MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia muridarum Nigg

Total Repeats: 255

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002620	TC	3	6	147	152	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_002620	GA	3	6	5491	5496	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002620	AG	3	6	5585	5590	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002620	AT	3	6	16548	16553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_002620	GC	3	6	16960	16965	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_002620	TC	3	6	26519	26524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_002620	GA	3	6	26666	26671	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_002620	CG	3	6	33653	33658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_002620	TA	3	6	33986	33991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_002620	CT	3	6	38291	38296	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_002620	AG	3	6	38485	38490	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_002620	AG	3	6	39833	39838	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002620	GA	3	6	43409	43414	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_002620	TG	3	6	46187	46192	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_002620	AT	3	6	53276	53281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_002620	GC	3	6	58418	58423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_002620	CT	3	6	59840	59845	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_002620	AG	3	6	60183	60188	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_002620	AT	3	6	60391	60396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_002620	TA	4	8	72566	72573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_002620	AT	3	6	72582	72587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_002620	GA	3	6	81882	81887	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_002620	AG	4	8	82832	82839	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002620	TC	3	6	84193	84198	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_002620	TC	3	6	87362	87367	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_002620	GA	3	6	87396	87401	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_002620	AG	3	6	89607	89612	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_002620	GA	3	6	94517	94522	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_002620	AT	3	6	111700	111705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_002620	CT	3	6	114444	114449	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_002620	TA	3	6	114745	114750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_002620	AG	3	6	115327	115332	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_002620	CA	3	6	122988	122993	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_002620	GA	3	6	126352	126357	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_002620	GA	3	6	134133	134138	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_002620	GT	3	6	134240	134245	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_002620	AC	3	6	135061	135066	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_002620	AC	3	6	135230	135235	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_002620	TC	3	6	136492	136497	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_002620	GT	3	6	136841	136846	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_002620	GC	3	6	137319	137324	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_002620	GA	3	6	138696	138701	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_002620	TA	3	6	138899	138904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002620	CT	3	6	138909	138914	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_002620	AG	3	6	141565	141570	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_002620	GC	3	6	141758	141763	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_002620	AG	3	6	141764	141769	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_002620	AG	3	6	141936	141941	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_002620	GC	3	6	142023	142028	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_002620	AG	3	6	142247	142252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_002620	AT	3	6	155355	155360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_002620	GA	3	6	156091	156096	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002620	GT	3	6	156198	156203	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_002620	AC	3	6	157019	157024	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_002620	AC	3	6	157188	157193	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_002620	TC	3	6	158450	158455	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_002620	GT	3	6	158798	158803	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_002620	GC	3	6	159276	159281	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_002620	GT	3	6	160319	160324	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_002620	GA	3	6	160653	160658	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002620	GA	3	6	164063	164068	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_002620	GA	3	6	167611	167616	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_002620	AT	3	6	177425	177430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_002620	AG	3	6	178370	178375	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_002620	TG	3	6	178850	178855	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_002620	AG	3	6	182793	182798	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_002620	TC	3	6	182891	182896	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_002620	AT	3	6	182954	182959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_002620	TC	3	6	183058	183063	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_002620	AG	3	6	188264	188269	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_002620	GA	3	6	194996	195001	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_002620	GT	3	6	195540	195545	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_002620	AG	3	6	200975	200980	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_002620	AT	3	6	202463	202468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_002620	AG	3	6	202754	202759	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_002620	TG	3	6	207592	207597	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_002620	TC	3	6	207789	207794	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_002620	TC	3	6	210040	210045	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_002620	CT	3	6	210650	210655	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_002620	AG	3	6	210661	210666	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_002620	GA	3	6	214000	214005	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_002620	GA	3	6	214027	214032	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_002620	TA	3	6	216381	216386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_002620	GT	3	6	220210	220215	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_002620	AG	3	6	228288	228293	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_002620	TG	3	6	237657	237662	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_002620	CT	3	6	239493	239498	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_002620	AG	3	6	239527	239532	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_002620	GA	3	6	239537	239542	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_002620	TG	3	6	247680	247685	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_002620	TA	3	6	252892	252897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_002620	TA	3	6	253253	253258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_002620	TA	3	6	260288	260293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_002620	TA	3	6	260887	260892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_002620	AT	3	6	268987	268992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_002620	CT	3	6	271822	271827	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_002620	AG	3	6	271878	271883	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_002620	CT	3	6	271888	271893	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_002620	AG	3	6	286906	286911	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_002620	GT	3	6	298569	298574	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_002620	CA	3	6	303197	303202	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_002620	TA	3	6	317669	317674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_002620	TC	3	6	331365	331370	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_002620	TA	4	8	335721	335728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_002620	CT	3	6	340582	340587	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_002620	GA	3	6	342612	342617	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_002620	AG	3	6	343317	343322	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_002620	CT	3	6	360884	360889	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_002620	CT	3	6	364599	364604	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_002620	TA	3	6	365880	365885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_002620	TG	3	6	367821	367826	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_002620	AG	3	6	371410	371415	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_002620	GA	3	6	377285	377290	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_002620	GA	3	6	381806	381811	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_002620	AT	3	6	390238	390243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_002620	AT	3	6	392943	392948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_002620	CT	3	6	399669	399674	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_002620	AG	3	6	399676	399681	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_002620	AT	3	6	414656	414661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_002620	GA	3	6	420625	420630	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_002620	TC	3	6	420927	420932	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_002620	AT	3	6	420978	420983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_002620	TA	3	6	427691	427696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_002620	TC	3	6	427784	427789	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_002620	GA	4	8	441380	441387	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_002620	TA	3	6	443847	443852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_002620	TG	3	6	443884	443889	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_002620	CT	3	6	448805	448810	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_002620	AG	3	6	455569	455574	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_002620	AG	4	8	458869	458876	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_002620	TC	3	6	472114	472119	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_002620	AC	3	6	477839	477844	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_002620	AG	3	6	493553	493558	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_002620	AG	3	6	493585	493590	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_002620	AC	3	6	496129	496134	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_002620	GA	3	6	499949	499954	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_002620	TA	3	6	506268	506273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_002620	TG	3	6	526522	526527	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_002620	GT	3	6	526554	526559	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_002620	CA	3	6	542377	542382	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_002620	AG	3	6	542452	542457	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_002620	TA	3	6	543426	543431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_002620	TG	3	6	551935	551940	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_002620	AG	3	6	566442	566447	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_002620	AT	3	6	568149	568154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_002620	CT	3	6	575677	575682	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_002620	AT	3	6	591712	591717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_002620	GA	3	6	591775	591780	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_002620	TC	4	8	591786	591793	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_002620	TG	3	6	591835	591840	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_002620	AT	6	12	598095	598106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_002620	TA	3	6	598160	598165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_002620	GA	3	6	601540	601545	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_002620	TG	3	6	601650	601655	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.