MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chlorobium tepidum TLS chromosome

Total Repeats: 5289

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_002932	CATCA	2	10	1426318	1426327	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3502	NC_002932	ACA	2	6	1427602	1427607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_002932	ACC	2	6	1427694	1427699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3504	NC_002932	CT	3	6	1431578	1431583	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3505	NC_002932	TAC	2	6	1431653	1431658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_002932	T	6	6	1431671	1431676	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_002932	A	7	7	1431761	1431767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_002932	CTC	2	6	1434584	1434589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3509	NC_002932	GCT	2	6	1434590	1434595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_002932	A	6	6	1434655	1434660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_002932	CTC	2	6	1434714	1434719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3512	NC_002932	AAG	2	6	1434736	1434741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_002932	TTG	2	6	1434783	1434788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_002932	T	6	6	1434855	1434860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_002932	TCTCC	2	10	1434898	1434907	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
3516	NC_002932	TCT	2	6	1434917	1434922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_002932	TGT	2	6	1434970	1434975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_002932	GAT	2	6	1434983	1434988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_002932	CAT	2	6	1435071	1435076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_002932	AGA	2	6	1435100	1435105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_002932	CGG	2	6	1435111	1435116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_002932	AGC	2	6	1435122	1435127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3523	NC_002932	ATC	2	6	1435188	1435193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_002932	A	7	7	1435248	1435254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_002932	GGC	2	6	1435442	1435447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_002932	AGC	2	6	1435475	1435480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_002932	CCA	2	6	1435517	1435522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3528	NC_002932	AGC	2	6	1435577	1435582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_002932	CCCGAC	2	12	1435585	1435596	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
3530	NC_002932	ACC	2	6	1435597	1435602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3531	NC_002932	CTA	2	6	1435626	1435631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_002932	ATT	2	6	1435852	1435857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_002932	AACA	2	8	1435904	1435911	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3534	NC_002932	ATCA	2	8	1436762	1436769	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3535	NC_002932	A	6	6	1436769	1436774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_002932	AACA	2	8	1436814	1436821	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3537	NC_002932	AAT	2	6	1439250	1439255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_002932	ACG	2	6	1440723	1440728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_002932	GGCG	2	8	1440787	1440794	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3540	NC_002932	CAT	2	6	1443576	1443581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_002932	ACC	2	6	1444929	1444934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3542	NC_002932	AAC	2	6	1444939	1444944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_002932	AC	3	6	1445310	1445315	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3544	NC_002932	ATT	2	6	1445326	1445331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_002932	TTA	2	6	1445343	1445348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_002932	TTA	2	6	1445352	1445357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_002932	A	6	6	1445386	1445391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_002932	T	6	6	1445399	1445404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_002932	CCCG	2	8	1447700	1447707	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3550	NC_002932	TTCT	2	8	1447722	1447729	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3551	NC_002932	CGG	2	6	1447744	1447749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_002932	CCG	2	6	1447757	1447762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3553	NC_002932	CCG	2	6	1448710	1448715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3554	NC_002932	ATCT	2	8	1449547	1449554	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3555	NC_002932	ATT	2	6	1449558	1449563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_002932	TCA	2	6	1449565	1449570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3557	NC_002932	TAA	2	6	1451787	1451792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_002932	GTT	2	6	1451796	1451801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_002932	TAT	3	9	1451821	1451829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_002932	GAT	2	6	1453928	1453933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_002932	TAA	2	6	1453961	1453966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_002932	TTC	2	6	1453980	1453985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3563	NC_002932	CCA	2	6	1459091	1459096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3564	NC_002932	TTC	2	6	1459147	1459152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_002932	TGA	2	6	1459199	1459204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_002932	TTG	2	6	1459255	1459260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_002932	CGG	2	6	1459279	1459284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3568	NC_002932	CTCG	2	8	1459310	1459317	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3569	NC_002932	CT	3	6	1459404	1459409	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3570	NC_002932	CGT	2	6	1459487	1459492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_002932	GTC	2	6	1459518	1459523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_002932	GCTG	2	8	1459658	1459665	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3573	NC_002932	GGA	2	6	1459745	1459750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_002932	CCA	2	6	1459764	1459769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3575	NC_002932	TCG	2	6	1459804	1459809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_002932	GCC	2	6	1459819	1459824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3577	NC_002932	TGA	2	6	1459850	1459855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_002932	CCTT	2	8	1459990	1459997	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3579	NC_002932	GA	3	6	1460077	1460082	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_002932	A	7	7	1460254	1460260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_002932	T	7	7	1460267	1460273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_002932	A	9	9	1460288	1460296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_002932	C	6	6	1463052	1463057	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3584	NC_002932	GAG	2	6	1463061	1463066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_002932	T	6	6	1463795	1463800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_002932	GTT	2	6	1463801	1463806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_002932	GTG	2	6	1463839	1463844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_002932	CGC	2	6	1463931	1463936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3589	NC_002932	ACC	2	6	1463966	1463971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3590	NC_002932	A	6	6	1465626	1465631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_002932	CAG	2	6	1465669	1465674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_002932	TC	3	6	1465683	1465688	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3593	NC_002932	CTCCTG	2	12	1465717	1465728	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3594	NC_002932	TGC	2	6	1465745	1465750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3595	NC_002932	ATC	2	6	1465777	1465782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_002932	TTC	2	6	1465826	1465831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3597	NC_002932	AGA	2	6	1471008	1471013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_002932	A	7	7	1474105	1474111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_002932	A	7	7	1474139	1474145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_002932	A	6	6	1474150	1474155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_002932	CGG	3	9	1474890	1474898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3602	NC_002932	T	6	6	1474914	1474919	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_002932	TGC	2	6	1474937	1474942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_002932	TCG	2	6	1475577	1475582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_002932	ATA	2	6	1475606	1475611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_002932	AGCG	2	8	1475613	1475620	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3607	NC_002932	TGT	3	9	1475645	1475653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_002932	A	6	6	1475742	1475747	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_002932	TTGA	2	8	1478475	1478482	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_002932	T	6	6	1478544	1478549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_002932	AGT	2	6	1478575	1478580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_002932	CATG	2	8	1479903	1479910	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3613	NC_002932	ATT	2	6	1480034	1480039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_002932	AAT	2	6	1480043	1480048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_002932	CAT	2	6	1480083	1480088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3616	NC_002932	TAA	2	6	1480122	1480127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_002932	GACA	2	8	1481380	1481387	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3618	NC_002932	ACC	2	6	1481401	1481406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3619	NC_002932	CAATA	2	10	1481451	1481460	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3620	NC_002932	ACG	2	6	1484816	1484821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_002932	AAG	2	6	1484839	1484844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_002932	GAA	2	6	1484859	1484864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_002932	TTA	2	6	1487078	1487083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_002932	A	6	6	1487088	1487093	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_002932	T	6	6	1487112	1487117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_002932	CAAT	2	8	1487392	1487399	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3627	NC_002932	GGATCG	2	12	1488081	1488092	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3628	NC_002932	ACCA	2	8	1488107	1488114	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3629	NC_002932	TTC	2	6	1488122	1488127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3630	NC_002932	CCAA	2	8	1488176	1488183	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3631	NC_002932	TTG	2	6	1488259	1488264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3632	NC_002932	CCAC	2	8	1488291	1488298	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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3634	NC_002932	CAT	2	6	1488321	1488326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3748	NC_002932	ATTCA	2	10	1530489	1530498	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3749	NC_002932	TCT	2	6	1530536	1530541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3752	NC_002932	A	6	6	1531499	1531504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3753	NC_002932	T	7	7	1531523	1531529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3754	NC_002932	AAG	2	6	1531541	1531546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3756	NC_002932	T	6	6	1533363	1533368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3757	NC_002932	GAA	2	6	1533374	1533379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3760	NC_002932	A	6	6	1534237	1534242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3761	NC_002932	T	7	7	1534297	1534303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3762	NC_002932	AACGT	2	10	1534346	1534355	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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