MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae CWL029 chromosome

Total Repeats: 3562

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_000922	AGA	2	6	779747	779752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_000922	ATA	2	6	779821	779826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_000922	A	8	8	779836	779843	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_000922	GAG	2	6	779876	779881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_000922	TA	5	10	779904	779913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_000922	A	6	6	779929	779934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_000922	TCT	2	6	780000	780005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2508	NC_000922	TAA	2	6	780020	780025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_000922	CGT	2	6	780142	780147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2510	NC_000922	ATAA	2	8	780177	780184	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_000922	CTT	2	6	781456	781461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2512	NC_000922	C	7	7	781483	781489	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2513	NC_000922	TCACA	2	10	781494	781503	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
2514	NC_000922	ATT	2	6	781517	781522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_000922	ATT	2	6	781577	781582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_000922	ACT	2	6	781585	781590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2517	NC_000922	CTTT	2	8	781679	781686	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2518	NC_000922	GTT	2	6	781729	781734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_000922	TTTTC	2	10	784738	784747	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2520	NC_000922	T	6	6	784756	784761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_000922	AG	3	6	784768	784773	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_000922	AG	3	6	784791	784796	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_000922	A	8	8	785026	785033	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_000922	AT	3	6	786689	786694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_000922	AG	3	6	786701	786706	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_000922	CGA	2	6	786729	786734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2527	NC_000922	A	6	6	786802	786807	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2528	NC_000922	TCT	2	6	786844	786849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2529	NC_000922	CGG	2	6	786891	786896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2530	NC_000922	ATC	2	6	786902	786907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2531	NC_000922	TA	3	6	786917	786922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_000922	TAC	2	6	793688	793693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2533	NC_000922	A	7	7	795711	795717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2534	NC_000922	TC	4	8	796191	796198	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2535	NC_000922	TC	3	6	796467	796472	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2536	NC_000922	TAAATA	2	12	796744	796755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_000922	TAA	2	6	796758	796763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_000922	GCA	2	6	799738	799743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2539	NC_000922	TTC	2	6	799800	799805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2540	NC_000922	TAAAAA	2	12	799836	799847	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_000922	AAT	2	6	799953	799958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_000922	AAT	2	6	801213	801218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_000922	GAA	2	6	801337	801342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_000922	TTC	2	6	801376	801381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2545	NC_000922	CTC	2	6	801423	801428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2546	NC_000922	GGAT	2	8	801472	801479	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_000922	CTT	2	6	801628	801633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2548	NC_000922	CAA	2	6	801641	801646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2549	NC_000922	A	6	6	804922	804927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2550	NC_000922	TAA	2	6	804936	804941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_000922	GTA	2	6	805001	805006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_000922	ATG	3	9	805707	805715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_000922	ATT	2	6	805797	805802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_000922	CTTT	2	8	805842	805849	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2555	NC_000922	AAAG	2	8	805894	805901	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_000922	ATTT	2	8	806909	806916	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_000922	ATTA	2	8	806933	806940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_000922	T	6	6	806954	806959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_000922	A	6	6	807311	807316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_000922	A	6	6	807491	807496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_000922	CTT	2	6	807535	807540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2562	NC_000922	TA	3	6	807548	807553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_000922	CCT	2	6	807568	807573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2564	NC_000922	A	6	6	807669	807674	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2565	NC_000922	T	7	7	810836	810842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_000922	GAA	2	6	810871	810876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_000922	ATTAAC	2	12	813410	813421	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2568	NC_000922	TAA	2	6	813424	813429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2569	NC_000922	ATT	2	6	813430	813435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2570	NC_000922	T	7	7	813434	813440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2571	NC_000922	A	6	6	813446	813451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2572	NC_000922	ATT	2	6	813498	813503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2573	NC_000922	T	6	6	813502	813507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2574	NC_000922	A	7	7	813526	813532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2575	NC_000922	AAAAT	2	10	813547	813556	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2576	NC_000922	ATT	2	6	813563	813568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2577	NC_000922	TCT	2	6	816236	816241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2579	NC_000922	GCT	2	6	816298	816303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2580	NC_000922	AATC	2	8	816323	816330	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2581	NC_000922	A	6	6	816347	816352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2582	NC_000922	AAG	2	6	816403	816408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2583	NC_000922	TATT	2	8	816427	816434	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2584	NC_000922	GT	3	6	816448	816453	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2588	NC_000922	A	6	6	818486	818491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2589	NC_000922	TAA	2	6	818492	818497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2590	NC_000922	TAT	2	6	818512	818517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_000922	A	6	6	818518	818523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2592	NC_000922	A	9	9	818525	818533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2593	NC_000922	TAA	2	6	818542	818547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2594	NC_000922	TTA	2	6	818574	818579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2597	NC_000922	AAAC	2	8	819948	819955	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2598	NC_000922	AGAA	2	8	821782	821789	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2599	NC_000922	CAG	2	6	821824	821829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2601	NC_000922	TA	3	6	821838	821843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_000922	TCT	2	6	821856	821861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2603	NC_000922	GAT	2	6	821882	821887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2604	NC_000922	AT	3	6	821896	821901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_000922	T	6	6	821901	821906	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_000922	TAT	2	6	821910	821915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2607	NC_000922	TTA	3	9	821987	821995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2608	NC_000922	TCAA	2	8	822037	822044	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2609	NC_000922	T	6	6	822984	822989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_000922	TCT	2	6	823023	823028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2611	NC_000922	A	8	8	823035	823042	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_000922	ATC	2	6	823759	823764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2613	NC_000922	TAAAA	2	10	823829	823838	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_000922	ATT	2	6	823912	823917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2615	NC_000922	TTC	2	6	824932	824937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2617	NC_000922	A	9	9	824991	824999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_000922	CA	3	6	825703	825708	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2619	NC_000922	A	7	7	825837	825843	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2620	NC_000922	TAGA	2	8	825896	825903	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_000922	A	6	6	825907	825912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_000922	GATT	2	8	836075	836082	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2623	NC_000922	T	6	6	836104	836109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2624	NC_000922	CAA	2	6	836145	836150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2625	NC_000922	TTG	2	6	836156	836161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2627	NC_000922	TAA	2	6	838436	838441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2628	NC_000922	ATG	2	6	838448	838453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2629	NC_000922	TGAA	2	8	838911	838918	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2630	NC_000922	T	6	6	840366	840371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2631	NC_000922	TTC	2	6	840373	840378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2632	NC_000922	AT	4	8	841421	841428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2633	NC_000922	ATA	2	6	841443	841448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2634	NC_000922	TCT	3	9	841452	841460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2635	NC_000922	TGT	2	6	841518	841523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2636	NC_000922	TTG	2	6	841552	841557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2637	NC_000922	A	6	6	841690	841695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2918	NC_000922	T	6	6	1000294	1000299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2919	NC_000922	A	7	7	1000302	1000308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2920	NC_000922	A	7	7	1000310	1000316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2921	NC_000922	A	7	7	1000342	1000348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2922	NC_000922	T	6	6	1000354	1000359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2951	NC_000922	AC	3	6	1001961	1001966	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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2954	NC_000922	TGA	2	6	1002049	1002054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2976	NC_000922	TAT	2	6	1003559	1003564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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