MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae J138 chromosome

Total Repeats: 2993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002491	ATG	2	6	210725	210730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_002491	TGG	2	6	210763	210768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
503	NC_002491	GAT	2	6	212803	212808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_002491	CTT	2	6	212872	212877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_002491	ACC	2	6	212939	212944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
506	NC_002491	AGC	2	6	212993	212998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_002491	AG	4	8	213018	213025	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
508	NC_002491	GAAG	2	8	213060	213067	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
509	NC_002491	CAT	2	6	213097	213102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_002491	CTT	2	6	213115	213120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_002491	T	6	6	213185	213190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_002491	AAG	2	6	213219	213224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_002491	TCT	2	6	213247	213252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_002491	CTT	2	6	213265	213270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_002491	GAAG	2	8	213297	213304	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
516	NC_002491	TTG	2	6	213617	213622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_002491	TTC	2	6	213677	213682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_002491	TG	3	6	213735	213740	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
519	NC_002491	TTGA	2	8	213770	213777	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
520	NC_002491	T	6	6	213830	213835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_002491	A	6	6	213836	213841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_002491	CAG	2	6	214387	214392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_002491	TTA	2	6	214503	214508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_002491	CTT	2	6	216219	216224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_002491	CT	3	6	217125	217130	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
526	NC_002491	CAA	2	6	217155	217160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_002491	AT	3	6	217251	217256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_002491	A	6	6	217258	217263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_002491	ACCC	2	8	217274	217281	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
530	NC_002491	GA	3	6	217375	217380	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
531	NC_002491	TTA	2	6	218799	218804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_002491	CAA	2	6	218819	218824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_002491	TAA	2	6	218830	218835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_002491	ATC	2	6	218844	218849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_002491	TA	3	6	218868	218873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_002491	AAT	2	6	218876	218881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_002491	TCT	2	6	220825	220830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_002491	CTA	2	6	222131	222136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_002491	ACT	2	6	222202	222207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_002491	ATA	2	6	222211	222216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_002491	AT	3	6	222225	222230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_002491	TTA	2	6	222254	222259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_002491	TTCTT	2	10	222264	222273	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
544	NC_002491	AT	3	6	222353	222358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_002491	CCT	2	6	222370	222375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
546	NC_002491	TCA	2	6	222382	222387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_002491	GAT	2	6	222410	222415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_002491	AT	3	6	222419	222424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_002491	ACA	2	6	222478	222483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_002491	T	9	9	223760	223768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_002491	ACTC	2	8	223776	223783	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
552	NC_002491	CAA	2	6	223798	223803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_002491	ATT	2	6	224679	224684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_002491	T	6	6	224693	224698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_002491	AATA	2	8	224704	224711	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_002491	A	6	6	224711	224716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_002491	GCA	3	9	226066	226074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_002491	ACT	2	6	226106	226111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_002491	CTG	2	6	226177	226182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_002491	CTG	2	6	226264	226269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_002491	TCT	2	6	226301	226306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_002491	GCCT	2	8	226364	226371	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
563	NC_002491	TACC	2	8	226418	226425	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
564	NC_002491	ATT	2	6	226440	226445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_002491	TTC	2	6	226620	226625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_002491	T	6	6	226639	226644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_002491	TCT	2	6	226677	226682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_002491	CT	3	6	226681	226686	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
569	NC_002491	TAAT	2	8	229473	229480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_002491	ATTAA	2	10	229506	229515	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_002491	TTA	2	6	229516	229521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_002491	GCT	2	6	230905	230910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_002491	AGC	2	6	230913	230918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_002491	ATTT	2	8	232267	232274	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_002491	TTTTC	2	10	232805	232814	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
576	NC_002491	T	6	6	232819	232824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_002491	TC	4	8	235494	235501	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
578	NC_002491	AAAG	2	8	235539	235546	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
579	NC_002491	TTA	2	6	237173	237178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_002491	AAG	2	6	238505	238510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_002491	T	8	8	238525	238532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_002491	TTC	2	6	238546	238551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_002491	AAG	2	6	238576	238581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_002491	TCT	2	6	238584	238589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_002491	TA	3	6	238591	238596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_002491	GAA	2	6	238608	238613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
587	NC_002491	AGTA	2	8	238616	238623	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
588	NC_002491	CCT	2	6	238643	238648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
589	NC_002491	AAT	2	6	238675	238680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_002491	CCA	2	6	238703	238708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
591	NC_002491	TA	3	6	238772	238777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_002491	TTTAA	2	10	240423	240432	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_002491	ACT	2	6	240477	240482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_002491	A	7	7	240507	240513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_002491	CTTC	2	8	240540	240547	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
596	NC_002491	T	6	6	240556	240561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_002491	TC	3	6	240651	240656	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
598	NC_002491	A	7	7	241612	241618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_002491	TC	3	6	244168	244173	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
600	NC_002491	ATG	2	6	244196	244201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_002491	A	7	7	244206	244212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_002491	T	6	6	244240	244245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_002491	CCT	2	6	244306	244311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
604	NC_002491	A	7	7	244338	244344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_002491	ATT	2	6	244368	244373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_002491	CAA	2	6	244443	244448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_002491	TCCCCC	2	12	244585	244596	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
608	NC_002491	A	7	7	244597	244603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_002491	AAG	2	6	245631	245636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_002491	A	7	7	245663	245669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_002491	AGA	2	6	245690	245695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_002491	AGA	2	6	245970	245975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_002491	ATCA	2	8	246785	246792	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
614	NC_002491	TA	3	6	248249	248254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_002491	ACC	2	6	248310	248315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
616	NC_002491	CT	3	6	248340	248345	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
617	NC_002491	GAA	2	6	248363	248368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_002491	TTG	2	6	248388	248393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_002491	TTC	2	6	248396	248401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_002491	A	7	7	248473	248479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_002491	GAT	2	6	248527	248532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_002491	CATGC	2	10	250366	250375	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
623	NC_002491	AG	3	6	250443	250448	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
624	NC_002491	T	6	6	250514	250519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_002491	TTA	2	6	250538	250543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_002491	AG	3	6	250599	250604	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
627	NC_002491	ATT	2	6	250611	250616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_002491	AAC	2	6	250633	250638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_002491	AAACAA	2	12	250907	250918	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
630	NC_002491	GAA	2	6	250925	250930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_002491	CAAC	2	8	250945	250952	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
632	NC_002491	TA	3	6	250961	250966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_002491	CTT	2	6	250981	250986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_002491	TAA	2	6	251003	251008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_002491	TAG	2	6	252008	252013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
636	NC_002491	TC	3	6	252023	252028	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
637	NC_002491	CT	3	6	252045	252050	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
638	NC_002491	CAA	2	6	252382	252387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_002491	TCT	2	6	252410	252415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_002491	ATTTT	2	10	252423	252432	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_002491	A	6	6	252478	252483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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