MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae J138 chromosome

Total Repeats: 324

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002491	TC	3	6	377	382	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_002491	AG	3	6	465	470	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002491	TG	3	6	6911	6916	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002491	TG	3	6	6977	6982	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_002491	CT	3	6	10494	10499	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_002491	TA	3	6	12929	12934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_002491	GA	3	6	15491	15496	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_002491	CT	3	6	20894	20899	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_002491	CT	3	6	26912	26917	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_002491	AG	3	6	30056	30061	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_002491	TC	3	6	30107	30112	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_002491	TA	3	6	38321	38326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002491	CT	3	6	39315	39320	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_002491	AT	3	6	42038	42043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_002491	GA	4	8	45798	45805	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_002491	TA	3	6	55494	55499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_002491	TA	3	6	58054	58059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_002491	AG	3	6	63038	63043	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_002491	GT	3	6	63352	63357	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_002491	TA	3	6	66895	66900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_002491	TC	3	6	66942	66947	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_002491	TC	3	6	77501	77506	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_002491	AT	3	6	78533	78538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002491	TC	3	6	83994	83999	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_002491	AT	3	6	87101	87106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_002491	AG	3	6	87201	87206	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_002491	GT	3	6	90670	90675	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_002491	CT	3	6	104232	104237	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_002491	AG	3	6	104377	104382	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_002491	AG	3	6	111747	111752	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002491	AG	3	6	115648	115653	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_002491	TA	3	6	129813	129818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_002491	AT	3	6	133602	133607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_002491	AT	3	6	134621	134626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_002491	GA	3	6	137790	137795	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_002491	AG	3	6	138284	138289	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_002491	TC	3	6	144886	144891	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_002491	TA	3	6	155833	155838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_002491	TA	3	6	156139	156144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002491	CT	3	6	161859	161864	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_002491	AG	3	6	172218	172223	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_002491	AT	3	6	177207	177212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_002491	AT	3	6	177263	177268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002491	GT	4	8	180412	180419	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002491	TA	3	6	183520	183525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_002491	CT	3	6	192247	192252	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_002491	TA	5	10	195122	195131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_002491	AG	3	6	200586	200591	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_002491	AG	3	6	201155	201160	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_002491	GA	3	6	205601	205606	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_002491	CT	3	6	209472	209477	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_002491	CT	3	6	209492	209497	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_002491	AG	4	8	213018	213025	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_002491	TG	3	6	213735	213740	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_002491	CT	3	6	217125	217130	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_002491	AT	3	6	217251	217256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_002491	GA	3	6	217375	217380	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_002491	TA	3	6	218868	218873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_002491	AT	3	6	222225	222230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_002491	AT	3	6	222353	222358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002491	AT	3	6	222419	222424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_002491	CT	3	6	226681	226686	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_002491	TC	4	8	235494	235501	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_002491	TA	3	6	238591	238596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_002491	TA	3	6	238772	238777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_002491	TC	3	6	240651	240656	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_002491	TC	3	6	244168	244173	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_002491	TA	3	6	248249	248254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_002491	CT	3	6	248340	248345	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_002491	AG	3	6	250443	250448	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_002491	AG	3	6	250599	250604	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_002491	TA	3	6	250961	250966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_002491	TC	3	6	252023	252028	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_002491	CT	3	6	252045	252050	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_002491	AG	3	6	253699	253704	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_002491	AG	3	6	253997	254002	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_002491	CT	3	6	254032	254037	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_002491	CT	3	6	260194	260199	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_002491	TA	3	6	261207	261212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_002491	CT	3	6	261893	261898	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_002491	CA	3	6	261949	261954	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_002491	TC	4	8	262026	262033	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_002491	AT	3	6	280340	280345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_002491	TC	3	6	280448	280453	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_002491	AG	3	6	283058	283063	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_002491	TC	3	6	292791	292796	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_002491	TA	3	6	292896	292901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_002491	CA	3	6	293680	293685	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_002491	AC	3	6	295731	295736	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_002491	TC	3	6	295838	295843	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_002491	AT	3	6	298544	298549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_002491	TC	3	6	300551	300556	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_002491	AC	3	6	302074	302079	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_002491	GA	3	6	310815	310820	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_002491	AG	3	6	310992	310997	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_002491	AC	3	6	311004	311009	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_002491	TA	3	6	314278	314283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_002491	AT	3	6	314500	314505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_002491	AC	3	6	314669	314674	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_002491	AG	3	6	336371	336376	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_002491	AG	3	6	348692	348697	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_002491	AG	3	6	348705	348710	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_002491	TA	3	6	348809	348814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_002491	TC	3	6	353126	353131	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_002491	TA	3	6	356496	356501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_002491	AT	3	6	372485	372490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_002491	AT	3	6	374673	374678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_002491	TA	3	6	378807	378812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_002491	TA	3	6	378876	378881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_002491	TC	3	6	381843	381848	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_002491	AG	3	6	381851	381856	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_002491	AT	3	6	392549	392554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_002491	AG	3	6	393482	393487	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_002491	CT	4	8	399704	399711	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_002491	CT	3	6	401247	401252	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_002491	AT	3	6	409448	409453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_002491	AT	3	6	412437	412442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_002491	TG	3	6	412630	412635	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_002491	TC	3	6	416625	416630	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_002491	AG	3	6	416647	416652	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_002491	TC	3	6	416703	416708	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_002491	CT	3	6	417906	417911	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_002491	TC	3	6	417950	417955	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_002491	TC	3	6	418041	418046	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_002491	TA	3	6	438958	438963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_002491	TC	3	6	445498	445503	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_002491	AT	3	6	447146	447151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_002491	CT	3	6	453637	453642	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_002491	TA	3	6	453711	453716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_002491	AC	3	6	464362	464367	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_002491	CT	3	6	464521	464526	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_002491	AG	3	6	464530	464535	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_002491	TC	3	6	471904	471909	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_002491	TC	3	6	487620	487625	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_002491	AT	3	6	488382	488387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_002491	CT	3	6	489724	489729	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_002491	TC	3	6	489848	489853	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_002491	TC	3	6	499806	499811	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_002491	TC	3	6	504169	504174	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_002491	TC	3	6	504555	504560	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_002491	TC	4	8	504609	504616	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_002491	GA	3	6	504633	504638	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_002491	AG	3	6	507483	507488	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_002491	CA	3	6	512266	512271	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_002491	TC	3	6	518554	518559	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_002491	GA	3	6	521030	521035	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_002491	GA	5	10	521045	521054	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_002491	AG	4	8	523411	523418	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_002491	GT	3	6	528299	528304	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_002491	TA	3	6	530411	530416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_002491	TA	3	6	530476	530481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_002491	AT	3	6	538868	538873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_002491	TA	3	6	544732	544737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_002491	AG	3	6	544764	544769	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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324	NC_002491	CT	3	6	1224211	1224216	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.