MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D/UW-3/CX chromosome

Total Repeats: 330

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000117	TC	3	6	225	230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_000117	AG	3	6	247	252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_000117	TC	3	6	1670	1675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_000117	GA	3	6	6998	7003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_000117	TA	3	6	11248	11253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_000117	TA	3	6	13339	13344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_000117	TA	4	8	13563	13570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_000117	AG	3	6	17515	17520	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_000117	GA	3	6	17528	17533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_000117	CT	3	6	18450	18455	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_000117	AG	3	6	20516	20521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_000117	GA	3	6	20674	20679	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_000117	AG	3	6	21191	21196	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_000117	CT	3	6	21260	21265	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_000117	GA	3	6	26512	26517	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_000117	CT	3	6	26519	26524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_000117	TC	3	6	27887	27892	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_000117	AG	3	6	27970	27975	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_000117	GA	3	6	36384	36389	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_000117	AT	3	6	36486	36491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_000117	CT	3	6	38753	38758	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_000117	CT	3	6	40124	40129	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_000117	TC	3	6	43808	43813	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_000117	AG	3	6	48043	48048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_000117	TG	4	8	51391	51398	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_000117	GA	3	6	55601	55606	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_000117	GA	3	6	60679	60684	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_000117	AG	4	8	64704	64711	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_000117	TA	3	6	69035	69040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_000117	CT	3	6	71771	71776	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_000117	TA	3	6	85132	85137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_000117	GA	3	6	90485	90490	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_000117	CT	3	6	92835	92840	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_000117	GA	3	6	93363	93368	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_000117	TA	3	6	93980	93985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_000117	TC	3	6	99861	99866	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_000117	AT	3	6	99912	99917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_000117	TA	3	6	106588	106593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_000117	TG	3	6	115830	115835	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_000117	AG	4	8	118417	118424	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_000117	GA	3	6	120239	120244	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_000117	TA	3	6	122474	122479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_000117	GT	3	6	123463	123468	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_000117	CT	3	6	127996	128001	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_000117	TC	3	6	130318	130323	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_000117	AG	3	6	130395	130400	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_000117	AG	3	6	130420	130425	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_000117	TG	3	6	133227	133232	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_000117	AT	3	6	142376	142381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_000117	GA	3	6	151614	151619	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_000117	AG	3	6	157182	157187	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_000117	TC	3	6	171646	171651	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_000117	AG	3	6	171778	171783	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_000117	CT	3	6	171796	171801	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_000117	TG	3	6	178287	178292	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_000117	GA	3	6	183773	183778	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_000117	CA	3	6	185249	185254	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_000117	TC	3	6	191888	191893	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_000117	AT	3	6	192230	192235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_000117	AG	3	6	196702	196707	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_000117	TC	3	6	199693	199698	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_000117	CT	3	6	203451	203456	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_000117	GA	4	8	206510	206517	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_000117	CT	4	8	206558	206565	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_000117	AG	4	8	217831	217838	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_000117	TA	3	6	219385	219390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_000117	CT	3	6	221025	221030	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_000117	TC	3	6	224026	224031	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_000117	AG	3	6	224057	224062	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_000117	TC	3	6	238257	238262	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_000117	AG	3	6	238283	238288	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_000117	CA	3	6	243207	243212	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_000117	GT	3	6	243424	243429	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_000117	GA	3	6	250292	250297	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_000117	TG	3	6	250402	250407	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_000117	AG	3	6	251204	251209	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_000117	AG	3	6	252213	252218	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_000117	TA	3	6	254019	254024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_000117	AG	3	6	256300	256305	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_000117	TC	3	6	256326	256331	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_000117	AG	3	6	257804	257809	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_000117	TA	3	6	264167	264172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_000117	CA	3	6	265974	265979	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_000117	TC	3	6	267874	267879	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_000117	TA	3	6	273427	273432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_000117	AT	4	8	283987	283994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_000117	CT	3	6	284839	284844	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_000117	TC	4	8	284930	284937	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_000117	TC	3	6	286621	286626	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_000117	TC	3	6	286678	286683	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_000117	CT	3	6	287151	287156	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_000117	AT	3	6	299169	299174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_000117	CA	3	6	301498	301503	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_000117	GA	3	6	306229	306234	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_000117	AG	3	6	315435	315440	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_000117	CT	3	6	347386	347391	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_000117	CT	3	6	350457	350462	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_000117	TC	3	6	354683	354688	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_000117	TC	3	6	358513	358518	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_000117	CT	3	6	358599	358604	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_000117	AC	3	6	361932	361937	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_000117	GA	3	6	363842	363847	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_000117	TC	3	6	363920	363925	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_000117	TA	3	6	364121	364126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_000117	CT	4	8	381149	381156	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_000117	CA	3	6	392037	392042	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_000117	TC	3	6	394584	394589	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_000117	CT	3	6	395074	395079	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_000117	GA	3	6	395204	395209	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_000117	GA	3	6	395335	395340	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_000117	CT	3	6	409431	409436	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_000117	CT	3	6	410418	410423	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_000117	CT	3	6	429148	429153	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_000117	CT	3	6	430171	430176	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_000117	AG	3	6	430518	430523	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_000117	GA	3	6	432213	432218	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_000117	AC	3	6	436211	436216	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_000117	CT	3	6	440482	440487	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_000117	AC	3	6	440520	440525	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_000117	CA	3	6	442989	442994	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_000117	CT	3	6	444393	444398	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_000117	CT	3	6	453675	453680	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_000117	AG	3	6	459816	459821	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_000117	TC	3	6	466354	466359	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_000117	AT	3	6	466423	466428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_000117	GA	4	8	467797	467804	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_000117	TA	3	6	467840	467845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_000117	GA	3	6	467938	467943	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_000117	TC	3	6	479670	479675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_000117	AC	3	6	485201	485206	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_000117	GA	4	8	485246	485253	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_000117	CA	3	6	485283	485288	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_000117	TC	3	6	485324	485329	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_000117	AC	3	6	489759	489764	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_000117	AG	3	6	489921	489926	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_000117	CT	3	6	489940	489945	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_000117	CT	3	6	493219	493224	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_000117	CT	3	6	493737	493742	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_000117	TG	3	6	493770	493775	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_000117	TA	3	6	493883	493888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_000117	CT	4	8	499540	499547	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_000117	CA	3	6	507610	507615	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_000117	CT	3	6	508548	508553	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_000117	TA	3	6	514351	514356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_000117	AG	3	6	516249	516254	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_000117	TC	3	6	517095	517100	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_000117	GA	3	6	517250	517255	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_000117	AG	3	6	517286	517291	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_000117	AT	3	6	523518	523523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_000117	AC	3	6	534763	534768	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_000117	CT	3	6	536680	536685	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_000117	TC	4	8	540204	540211	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_000117	AT	3	6	540257	540262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_000117	TC	3	6	540973	540978	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.