MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlorobium tepidum TLS chromosome

Total Repeats: 720

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002932	TATT	2	8	3034	3041	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002932	CTTG	2	8	3102	3109	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_002932	TTCC	2	8	11131	11138	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_002932	GCAG	2	8	11368	11375	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_002932	TGAA	2	8	11387	11394	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_002932	TGGC	2	8	11420	11427	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_002932	ATTG	2	8	18404	18411	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_002932	ATAA	2	8	19896	19903	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_002932	TGGC	2	8	21393	21400	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_002932	TTTG	2	8	22596	22603	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_002932	GAAG	2	8	52155	52162	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_002932	GTTT	2	8	54303	54310	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002932	GGCA	2	8	54314	54321	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_002932	AAAT	2	8	65607	65614	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_002932	CGGC	2	8	67443	67450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_002932	GTCA	2	8	67965	67972	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_002932	AGCC	2	8	73345	73352	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_002932	TTGT	2	8	77341	77348	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_002932	AGTA	2	8	77603	77610	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_002932	GTTT	2	8	83737	83744	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_002932	GACA	2	8	88620	88627	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_002932	CACT	2	8	91936	91943	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_002932	ATTA	2	8	112163	112170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002932	CGAG	2	8	112237	112244	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_002932	AACA	2	8	120535	120542	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_002932	TGTT	2	8	120577	120584	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_002932	ACCC	2	8	120693	120700	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
28	NC_002932	ACCT	2	8	126452	126459	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_002932	GCCT	2	8	130087	130094	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_002932	TTGT	2	8	137090	137097	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002932	AGGG	2	8	140485	140492	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
32	NC_002932	GAGG	2	8	140645	140652	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
33	NC_002932	GCGA	2	8	141691	141698	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_002932	AGCG	2	8	141765	141772	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_002932	CGGA	2	8	142962	142969	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_002932	GATT	2	8	146828	146835	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_002932	GGCA	2	8	148429	148436	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_002932	GTAG	2	8	152099	152106	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_002932	GCAG	2	8	152367	152374	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_002932	ATTC	2	8	153238	153245	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_002932	GATC	2	8	159774	159781	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_002932	TGTT	2	8	167484	167491	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_002932	AGCA	2	8	167936	167943	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_002932	ATGA	2	8	175515	175522	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002932	GAAA	2	8	181884	181891	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_002932	CAAT	2	8	182758	182765	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_002932	CCTT	2	8	182823	182830	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_002932	TCTG	2	8	187906	187913	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_002932	TGAG	2	8	197829	197836	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_002932	CTGG	2	8	197891	197898	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_002932	TTCC	2	8	204424	204431	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_002932	TCAA	2	8	204495	204502	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_002932	GAAA	2	8	208220	208227	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_002932	GCCA	2	8	243360	243367	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_002932	ATTC	2	8	249525	249532	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_002932	CAAA	2	8	249705	249712	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_002932	CAGC	2	8	262687	262694	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_002932	CAAT	2	8	274257	274264	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_002932	TGCT	2	8	276148	276155	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_002932	TTGA	2	8	276210	276217	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002932	CCGG	2	8	280519	280526	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_002932	TCAG	2	8	283058	283065	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_002932	ATTC	2	8	288454	288461	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_002932	TGTT	2	8	297658	297665	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_002932	ATTT	2	8	302834	302841	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_002932	AGTT	2	8	303394	303401	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_002932	TGAC	2	8	307036	307043	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_002932	CCCG	2	8	307072	307079	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
69	NC_002932	CAAT	2	8	313514	313521	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_002932	GGAT	2	8	324455	324462	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_002932	TCAA	2	8	324530	324537	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_002932	CGGT	2	8	335578	335585	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_002932	GCCT	2	8	345743	345750	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_002932	AGAT	2	8	348079	348086	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_002932	AGGG	2	8	348120	348127	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
76	NC_002932	TGCT	2	8	348153	348160	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_002932	TCAG	2	8	351867	351874	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_002932	TGTT	2	8	363508	363515	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_002932	AGGT	2	8	366154	366161	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_002932	GTCA	2	8	366242	366249	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_002932	GCCA	2	8	369675	369682	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_002932	TCAA	2	8	381617	381624	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_002932	GATG	2	8	385555	385562	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_002932	GTTC	2	8	392767	392774	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_002932	GGGC	2	8	392780	392787	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
86	NC_002932	GTTT	2	8	392794	392801	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_002932	CGGT	2	8	394030	394037	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_002932	ATGA	2	8	396251	396258	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_002932	AAGC	2	8	396273	396280	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_002932	CCCA	2	8	396642	396649	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
91	NC_002932	TTCA	2	8	420069	420076	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_002932	ATGG	2	8	422530	422537	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_002932	GCCC	2	8	436770	436777	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
94	NC_002932	GCCA	2	8	436792	436799	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_002932	CGGG	2	8	436833	436840	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
96	NC_002932	TCTG	2	8	436951	436958	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_002932	AATA	2	8	443749	443756	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_002932	GCCA	2	8	446959	446966	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_002932	CGGC	2	8	448048	448055	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_002932	TTGG	2	8	451717	451724	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_002932	GCTG	2	8	451803	451810	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_002932	CAGA	2	8	452335	452342	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_002932	GCAG	2	8	452934	452941	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_002932	TGCT	2	8	457504	457511	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_002932	CCTT	2	8	458055	458062	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_002932	GGCA	2	8	465029	465036	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_002932	TGAT	2	8	466197	466204	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_002932	AGAT	2	8	466263	466270	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_002932	AGCG	2	8	466329	466336	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_002932	CCAT	2	8	466785	466792	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_002932	CGTC	2	8	466833	466840	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_002932	GCGG	2	8	466897	466904	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
113	NC_002932	TTTC	2	8	467365	467372	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_002932	GCTT	2	8	469513	469520	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_002932	CCAC	2	8	479310	479317	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
116	NC_002932	TCAA	2	8	479346	479353	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_002932	GCTC	2	8	482460	482467	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_002932	CATC	2	8	487085	487092	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_002932	GCCC	2	8	487446	487453	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
120	NC_002932	TGGA	2	8	496800	496807	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_002932	ATTG	2	8	497650	497657	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_002932	GTTC	2	8	497658	497665	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_002932	CGGG	2	8	497809	497816	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
124	NC_002932	TTTG	2	8	498147	498154	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_002932	TGGC	2	8	501688	501695	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_002932	GTTT	2	8	502320	502327	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_002932	TTGA	2	8	503754	503761	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_002932	TTCT	2	8	503791	503798	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_002932	ACAA	2	8	503944	503951	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_002932	GCCC	2	8	504300	504307	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
131	NC_002932	AGGG	2	8	504350	504357	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
132	NC_002932	TCAT	2	8	505295	505302	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_002932	TACT	2	8	507773	507780	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_002932	CAGA	2	8	510590	510597	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_002932	ATTT	2	8	510721	510728	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_002932	GGTC	2	8	516516	516523	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_002932	CTGA	2	8	516991	516998	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_002932	CAAT	2	8	519323	519330	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_002932	GGAA	2	8	522321	522328	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_002932	GCCT	2	8	522620	522627	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_002932	GCTT	2	8	526113	526120	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_002932	ACGT	2	8	526346	526353	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_002932	AGGT	2	8	526653	526660	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_002932	GATT	2	8	540756	540763	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_002932	TATC	2	8	546463	546470	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_002932	GCCC	2	8	546515	546522	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
147	NC_002932	ATTG	2	8	549433	549440	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_002932	TTAT	2	8	549622	549629	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_002932	GAAA	2	8	550089	550096	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_002932	GGAG	2	8	550385	550392	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
151	NC_002932	TTCA	2	8	555813	555820	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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272	NC_002932	AAGA	2	8	815534	815541	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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282	NC_002932	GGAT	2	8	833823	833830	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
283	NC_002932	TTTG	2	8	833892	833899	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
284	NC_002932	AAAG	2	8	834663	834670	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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286	NC_002932	TTCT	2	8	846423	846430	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
287	NC_002932	TCAA	2	8	846705	846712	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
288	NC_002932	TTAT	2	8	849743	849750	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_002932	TGAG	2	8	875230	875237	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_002932	ATCT	2	8	1449547	1449554	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

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