MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae CWL029 chromosome

Total Repeats: 458

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000922	TCTT	2	8	512	519	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_000922	GTCT	2	8	3851	3858	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_000922	CTAC	2	8	3965	3972	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_000922	GCTT	2	8	4062	4069	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_000922	TCGC	2	8	10528	10535	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_000922	CGTA	2	8	11799	11806	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_000922	TTTA	2	8	13182	13189	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_000922	GCAG	2	8	14522	14529	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_000922	TTCT	2	8	14803	14810	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_000922	AGAA	2	8	14908	14915	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_000922	AAGA	2	8	15390	15397	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_000922	GATG	2	8	15466	15473	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_000922	AGGC	2	8	15526	15533	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_000922	TGGT	2	8	15613	15620	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_000922	TTTA	2	8	15722	15729	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_000922	TTGT	2	8	16073	16080	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_000922	ATTT	2	8	16442	16449	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_000922	CTTT	2	8	18525	18532	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_000922	ATCT	2	8	18533	18540	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_000922	GAAA	2	8	18550	18557	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_000922	CTAC	2	8	21546	21553	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_000922	AAAG	2	8	21969	21976	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_000922	GAGC	2	8	22142	22149	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_000922	CTAT	2	8	22280	22287	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_000922	AAAC	2	8	24632	24639	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_000922	ATTG	2	8	25184	25191	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_000922	ATGG	2	8	25817	25824	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_000922	TCAG	2	8	27097	27104	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_000922	CTAC	2	8	27682	27689	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_000922	CTAT	2	8	28720	28727	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_000922	GGGA	2	8	29219	29226	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
32	NC_000922	TGTC	2	8	42260	42267	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_000922	TTTC	2	8	43820	43827	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_000922	TTAT	2	8	44682	44689	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_000922	TATC	2	8	54254	54261	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_000922	TTTA	2	8	58301	58308	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_000922	AGTT	2	8	58399	58406	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_000922	AAGT	2	8	60783	60790	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_000922	TTTA	2	8	60811	60818	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_000922	CACC	2	8	60976	60983	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
41	NC_000922	TTCT	2	8	61198	61205	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_000922	AATC	2	8	61500	61507	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_000922	GTGG	3	12	61978	61989	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
44	NC_000922	GGAT	2	8	62124	62131	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_000922	AGAA	2	8	62134	62141	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_000922	TTCC	2	8	62668	62675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_000922	AGCA	2	8	62681	62688	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_000922	AGTG	2	8	62852	62859	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_000922	GAAG	2	8	63113	63120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_000922	GAAT	2	8	63181	63188	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_000922	GATA	2	8	66317	66324	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_000922	TCTT	2	8	70594	70601	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_000922	GCTT	2	8	70733	70740	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_000922	ATTT	2	8	70810	70817	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_000922	TTAA	2	8	70832	70839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_000922	TCCC	2	8	77775	77782	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
57	NC_000922	TAGA	2	8	77863	77870	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_000922	ATCG	2	8	78642	78649	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_000922	TTTG	2	8	78659	78666	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_000922	ATAA	2	8	80664	80671	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_000922	GTAC	2	8	80794	80801	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_000922	ATTT	2	8	80888	80895	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_000922	ATAG	2	8	82878	82885	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_000922	TAAT	2	8	84916	84923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_000922	TTAA	2	8	85147	85154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_000922	CTAT	2	8	87114	87121	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_000922	GCCA	2	8	89303	89310	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_000922	TAAG	2	8	89650	89657	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_000922	AAGC	2	8	89692	89699	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_000922	AGAA	2	8	89728	89735	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_000922	TAAG	2	8	93717	93724	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_000922	TAGT	2	8	104518	104525	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_000922	AGAT	2	8	104535	104542	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_000922	CAAA	2	8	104644	104651	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_000922	GAAA	2	8	112088	112095	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_000922	CTAA	2	8	127854	127861	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_000922	GAAT	2	8	132596	132603	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_000922	GTTG	2	8	133908	133915	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_000922	AAAT	2	8	137876	137883	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_000922	TCTT	2	8	137913	137920	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_000922	CGAA	2	8	138205	138212	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_000922	AAGT	2	8	138232	138239	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_000922	GATT	2	8	143774	143781	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_000922	GATT	2	8	156221	156228	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_000922	TTAA	2	8	156456	156463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_000922	CTAT	2	8	163392	163399	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_000922	TTTC	2	8	163413	163420	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_000922	TAGA	2	8	163472	163479	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_000922	AAGA	2	8	163805	163812	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_000922	ATGC	2	8	164115	164122	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_000922	AGAT	2	8	167367	167374	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_000922	GGAA	2	8	171405	171412	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_000922	ATGA	2	8	171432	171439	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_000922	AAGT	2	8	172326	172333	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_000922	TATC	2	8	172493	172500	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_000922	TCTA	2	8	172637	172644	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_000922	TTCT	2	8	182382	182389	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_000922	TTAT	2	8	182399	182406	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_000922	AAGT	2	8	182530	182537	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_000922	TTGT	2	8	183764	183771	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_000922	CTAT	2	8	183793	183800	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_000922	CATT	2	8	199405	199412	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_000922	CCTA	2	8	199452	199459	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_000922	TAAC	2	8	199699	199706	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_000922	CTAA	2	8	204714	204721	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_000922	TCAT	2	8	205889	205896	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_000922	AAAT	2	8	206409	206416	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_000922	AGAA	2	8	211027	211034	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_000922	GAAG	2	8	213674	213681	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_000922	TTGA	2	8	214147	214154	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_000922	ACCC	2	8	217651	217658	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
112	NC_000922	ACTC	2	8	224153	224160	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_000922	AATA	2	8	225081	225088	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_000922	TAAT	2	8	229858	229865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_000922	ATTT	2	8	232652	232659	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_000922	AAAG	2	8	235924	235931	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_000922	AGTA	2	8	239001	239008	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_000922	CTTC	2	8	240925	240932	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_000922	ACCA	2	8	245124	245131	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_000922	ACAG	2	8	245975	245982	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_000922	ATCA	2	8	247170	247177	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_000922	CAAC	2	8	251330	251337	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_000922	ACTT	2	8	251547	251554	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_000922	GTTT	2	8	251582	251589	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_000922	TGAT	2	8	251725	251732	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_000922	ACAA	2	8	251733	251740	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_000922	GATA	2	8	252120	252127	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_000922	ATTT	2	8	252875	252882	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_000922	ATGA	2	8	257063	257070	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_000922	AAAT	2	8	257141	257148	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_000922	GTGC	2	8	257610	257617	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_000922	GCAC	2	8	257739	257746	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_000922	TACC	2	8	259159	259166	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_000922	AAAC	2	8	259263	259270	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_000922	ATTT	2	8	260521	260528	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_000922	TTTA	2	8	260552	260559	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_000922	TAAT	2	8	260617	260624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_000922	TCCC	2	8	261445	261452	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
139	NC_000922	TAAA	2	8	261505	261512	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_000922	ATGA	2	8	262234	262241	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_000922	ATAA	2	8	270480	270487	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_000922	TAAC	2	8	271265	271272	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_000922	TTAC	2	8	277876	277883	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_000922	TAAG	2	8	277918	277925	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_000922	ATAA	2	8	278120	278127	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_000922	CTAT	2	8	280117	280124	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_000922	TTTA	2	8	280605	280612	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_000922	CTTC	2	8	281565	281572	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_000922	CAAA	2	8	283472	283479	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_000922	CTAA	2	8	285847	285854	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_000922	GTTA	2	8	287572	287579	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_000922	CTTG	2	8	287889	287896	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
153	NC_000922	TTGA	2	8	287969	287976	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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448	NC_000922	TTTA	2	8	1211383	1211390	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
449	NC_000922	TTTA	2	8	1211453	1211460	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
450	NC_000922	AAAT	2	8	1211461	1211468	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_000922	GAAA	2	8	1213658	1213665	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
452	NC_000922	TTTA	2	8	1220909	1220916	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_000922	TCTT	2	8	1221594	1221601	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
454	NC_000922	ATTT	2	8	1225719	1225726	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
455	NC_000922	ATTT	2	8	1227348	1227355	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
456	NC_000922	CGGA	2	8	1227548	1227555	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
457	NC_000922	GAAA	2	8	1227800	1227807	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
458	NC_000922	TTTA	2	8	1227915	1227922	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.