MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae CWL029 chromosome

Total Repeats: 3562

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_000922	TTA	2	6	259087	259092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_000922	TAAAA	2	10	259098	259107	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_000922	TACC	2	8	259159	259166	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1004	NC_000922	AAAC	2	8	259263	259270	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1005	NC_000922	A	6	6	260502	260507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_000922	ATTT	2	8	260521	260528	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_000922	A	7	7	260531	260537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_000922	TTTA	2	8	260552	260559	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_000922	CT	3	6	260572	260577	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1010	NC_000922	A	8	8	260591	260598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_000922	A	6	6	260611	260616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_000922	TAAT	2	8	260617	260624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_000922	T	6	6	260668	260673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_000922	A	9	9	260674	260682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_000922	T	6	6	260688	260693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_000922	AGC	2	6	261341	261346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_000922	A	6	6	261354	261359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_000922	TAG	2	6	261377	261382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_000922	TAT	3	9	261387	261395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_000922	TAA	2	6	261409	261414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_000922	TCCC	2	8	261445	261452	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1022	NC_000922	GAA	2	6	261496	261501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_000922	TAAA	2	8	261505	261512	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_000922	TA	3	6	261585	261590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_000922	ATTTT	2	10	261594	261603	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_000922	ATTAG	2	10	261611	261620	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_000922	A	6	6	262091	262096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_000922	TTC	2	6	262162	262167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_000922	ATGA	2	8	262234	262241	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_000922	CT	3	6	262271	262276	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_000922	AAG	2	6	262283	262288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_000922	CA	3	6	262327	262332	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1033	NC_000922	TC	4	8	262404	262411	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1034	NC_000922	T	7	7	262854	262860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_000922	TTA	2	6	262910	262915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_000922	A	8	8	263420	263427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_000922	ACC	2	6	263747	263752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1038	NC_000922	TTA	2	6	263755	263760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_000922	A	6	6	266152	266157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_000922	T	6	6	266180	266185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_000922	TTTAAG	2	12	266211	266222	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_000922	TTA	2	6	266295	266300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_000922	A	6	6	266304	266309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_000922	CTAAG	2	10	269128	269137	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1045	NC_000922	ATC	2	6	269171	269176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_000922	CAA	2	6	269200	269205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_000922	TCT	2	6	270131	270136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_000922	A	6	6	270192	270197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_000922	CTT	2	6	270208	270213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_000922	ATAA	2	8	270480	270487	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_000922	A	7	7	270486	270492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_000922	A	6	6	271249	271254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_000922	TAAC	2	8	271265	271272	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1054	NC_000922	TAA	2	6	271274	271279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_000922	TAAAA	2	10	271304	271313	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_000922	T	8	8	271317	271324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_000922	A	8	8	271334	271341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_000922	AAT	2	6	271367	271372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_000922	ATTTTA	2	12	274235	274246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1061	NC_000922	TTAC	2	8	277876	277883	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1062	NC_000922	TAAG	2	8	277918	277925	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_000922	TTA	2	6	277934	277939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_000922	AAT	2	6	278008	278013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_000922	TAA	2	6	278024	278029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_000922	AAATTT	2	12	278063	278074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_000922	ATAA	2	8	278120	278127	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_000922	T	6	6	279403	279408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_000922	GAA	2	6	279421	279426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_000922	GTT	2	6	280029	280034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_000922	ATT	2	6	280048	280053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_000922	ACT	2	6	280058	280063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1075	NC_000922	TAA	2	6	280580	280585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_000922	A	7	7	280584	280590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_000922	AAT	2	6	280594	280599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_000922	TTTA	2	8	280605	280612	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_000922	A	8	8	280615	280622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_000922	CTTTT	2	10	280669	280678	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1081	NC_000922	AT	3	6	280718	280723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_000922	AGT	2	6	280724	280729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_000922	TC	3	6	280826	280831	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1084	NC_000922	CTTC	2	8	281565	281572	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1085	NC_000922	A	7	7	281598	281604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1087	NC_000922	T	7	7	283464	283470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_000922	CAAA	2	8	283472	283479	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1089	NC_000922	T	6	6	283549	283554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_000922	GCT	2	6	283562	283567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_000922	CTAA	2	8	285847	285854	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1092	NC_000922	AGT	2	6	285874	285879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_000922	GTTA	2	8	287572	287579	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_000922	ATA	2	6	287672	287677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_000922	TAA	2	6	287712	287717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_000922	AATTC	2	10	287745	287754	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1097	NC_000922	AAG	2	6	287801	287806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_000922	CCT	2	6	287811	287816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1099	NC_000922	CAATC	2	10	287827	287836	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1100	NC_000922	CTTG	2	8	287889	287896	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1101	NC_000922	CAT	2	6	287903	287908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_000922	TTGA	2	8	287969	287976	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_000922	C	6	6	288000	288005	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1104	NC_000922	CCT	2	6	288032	288037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1105	NC_000922	AGC	2	6	288043	288048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_000922	CAT	3	9	288055	288063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_000922	GTA	2	6	288079	288084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_000922	TGATAT	2	12	288231	288242	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_000922	TCC	2	6	288244	288249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1110	NC_000922	TCC	2	6	288277	288282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1111	NC_000922	CAA	2	6	288291	288296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_000922	TCA	2	6	288365	288370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_000922	TTGA	2	8	288377	288384	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_000922	T	6	6	288426	288431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_000922	GTC	2	6	289280	289285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_000922	TGT	2	6	289304	289309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_000922	T	7	7	289314	289320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_000922	TAA	2	6	290175	290180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_000922	TAA	2	6	290209	290214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_000922	ATT	2	6	290226	290231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_000922	AAG	2	6	292154	292159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_000922	AACA	2	8	292205	292212	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1123	NC_000922	A	6	6	292212	292217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_000922	AT	3	6	292224	292229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_000922	TA	3	6	292276	292281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_000922	TCC	2	6	292391	292396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1127	NC_000922	GCA	2	6	292455	292460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_000922	C	6	6	292481	292486	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1129	NC_000922	T	6	6	292495	292500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_000922	CTTG	2	8	292543	292550	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1131	NC_000922	ACT	2	6	292600	292605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_000922	TTGGC	2	10	292632	292641	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1133	NC_000922	A	6	6	292646	292651	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_000922	ATT	2	6	292726	292731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_000922	GCTT	2	8	292880	292887	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1136	NC_000922	TAA	2	6	292912	292917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_000922	ATT	2	6	292969	292974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_000922	TGT	3	9	292975	292983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1140	NC_000922	TAA	3	9	293053	293061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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