MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni NCTC 11168 = ATCC 700819 chromosome

Total Repeats: 476

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002163	AAAT	2	8	1339	1346	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002163	TAAT	2	8	6559	6566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002163	TAAT	2	8	6568	6575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002163	ATTT	3	12	8040	8051	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_002163	AAAT	2	8	17497	17504	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_002163	TTTA	2	8	19825	19832	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_002163	TGAT	2	8	27372	27379	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_002163	AAGG	2	8	29716	29723	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_002163	TTAT	2	8	37634	37641	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_002163	TTTA	2	8	38839	38846	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_002163	CTAT	2	8	39238	39245	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_002163	ATTT	2	8	41112	41119	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002163	CAAG	2	8	41268	41275	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_002163	TAGC	2	8	41934	41941	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_002163	CTTA	2	8	42596	42603	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_002163	AAAG	2	8	42667	42674	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_002163	AGTA	2	8	42727	42734	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_002163	TAAT	2	8	42850	42857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_002163	GGAT	2	8	43120	43127	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_002163	GGTG	2	8	43205	43212	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
21	NC_002163	TCCC	2	8	43347	43354	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
22	NC_002163	TCGT	2	8	43895	43902	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_002163	ATTT	2	8	44923	44930	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002163	TAAA	2	8	56466	56473	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_002163	TAAA	2	8	61323	61330	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_002163	GATT	2	8	66568	66575	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_002163	ATTT	2	8	66803	66810	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_002163	AGAA	2	8	66906	66913	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_002163	TCTT	2	8	67581	67588	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_002163	AATT	2	8	68516	68523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002163	AAAT	2	8	70171	70178	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_002163	GTTT	2	8	71835	71842	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_002163	TATT	2	8	73458	73465	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_002163	ATTT	2	8	79753	79760	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_002163	AAAT	2	8	79786	79793	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_002163	TTTA	2	8	81955	81962	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_002163	TTTA	2	8	83260	83267	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_002163	CTTG	2	8	83813	83820	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_002163	TAAA	2	8	88856	88863	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002163	ATCA	2	8	94185	94192	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_002163	AATT	2	8	95006	95013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_002163	ATTT	2	8	95053	95060	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_002163	TAAA	2	8	95062	95069	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002163	TAAA	2	8	95883	95890	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002163	AGGA	2	8	100690	100697	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_002163	ATTA	2	8	118676	118683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_002163	AAGG	2	8	132993	133000	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_002163	ATTT	2	8	146580	146587	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_002163	CTTT	2	8	152033	152040	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_002163	CAAA	2	8	165626	165633	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_002163	TTAA	2	8	165661	165668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_002163	AAAT	2	8	165677	165684	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002163	TAAA	2	8	166268	166275	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_002163	ATTT	2	8	193657	193664	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_002163	TTTA	2	8	196054	196061	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_002163	ATTG	2	8	197234	197241	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_002163	AAGA	2	8	197486	197493	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_002163	TGAT	2	8	205933	205940	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_002163	TAAA	2	8	206049	206056	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_002163	ATCA	2	8	206694	206701	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_002163	CAAG	2	8	207340	207347	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_002163	TTTA	2	8	207646	207653	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_002163	AAAT	2	8	208704	208711	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_002163	CAAG	2	8	209026	209033	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_002163	TAAA	2	8	209196	209203	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_002163	TAAA	2	8	213469	213476	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_002163	TAAA	2	8	213522	213529	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_002163	TAAA	2	8	218461	218468	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_002163	TAAA	2	8	219282	219289	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_002163	GGTT	2	8	219368	219375	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_002163	TTTA	2	8	224127	224134	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_002163	ATTA	3	12	224725	224736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_002163	TAGT	2	8	227312	227319	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_002163	TTTG	2	8	227427	227434	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_002163	AAGC	2	8	227809	227816	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_002163	ACCC	2	8	228209	228216	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
77	NC_002163	TAAA	2	8	228347	228354	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_002163	TTGA	2	8	228618	228625	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_002163	TAAT	2	8	228637	228644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_002163	ATTT	2	8	228837	228844	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_002163	ATTA	2	8	228924	228931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_002163	TAAA	2	8	231759	231766	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_002163	TTTG	2	8	231792	231799	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_002163	AAAG	2	8	238809	238816	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_002163	GTTT	2	8	245221	245228	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_002163	TCCC	2	8	245305	245312	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
87	NC_002163	TTGA	2	8	245355	245362	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_002163	AAAT	2	8	254915	254922	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_002163	CTTT	2	8	264865	264872	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_002163	TTAA	2	8	266570	266577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_002163	ATTG	2	8	267401	267408	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_002163	GCAA	2	8	267496	267503	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_002163	ATCC	2	8	268058	268065	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_002163	ATGA	2	8	273173	273180	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_002163	AAGT	2	8	273183	273190	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_002163	AATA	2	8	293921	293928	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_002163	AAAG	2	8	301834	301841	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_002163	TAAA	2	8	302228	302235	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_002163	TTTA	2	8	303081	303088	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_002163	TAAA	2	8	314144	314151	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_002163	ATTT	2	8	315372	315379	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_002163	TAAA	2	8	324104	324111	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_002163	ATAA	2	8	325887	325894	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_002163	ATTA	2	8	325926	325933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_002163	ATTT	2	8	325956	325963	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_002163	TAAA	2	8	330801	330808	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_002163	TATT	2	8	339345	339352	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_002163	TTTA	2	8	371623	371630	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_002163	TAAA	2	8	380835	380842	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_002163	AAGG	2	8	383463	383470	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_002163	TTTA	2	8	383898	383905	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_002163	ATTA	2	8	387107	387114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_002163	TTTA	2	8	387149	387156	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_002163	AAGT	2	8	388477	388484	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_002163	AATT	2	8	388491	388498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_002163	AATT	2	8	388525	388532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_002163	TTTA	2	8	393720	393727	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_002163	CTAT	2	8	394119	394126	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_002163	ATTT	2	8	395993	396000	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_002163	CAAG	2	8	396149	396156	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_002163	TAGC	2	8	396815	396822	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_002163	CTTA	2	8	397477	397484	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_002163	AAAG	2	8	397548	397555	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_002163	AGTA	2	8	397608	397615	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_002163	TAAT	2	8	397731	397738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_002163	GGAT	2	8	398001	398008	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_002163	GGTG	2	8	398086	398093	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
128	NC_002163	TCCC	2	8	398228	398235	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
129	NC_002163	TCGT	2	8	398776	398783	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_002163	TTAC	2	8	399756	399763	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_002163	GATA	2	8	403827	403834	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_002163	TTAA	2	8	405023	405030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_002163	TTAA	2	8	405044	405051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_002163	ATTT	2	8	405140	405147	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_002163	ATCT	2	8	405158	405165	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_002163	GTTT	2	8	405246	405253	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_002163	TTAA	2	8	412265	412272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_002163	AATT	2	8	412334	412341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_002163	TTGA	2	8	412937	412944	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_002163	AACT	2	8	413293	413300	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_002163	GATT	2	8	413428	413435	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_002163	CAAG	2	8	413456	413463	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_002163	TTTG	2	8	413587	413594	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_002163	ATTT	2	8	413615	413622	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_002163	GAAG	2	8	414392	414399	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_002163	ATAA	2	8	414497	414504	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_002163	CTTT	2	8	420612	420619	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_002163	ATAA	2	8	420798	420805	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_002163	ATTT	2	8	433942	433949	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_002163	ATTT	2	8	434382	434389	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_002163	ATTT	2	8	451269	451276	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_002163	AAAT	2	8	451863	451870	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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445	NC_002163	AAGG	2	8	1546484	1546491	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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449	NC_002163	ATTA	2	8	1555955	1555962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
450	NC_002163	ATTT	2	8	1555966	1555973	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_002163	GGGA	2	8	1575069	1575076	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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455	NC_002163	TGAT	2	8	1580151	1580158	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_002163	ATTT	2	8	1594858	1594865	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
462	NC_002163	TAAA	2	8	1596864	1596871	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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465	NC_002163	TAAA	2	8	1609476	1609483	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
466	NC_002163	ATAA	2	8	1609577	1609584	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
467	NC_002163	GTTA	2	8	1620724	1620731	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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473	NC_002163	TTAT	2	8	1636349	1636356	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.