MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chlamydia muridarum Nigg

Total Repeats: 2620

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_002620	CAA	2	6	1059941	1059946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2502	NC_002620	T	8	8	1059949	1059956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_002620	A	6	6	1059977	1059982	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_002620	T	6	6	1059988	1059993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_002620	TTA	2	6	1060014	1060019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_002620	A	8	8	1060058	1060065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_002620	A	6	6	1060071	1060076	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_002620	T	7	7	1060080	1060086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_002620	AG	3	6	1060121	1060126	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_002620	AAC	2	6	1060137	1060142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2511	NC_002620	CTG	2	6	1060163	1060168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2512	NC_002620	TCT	2	6	1060184	1060189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2513	NC_002620	TTTC	2	8	1060198	1060205	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2514	NC_002620	GCA	2	6	1060254	1060259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2515	NC_002620	GAA	2	6	1060278	1060283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_002620	CTT	2	6	1060336	1060341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2517	NC_002620	TGC	2	6	1060420	1060425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2518	NC_002620	ACT	2	6	1060457	1060462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2519	NC_002620	TAC	2	6	1060468	1060473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2520	NC_002620	TAA	2	6	1060537	1060542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_002620	TGA	2	6	1060637	1060642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_002620	GAA	2	6	1060644	1060649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_002620	TGT	2	6	1060657	1060662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_002620	GCT	2	6	1060666	1060671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2525	NC_002620	TTTG	2	8	1060677	1060684	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_002620	CTG	2	6	1060693	1060698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2527	NC_002620	AGA	2	6	1060703	1060708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2528	NC_002620	GCA	2	6	1060728	1060733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2529	NC_002620	AGCT	2	8	1060793	1060800	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2530	NC_002620	TTAC	2	8	1060860	1060867	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2531	NC_002620	CAT	2	6	1060930	1060935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2532	NC_002620	GAA	2	6	1060944	1060949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2533	NC_002620	CAA	2	6	1061023	1061028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2534	NC_002620	T	6	6	1061069	1061074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2535	NC_002620	ATA	2	6	1061109	1061114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_002620	CAT	2	6	1061167	1061172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2537	NC_002620	TCT	2	6	1061179	1061184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2538	NC_002620	TAT	2	6	1061209	1061214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2539	NC_002620	CAG	2	6	1061233	1061238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2540	NC_002620	TCA	2	6	1061256	1061261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2541	NC_002620	TTA	2	6	1061373	1061378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_002620	TCT	2	6	1061385	1061390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2543	NC_002620	TC	3	6	1061418	1061423	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2544	NC_002620	GTT	2	6	1061451	1061456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_002620	TAG	2	6	1061468	1061473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_002620	CAAC	2	8	1061497	1061504	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2547	NC_002620	TAA	2	6	1061518	1061523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_002620	TTG	2	6	1061570	1061575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_002620	CGT	2	6	1061579	1061584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2550	NC_002620	AT	3	6	1061631	1061636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_002620	CAGC	2	8	1061647	1061654	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2552	NC_002620	GTT	2	6	1061655	1061660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_002620	CAT	2	6	1061704	1061709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2554	NC_002620	GGT	2	6	1061714	1061719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_002620	ATA	2	6	1061824	1061829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_002620	AGA	2	6	1061846	1061851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_002620	AGA	2	6	1061951	1061956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_002620	ATA	2	6	1061979	1061984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_002620	A	9	9	1061988	1061996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_002620	CTT	3	9	1062004	1062012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2561	NC_002620	TA	4	8	1062017	1062024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_002620	A	7	7	1062030	1062036	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_002620	CTT	2	6	1062073	1062078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2564	NC_002620	GAA	2	6	1062096	1062101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2565	NC_002620	TGC	2	6	1062170	1062175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2566	NC_002620	GAAA	2	8	1062185	1062192	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_002620	CTT	2	6	1062256	1062261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2568	NC_002620	GTA	2	6	1062468	1062473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2569	NC_002620	ATAG	2	8	1062514	1062521	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2570	NC_002620	GCTG	2	8	1062630	1062637	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2571	NC_002620	CAG	2	6	1062652	1062657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2572	NC_002620	TCGT	2	8	1062660	1062667	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2573	NC_002620	CAAT	2	8	1062687	1062694	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2574	NC_002620	AAC	2	6	1062707	1062712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2575	NC_002620	AACG	2	8	1062782	1062789	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2576	NC_002620	AAGG	2	8	1062814	1062821	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2579	NC_002620	TGC	2	6	1062868	1062873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2583	NC_002620	TTA	2	6	1063128	1063133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2587	NC_002620	TAA	2	6	1063337	1063342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2588	NC_002620	T	6	6	1063373	1063378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2589	NC_002620	CTTA	2	8	1063504	1063511	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2590	NC_002620	AGGA	2	8	1063550	1063557	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_002620	T	6	6	1063558	1063563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2592	NC_002620	GAA	2	6	1063587	1063592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2593	NC_002620	TCT	2	6	1065369	1065374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2594	NC_002620	CAAG	2	8	1066309	1066316	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2595	NC_002620	A	6	6	1067027	1067032	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2596	NC_002620	GTT	2	6	1067061	1067066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2598	NC_002620	A	7	7	1067160	1067166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2599	NC_002620	CTT	2	6	1067169	1067174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2600	NC_002620	A	6	6	1067179	1067184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_002620	TTC	2	6	1067247	1067252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2602	NC_002620	CCA	2	6	1067275	1067280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2603	NC_002620	CTTT	2	8	1067290	1067297	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2604	NC_002620	A	6	6	1067307	1067312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_002620	TAAA	2	8	1067318	1067325	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_002620	CTT	2	6	1067334	1067339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2607	NC_002620	AT	3	6	1067368	1067373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2608	NC_002620	ATT	2	6	1067395	1067400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2609	NC_002620	CAT	2	6	1068426	1068431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2610	NC_002620	TCA	2	6	1069331	1069336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2611	NC_002620	CAA	2	6	1069346	1069351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2612	NC_002620	TAA	2	6	1069363	1069368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_002620	ATT	2	6	1070731	1070736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_002620	T	6	6	1070762	1070767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2615	NC_002620	A	9	9	1070781	1070789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2616	NC_002620	T	7	7	1070804	1070810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_002620	T	6	6	1070830	1070835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_002620	T	6	6	1071152	1071157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2619	NC_002620	CTT	2	6	1071306	1071311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2620	NC_002620	GCG	2	6	1071321	1071326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.