MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chlorobium tepidum TLS chromosome

Total Repeats: 5289

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_002932	GAA	2	6	643279	643284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_002932	GGTT	2	8	643285	643292	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_002932	GGC	2	6	643317	643322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_002932	TTA	2	6	643324	643329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_002932	TGG	2	6	643332	643337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_002932	A	7	7	643857	643863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_002932	AT	3	6	643871	643876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_002932	TTA	2	6	643879	643884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_002932	A	6	6	643903	643908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_002932	TG	3	6	643933	643938	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_002932	TGAA	2	8	644226	644233	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_002932	GAG	2	6	644863	644868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_002932	AAC	2	6	644919	644924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_002932	AT	3	6	644935	644940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_002932	ATG	2	6	644969	644974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_002932	A	6	6	645004	645009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_002932	GAC	2	6	646546	646551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_002932	TGT	2	6	647889	647894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_002932	G	7	7	647902	647908	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_002932	A	6	6	648743	648748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_002932	T	6	6	648764	648769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_002932	GTC	2	6	649477	649482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_002932	CCA	2	6	649487	649492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1524	NC_002932	AGGA	2	8	649540	649547	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_002932	GGA	3	9	649545	649553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_002932	GCC	2	6	649570	649575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1527	NC_002932	GAAG	2	8	649599	649606	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_002932	ATA	2	6	653021	653026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_002932	GAC	2	6	653057	653062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_002932	TTGG	2	8	653230	653237	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_002932	ACC	2	6	653425	653430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1532	NC_002932	GAA	2	6	653451	653456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_002932	TGC	2	6	653477	653482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_002932	TGT	2	6	653616	653621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_002932	TGG	2	6	653627	653632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_002932	TGA	2	6	653667	653672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_002932	GGC	2	6	653677	653682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_002932	C	6	6	653710	653715	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1539	NC_002932	CCGC	2	8	653724	653731	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1540	NC_002932	TGTC	2	8	653795	653802	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1541	NC_002932	CTG	2	6	656108	656113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_002932	T	6	6	657361	657366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_002932	T	9	9	657380	657388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_002932	A	6	6	657412	657417	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_002932	GTT	2	6	660507	660512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_002932	GACT	2	8	660541	660548	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1547	NC_002932	GGAC	2	8	660631	660638	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1548	NC_002932	ATT	2	6	660675	660680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_002932	GCC	2	6	660756	660761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1550	NC_002932	GCT	2	6	660866	660871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_002932	ACCA	2	8	660896	660903	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1552	NC_002932	CCA	2	6	660968	660973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1553	NC_002932	AGAC	2	8	660982	660989	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1554	NC_002932	TTTTCT	2	12	661023	661034	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1555	NC_002932	GTCG	2	8	661278	661285	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1556	NC_002932	TTG	2	6	661290	661295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_002932	CGC	2	6	661319	661324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1558	NC_002932	CTG	2	6	661454	661459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_002932	CAG	2	6	661462	661467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_002932	AGC	2	6	661541	661546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_002932	TGG	2	6	661566	661571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_002932	GGA	2	6	661622	661627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_002932	TCA	2	6	662089	662094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_002932	AAT	2	6	662161	662166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_002932	GAC	2	6	662196	662201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_002932	TCG	2	6	662464	662469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_002932	CGC	2	6	662513	662518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1568	NC_002932	ATT	2	6	662586	662591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_002932	CTC	2	6	665345	665350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1570	NC_002932	TTG	2	6	665365	665370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_002932	CCAC	2	8	665374	665381	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1572	NC_002932	AAT	2	6	665404	665409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_002932	CT	3	6	665445	665450	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1574	NC_002932	AAT	2	6	665971	665976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_002932	TGA	2	6	666029	666034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_002932	T	6	6	666037	666042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_002932	TCCC	2	8	666065	666072	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1578	NC_002932	AAC	2	6	666097	666102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_002932	TCGC	2	8	669659	669666	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1580	NC_002932	GC	3	6	669665	669670	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1581	NC_002932	ATA	2	6	669694	669699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_002932	AGC	2	6	669707	669712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_002932	AACG	2	8	669947	669954	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1584	NC_002932	ACC	2	6	670007	670012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1585	NC_002932	ACC	2	6	670057	670062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1586	NC_002932	CCG	2	6	670067	670072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1587	NC_002932	CG	3	6	670087	670092	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1588	NC_002932	GCT	2	6	670099	670104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_002932	GAG	2	6	670106	670111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_002932	CATA	2	8	677408	677415	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1591	NC_002932	GCA	2	6	677757	677762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_002932	A	6	6	677809	677814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_002932	CTCAG	2	10	677822	677831	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1594	NC_002932	AATG	2	8	678422	678429	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_002932	GAAG	2	8	678501	678508	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_002932	GGCC	2	8	678551	678558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1597	NC_002932	GGC	2	6	678574	678579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_002932	ATG	2	6	678642	678647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_002932	GAGGT	2	10	678697	678706	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_002932	TTC	2	6	678724	678729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_002932	CCTT	2	8	678737	678744	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1602	NC_002932	AGGG	2	8	679240	679247	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_002932	CGA	2	6	679601	679606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_002932	TGG	2	6	679675	679680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_002932	TTG	2	6	679696	679701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_002932	CGT	2	6	679929	679934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_002932	ATG	2	6	680077	680082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_002932	TCA	2	6	680119	680124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_002932	CCAC	2	8	680152	680159	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1610	NC_002932	GAA	2	6	680170	680175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_002932	GTT	2	6	680418	680423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_002932	TCC	2	6	680461	680466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1613	NC_002932	CCGC	2	8	680471	680478	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1614	NC_002932	GAT	2	6	680484	680489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_002932	CGG	2	6	680511	680516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_002932	AAG	2	6	680583	680588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_002932	GGC	2	6	680594	680599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_002932	GTTC	2	8	680605	680612	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1619	NC_002932	CGC	2	6	680651	680656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1620	NC_002932	GCAA	2	8	680876	680883	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1621	NC_002932	GGC	2	6	680915	680920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_002932	ATA	2	6	681104	681109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_002932	TCG	2	6	681407	681412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_002932	ACA	2	6	681416	681421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_002932	ATG	2	6	681455	681460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_002932	GAT	2	6	681530	681535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_002932	CAA	2	6	681604	681609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_002932	CTG	2	6	681611	681616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_002932	GCA	2	6	682099	682104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_002932	CGA	2	6	684716	684721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_002932	TAC	2	6	685123	685128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_002932	T	6	6	685143	685148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_002932	CGGA	2	8	685179	685186	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1634	NC_002932	CTT	2	6	685198	685203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1635	NC_002932	CCT	2	6	685271	685276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1636	NC_002932	GTT	2	6	687386	687391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2000	NC_002932	GCCGC	2	10	829733	829742	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding

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