MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Corynebacterium diphtheriae NCTC 13129 chromosome

Total Repeats: 5757

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002935	ACA	2	6	1735	1740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_002935	GT	3	6	1805	1810	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002935	GCC	2	6	2020	2025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_002935	AGCGA	2	10	2150	2159	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_002935	AAG	2	6	2241	2246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_002935	CTC	3	9	2263	2271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_002935	ATCA	2	8	2289	2296	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_002935	GAG	2	6	2301	2306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_002935	CT	3	6	3509	3514	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_002935	CGC	2	6	7461	7466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_002935	TTC	2	6	8108	8113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_002935	ACA	2	6	8176	8181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_002935	TCA	2	6	11742	11747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_002935	GCA	2	6	11753	11758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_002935	TAT	2	6	11774	11779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_002935	CCA	2	6	11889	11894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_002935	T	6	6	12009	12014	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_002935	CCT	2	6	12035	12040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_002935	CG	3	6	12081	12086	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_002935	TAATCC	2	12	12958	12969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_002935	CAGG	2	8	14715	14722	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_002935	TGA	2	6	14824	14829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_002935	AAT	2	6	14861	14866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002935	A	7	7	14889	14895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_002935	GT	3	6	14992	14997	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_002935	CCGG	2	8	15003	15010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_002935	GCA	2	6	15147	15152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_002935	CCA	2	6	19139	19144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_002935	T	6	6	19259	19264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_002935	TG	3	6	19268	19273	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002935	CCT	2	6	19284	19289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_002935	GGA	2	6	19378	19383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_002935	CAA	2	6	19397	19402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_002935	TGTGA	2	10	19432	19441	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_002935	CTG	2	6	19810	19815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_002935	GAG	2	6	20033	20038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_002935	TGC	2	6	20039	20044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_002935	ACC	2	6	20058	20063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_002935	AAG	2	6	20095	20100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002935	GGGGAT	2	12	20167	20178	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_002935	GTT	2	6	20198	20203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_002935	GTT	2	6	20209	20214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_002935	CCAG	2	8	20305	20312	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_002935	TG	3	6	20335	20340	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002935	CCT	2	6	20351	20356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_002935	CG	3	6	20390	20395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_002935	CTT	2	6	20408	20413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_002935	GAG	2	6	20437	20442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_002935	CAG	2	6	21206	21211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_002935	GGA	2	6	21290	21295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_002935	ACG	2	6	25460	25465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_002935	CCA	2	6	25754	25759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_002935	TAAC	2	8	25771	25778	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_002935	T	6	6	26542	26547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_002935	CA	3	6	26562	26567	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_002935	ATAA	2	8	26574	26581	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_002935	CAG	2	6	26591	26596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_002935	CTG	2	6	26620	26625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_002935	GTG	2	6	27062	27067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_002935	TGG	2	6	27094	27099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002935	GTTTG	2	10	27170	27179	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_002935	AGAT	2	8	27196	27203	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_002935	AAG	2	6	27218	27223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_002935	CCA	2	6	27249	27254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_002935	TG	3	6	27283	27288	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_002935	GGT	2	6	27330	27335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_002935	GTT	2	6	27393	27398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_002935	GGC	2	6	27420	27425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_002935	AGTG	2	8	27452	27459	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_002935	GAAG	2	8	27542	27549	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_002935	AG	3	6	27548	27553	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_002935	CCA	2	6	33911	33916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_002935	T	6	6	34006	34011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_002935	CCA	2	6	34035	34040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_002935	CCA	2	6	34045	34050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_002935	CCA	2	6	34055	34060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_002935	CAC	2	6	34066	34071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_002935	AC	3	6	34086	34091	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_002935	GAA	2	6	34113	34118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_002935	ACC	3	9	34155	34163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_002935	TAAT	2	8	34296	34303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_002935	GGGT	2	8	34305	34312	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
83	NC_002935	TTAA	2	8	34365	34372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_002935	CCG	2	6	34422	34427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_002935	TGG	2	6	39187	39192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_002935	AGA	2	6	39266	39271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_002935	GCT	2	6	39606	39611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_002935	GCT	3	9	39652	39660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_002935	CCA	2	6	39713	39718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_002935	ACG	2	6	39824	39829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_002935	TGA	2	6	39880	39885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_002935	TGG	2	6	39967	39972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_002935	CAA	2	6	39982	39987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_002935	CTG	2	6	40119	40124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_002935	TG	3	6	40190	40195	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_002935	TGC	2	6	40210	40215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_002935	GAA	2	6	40264	40269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_002935	TGA	2	6	40285	40290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_002935	GCG	3	9	40298	40306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_002935	CCG	2	6	40408	40413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_002935	GCT	2	6	40414	40419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_002935	ACG	2	6	40435	40440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_002935	AAGG	2	8	40579	40586	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_002935	GCC	2	6	40597	40602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_002935	GCC	2	6	40610	40615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_002935	CGA	2	6	40689	40694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_002935	ATC	2	6	40708	40713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_002935	CA	4	8	40716	40723	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_002935	AAC	2	6	40724	40729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_002935	CT	3	6	40738	40743	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_002935	GTT	2	6	40806	40811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_002935	TAA	2	6	40998	41003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_002935	ACA	2	6	41004	41009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_002935	ACCC	2	8	42658	42665	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
115	NC_002935	ACACC	2	10	42707	42716	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
116	NC_002935	CAG	2	6	43002	43007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_002935	TAC	2	6	43051	43056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_002935	AAC	2	6	43071	43076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_002935	TTG	2	6	43590	43595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_002935	GCC	2	6	43641	43646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_002935	AGC	2	6	43652	43657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_002935	GCA	2	6	43671	43676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_002935	CAG	2	6	43678	43683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_002935	CCT	2	6	52869	52874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_002935	ACA	2	6	52899	52904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_002935	TAG	2	6	53043	53048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_002935	A	8	8	53058	53065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_002935	CAC	2	6	53072	53077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_002935	C	7	7	53151	53157	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
130	NC_002935	CAA	2	6	53330	53335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_002935	CTTG	2	8	53341	53348	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_002935	AG	3	6	53409	53414	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_002935	CGG	2	6	53438	53443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_002935	CAC	2	6	53464	53469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_002935	GCC	2	6	53472	53477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_002935	GTG	2	6	53585	53590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_002935	TCA	2	6	53616	53621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_002935	TCC	2	6	53624	53629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_002935	ACC	2	6	53661	53666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_002935	AAT	2	6	53679	53684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_002935	G	6	6	53689	53694	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
142	NC_002935	GAC	2	6	53699	53704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_002935	GA	3	6	53798	53803	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_002935	GTG	2	6	53805	53810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_002935	ACC	2	6	58419	58424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_002935	CGG	2	6	58438	58443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_002935	TCA	2	6	58451	58456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_002935	CGG	2	6	58510	58515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_002935	CAG	2	6	58537	58542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_002935	CCA	2	6	58546	58551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
151	NC_002935	GTG	2	6	58615	58620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
152	NC_002935	GGT	2	6	58625	58630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_002935	CAAC	2	8	61230	61237	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
155	NC_002935	GTG	2	6	61285	61290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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160	NC_002935	CTT	2	6	61672	61677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_002935	GAC	2	6	61707	61712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_002935	TTG	2	6	61766	61771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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167	NC_002935	CGCA	2	8	62160	62167	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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169	NC_002935	GGT	2	6	62285	62290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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174	NC_002935	CGCAGG	2	12	62436	62447	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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191	NC_002935	TCT	2	6	66229	66234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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257	NC_002935	GAT	2	6	87953	87958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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276	NC_002935	CAA	2	6	100239	100244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
277	NC_002935	GGT	2	6	100263	100268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_002935	GTT	2	6	100317	100322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
281	NC_002935	TG	3	6	100340	100345	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
282	NC_002935	CCAT	2	8	100468	100475	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
283	NC_002935	CCGCA	2	10	100533	100542	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
284	NC_002935	CCA	2	6	100734	100739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
285	NC_002935	GC	3	6	100853	100858	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
286	NC_002935	CCA	2	6	100859	100864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
287	NC_002935	ACC	2	6	100877	100882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
288	NC_002935	AGCCA	2	10	100890	100899	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
289	NC_002935	GTT	2	6	101052	101057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_002935	AAC	2	6	101083	101088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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301	NC_002935	TGC	2	6	103101	103106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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317	NC_002935	GTT	2	6	116385	116390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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319	NC_002935	AG	3	6	116728	116733	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
320	NC_002935	AAG	2	6	116773	116778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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322	NC_002935	TGA	2	6	116815	116820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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400	NC_002935	T	6	6	151754	151759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
401	NC_002935	CACTTC	2	12	151860	151871	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
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454	NC_002935	CAG	2	6	166588	166593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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