132	119139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_002935	GACC	2	8	119475	119482	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_002935	CGGT	2	8	119814	119821	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_002935	AACA	2	8	137678	137685	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_002935	ATTT	2	8	140470	140477	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_002935	ACTA	2	8	148092	148099	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_002935	GGGT	2	8	152190	152197	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
37	NC_002935	CTTG	2	8	156888	156895	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_002935	GAGC	2	8	160042	160049	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_002935	GAAA	2	8	160462	160469	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002935	AGGG	2	8	166349	166356	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
41	NC_002935	ACGG	2	8	166384	166391	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_002935	GGGT	2	8	166397	166404	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
43	NC_002935	AGCA	2	8	166522	166529	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_002935	ATCA	2	8	167504	167511	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_002935	AAGC	2	8	167612	167619	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_002935	AATC	2	8	167684	167691	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_002935	AGGA	2	8	168422	168429	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_002935	TAGC	2	8	188863	188870	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_002935	GCGG	2	8	195872	195879	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
50	NC_002935	TCGT	2	8	195989	195996	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_002935	GCTC	2	8	198356	198363	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_002935	CAGG	2	8	205293	205300	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_002935	GCAA	2	8	205516	205523	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_002935	GCCC	2	8	206573	206580	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
55	NC_002935	CTTG	2	8	207095	207102	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_002935	TTGA	2	8	210393	210400	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_002935	GAAA	2	8	210607	210614	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_002935	GTAG	2	8	213979	213986	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_002935	ATTG	2	8	214141	214148	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_002935	TTGG	2	8	214206	214213	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002935	TGGC	2	8	214217	214224	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_002935	ATTG	2	8	214368	214375	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_002935	ATGC	2	8	216832	216839	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_002935	ACAT	2	8	216844	216851	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_002935	AGGC	2	8	233059	233066	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_002935	CGGG	2	8	233442	233449	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
67	NC_002935	CATT	2	8	233801	233808	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_002935	TGGA	2	8	233870	233877	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_002935	GCCA	2	8	234133	234140	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_002935	CGAG	2	8	234328	234335	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_002935	CCAC	2	8	236431	236438	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
72	NC_002935	AAGA	2	8	242487	242494	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_002935	GAAA	2	8	245995	246002	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_002935	ACCA	2	8	254435	254442	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_002935	ATCC	2	8	271847	271854	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_002935	AGCG	2	8	271892	271899	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_002935	ACCC	2	8	278447	278454	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
78	NC_002935	GCCC	2	8	278546	278553	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
79	NC_002935	TTTG	2	8	285445	285452	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_002935	GCTA	2	8	285869	285876	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_002935	ATTG	2	8	285898	285905	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_002935	GTAC	2	8	293322	293329	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_002935	CTAA	2	8	302512	302519	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_002935	CATG	2	8	305656	305663	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_002935	GACA	2	8	305680	305687	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_002935	TCAT	2	8	305991	305998	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_002935	CTGC	2	8	306888	306895	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_002935	TGCT	2	8	307384	307391	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_002935	CTGC	2	8	308100	308107	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_002935	GTCT	2	8	308185	308192	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_002935	CAGA	2	8	308346	308353	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_002935	TGAT	2	8	308708	308715	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_002935	GACT	2	8	313076	313083	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_002935	CTAC	2	8	313167	313174	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_002935	GCTA	2	8	313689	313696	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_002935	GGTA	2	8	315253	315260	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_002935	ATGA	2	8	315346	315353	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_002935	GTTG	2	8	315383	315390	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_002935	CTTG	2	8	315392	315399	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_002935	ACTA	2	8	315587	315594	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_002935	GTCC	2	8	315881	315888	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_002935	TCAA	2	8	328651	328658	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_002935	TAGG	2	8	338062	338069	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_002935	CAGG	2	8	346046	346053	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_002935	CAGA	2	8	347632	347639	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_002935	AGAA	2	8	347755	347762	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_002935	CCTT	2	8	348478	348485	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_002935	TGAT	2	8	350112	350119	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_002935	TTGG	2	8	355167	355174	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_002935	TGCG	2	8	360101	360108	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_002935	CTTT	2	8	361698	361705	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_002935	CGTG	2	8	361873	361880	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_002935	ATCA	2	8	364742	364749	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_002935	AGCG	2	8	364779	364786	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_002935	ATGT	2	8	393660	393667	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_002935	AGGA	2	8	399711	399718	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_002935	CTTC	2	8	420019	420026	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_002935	GGTT	2	8	420057	420064	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_002935	ACTG	2	8	420983	420990	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_002935	TAAA	2	8	421365	421372	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_002935	ATTC	2	8	421815	421822	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_002935	CAAT	2	8	421989	421996	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_002935	GCAG	2	8	422274	422281	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_002935	GCCG	2	8	422466	422473	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_002935	CTGG	2	8	422554	422561	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_002935	AATC	2	8	422856	422863	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_002935	GTCG	2	8	423313	423320	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_002935	CAAT	2	8	424598	424605	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_002935	TGCG	2	8	424760	424767	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_002935	GTTG	2	8	427730	427737	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_002935	CATC	2	8	427741	427748	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_002935	GCCG	2	8	440225	440232	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_002935	ACTA	2	8	442261	442268	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_002935	GATT	2	8	448034	448041	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_002935	TCGT	2	8	451862	451869	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_002935	ATGC	2	8	453364	453371	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_002935	AATT	2	8	453454	453461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_002935	TAAA	2	8	453537	453544	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_002935	CGCT	2	8	453697	453704	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_002935	GATG	2	8	459870	459877	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_002935	TGAG	2	8	463496	463503	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_002935	CCTG	2	8	477897	477904	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_002935	ATTT	2	8	478164	478171	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_002935	AGGC	2	8	479087	479094	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_002935	TTAA	2	8	492675	492682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_002935	AGTT	2	8	493931	493938	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_002935	CTTT	2	8	494014	494021	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_002935	GGTT	2	8	497027	497034	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_002935	AGGA	2	8	503662	503669	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_002935	GTGG	2	8	509516	509523	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
151	NC_002935	GGGT	2	8	509594	509601	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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496	NC_002935	TGGG	2	8	1709423	1709430	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
497	NC_002935	TTCT	2	8	1711301	1711308	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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500	NC_002935	AATG	2	8	1713185	1713192	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

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