MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Liberibacter americanus str. Sao Paulo

Total Repeats: 776

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022793	TCTCA	2	10	2052	2061	20 %	40 %	0 %	40 %	557822172
2	NC_022793	TGCGA	2	10	2253	2262	20 %	20 %	40 %	20 %	557822172
3	NC_022793	TTCTT	2	10	3252	3261	0 %	80 %	0 %	20 %	557822173
4	NC_022793	TATAA	2	10	5296	5305	60 %	40 %	0 %	0 %	557822175
5	NC_022793	GGAAT	2	10	5974	5983	40 %	20 %	40 %	0 %	557822176
6	NC_022793	TGAAT	2	10	7610	7619	40 %	40 %	20 %	0 %	557822177
7	NC_022793	ACGTA	2	10	8459	8468	40 %	20 %	20 %	20 %	557822177
8	NC_022793	CCAAG	2	10	9880	9889	40 %	0 %	20 %	40 %	557822178
9	NC_022793	GAAAA	2	10	12541	12550	80 %	0 %	20 %	0 %	557822179
10	NC_022793	TTAAA	2	10	15808	15817	60 %	40 %	0 %	0 %	557822183
11	NC_022793	AAAGC	2	10	15888	15897	60 %	0 %	20 %	20 %	557822183
12	NC_022793	AAAAG	2	10	16340	16349	80 %	0 %	20 %	0 %	557822183
13	NC_022793	AAGCA	2	10	17033	17042	60 %	0 %	20 %	20 %	557822184
14	NC_022793	CATTC	2	10	18232	18241	20 %	40 %	0 %	40 %	557822185
15	NC_022793	AACTT	2	10	18907	18916	40 %	40 %	0 %	20 %	557822186
16	NC_022793	ATTAA	2	10	19656	19665	60 %	40 %	0 %	0 %	557822186
17	NC_022793	AAAGG	2	10	22677	22686	60 %	0 %	40 %	0 %	557822189
18	NC_022793	CCAAT	2	10	23416	23425	40 %	20 %	0 %	40 %	557822189
19	NC_022793	AAGCA	2	10	23563	23572	60 %	0 %	20 %	20 %	557822189
20	NC_022793	AAAAC	2	10	24056	24065	80 %	0 %	0 %	20 %	557822189
21	NC_022793	ATTCA	2	10	28602	28611	40 %	40 %	0 %	20 %	557822193
22	NC_022793	AATCT	2	10	30162	30171	40 %	40 %	0 %	20 %	557822194
23	NC_022793	GCTAT	2	10	31590	31599	20 %	40 %	20 %	20 %	557822194
24	NC_022793	CCTAA	2	10	31764	31773	40 %	20 %	0 %	40 %	557822194
25	NC_022793	ATCTC	2	10	31776	31785	20 %	40 %	0 %	40 %	557822194
26	NC_022793	ATTAA	2	10	32109	32118	60 %	40 %	0 %	0 %	557822194
27	NC_022793	TCCCT	2	10	32715	32724	0 %	40 %	0 %	60 %	557822194
28	NC_022793	ACCAT	2	10	37372	37381	40 %	20 %	0 %	40 %	557822197
29	NC_022793	AGCTG	2	10	37675	37684	20 %	20 %	40 %	20 %	557822197
30	NC_022793	TCTTT	2	10	41511	41520	0 %	80 %	0 %	20 %	557822201
31	NC_022793	TTTGT	2	10	42176	42185	0 %	80 %	20 %	0 %	557822201
32	NC_022793	AGATA	2	10	42255	42264	60 %	20 %	20 %	0 %	557822201
33	NC_022793	ATAAA	2	10	43551	43560	80 %	20 %	0 %	0 %	557822203
34	NC_022793	GTACG	2	10	45534	45543	20 %	20 %	40 %	20 %	557822205
35	NC_022793	CATTC	2	10	46589	46598	20 %	40 %	0 %	40 %	557822205
36	NC_022793	ATGGA	2	10	46600	46609	40 %	20 %	40 %	0 %	557822205
37	NC_022793	GCAAT	2	10	46736	46745	40 %	20 %	20 %	20 %	557822205
38	NC_022793	AAGAA	2	10	47692	47701	80 %	0 %	20 %	0 %	557822205
39	NC_022793	ATAAA	2	10	49812	49821	80 %	20 %	0 %	0 %	557822207
40	NC_022793	AGATT	2	10	51159	51168	40 %	40 %	20 %	0 %	557822207
41	NC_022793	AGAAA	2	10	52080	52089	80 %	0 %	20 %	0 %	557822208
42	NC_022793	AAATA	2	10	53688	53697	80 %	20 %	0 %	0 %	557822210
43	NC_022793	CTATC	2	10	54221	54230	20 %	40 %	0 %	40 %	557822211
44	NC_022793	CATTC	2	10	54521	54530	20 %	40 %	0 %	40 %	557822211
45	NC_022793	CCAAT	2	10	60470	60479	40 %	20 %	0 %	40 %	557822215
46	NC_022793	TCTAA	2	10	60648	60657	40 %	40 %	0 %	20 %	557822215
47	NC_022793	CATCT	2	10	63117	63126	20 %	40 %	0 %	40 %	557822217
48	NC_022793	ATTTA	2	10	64181	64190	40 %	60 %	0 %	0 %	557822218
49	NC_022793	CAAAA	2	10	64714	64723	80 %	0 %	0 %	20 %	557822218
50	NC_022793	TGGCA	2	10	64787	64796	20 %	20 %	40 %	20 %	557822218
51	NC_022793	AATAA	2	10	65051	65060	80 %	20 %	0 %	0 %	557822218
52	NC_022793	TTTCT	2	10	65662	65671	0 %	80 %	0 %	20 %	557822219
53	NC_022793	ACATA	2	10	68463	68472	60 %	20 %	0 %	20 %	557822221
54	NC_022793	AGGAT	2	10	68826	68835	40 %	20 %	40 %	0 %	557822222
55	NC_022793	AAAAC	2	10	68870	68879	80 %	0 %	0 %	20 %	557822222
56	NC_022793	TTTTA	2	10	69469	69478	20 %	80 %	0 %	0 %	557822223
57	NC_022793	CAAAT	2	10	72140	72149	60 %	20 %	0 %	20 %	557822226
58	NC_022793	TCTAT	2	10	72931	72940	20 %	60 %	0 %	20 %	557822226
59	NC_022793	GAAAA	2	10	75225	75234	80 %	0 %	20 %	0 %	557822228
60	NC_022793	TTCCT	2	10	77253	77262	0 %	60 %	0 %	40 %	557822231
61	NC_022793	TCAAA	2	10	79714	79723	60 %	20 %	0 %	20 %	557822232
62	NC_022793	GAATT	2	10	80058	80067	40 %	40 %	20 %	0 %	557822232
63	NC_022793	TACTA	2	10	81542	81551	40 %	40 %	0 %	20 %	557822232
64	NC_022793	CAATC	2	10	83855	83864	40 %	20 %	0 %	40 %	557822234
65	NC_022793	CCAAT	2	10	84596	84605	40 %	20 %	0 %	40 %	557822235
66	NC_022793	GAAAA	2	10	89088	89097	80 %	0 %	20 %	0 %	557822237
67	NC_022793	AAAAG	2	10	95418	95427	80 %	0 %	20 %	0 %	557822241
68	NC_022793	CTGAT	2	10	95762	95771	20 %	40 %	20 %	20 %	557822241
69	NC_022793	ATCTT	2	10	102071	102080	20 %	60 %	0 %	20 %	557822243
70	NC_022793	TCATC	2	10	103458	103467	20 %	40 %	0 %	40 %	557822245
71	NC_022793	TTTTA	2	10	104356	104365	20 %	80 %	0 %	0 %	557822245
72	NC_022793	TTTTA	2	10	109603	109612	20 %	80 %	0 %	0 %	557822249
73	NC_022793	ATTGG	2	10	110459	110468	20 %	40 %	40 %	0 %	557822249
74	NC_022793	GAATA	2	10	112594	112603	60 %	20 %	20 %	0 %	557822251
75	NC_022793	TAATG	2	10	114465	114474	40 %	40 %	20 %	0 %	557822253
76	NC_022793	TCAGA	2	10	115650	115659	40 %	20 %	20 %	20 %	557822254
77	NC_022793	AAAAT	2	10	115905	115914	80 %	20 %	0 %	0 %	557822254
78	NC_022793	TACAA	2	10	117239	117248	60 %	20 %	0 %	20 %	557822254
79	NC_022793	TATCG	2	10	120950	120959	20 %	40 %	20 %	20 %	557822257
80	NC_022793	GCAAA	2	10	121453	121462	60 %	0 %	20 %	20 %	557822257
81	NC_022793	ATAGA	2	10	122901	122910	60 %	20 %	20 %	0 %	557822259
82	NC_022793	CTAAT	2	10	123771	123780	40 %	40 %	0 %	20 %	557822260
83	NC_022793	TTCTT	2	10	124397	124406	0 %	80 %	0 %	20 %	557822260
84	NC_022793	TCATA	2	10	127030	127039	40 %	40 %	0 %	20 %	557822261
85	NC_022793	TAGTT	2	10	131552	131561	20 %	60 %	20 %	0 %	557822265
86	NC_022793	ATGAT	2	10	136257	136266	40 %	40 %	20 %	0 %	557822270
87	NC_022793	TTTTA	2	10	138702	138711	20 %	80 %	0 %	0 %	557822273
88	NC_022793	AAAAC	2	10	140010	140019	80 %	0 %	0 %	20 %	557822274
89	NC_022793	AGTAA	2	10	141982	141991	60 %	20 %	20 %	0 %	557822276
90	NC_022793	ATCTT	2	10	144313	144322	20 %	60 %	0 %	20 %	557822279
91	NC_022793	ATTCC	2	10	144731	144740	20 %	40 %	0 %	40 %	557822279
92	NC_022793	TAAAA	2	10	146217	146226	80 %	20 %	0 %	0 %	557822280
93	NC_022793	TAACA	2	10	146495	146504	60 %	20 %	0 %	20 %	557822281
94	NC_022793	TCAAC	2	10	154255	154264	40 %	20 %	0 %	40 %	557822283
95	NC_022793	AAATT	2	10	158913	158922	60 %	40 %	0 %	0 %	557822285
96	NC_022793	TAACG	2	10	159178	159187	40 %	20 %	20 %	20 %	557822285
97	NC_022793	GGATT	2	10	161242	161251	20 %	40 %	40 %	0 %	557822287
98	NC_022793	TATAA	2	10	161881	161890	60 %	40 %	0 %	0 %	557822287
99	NC_022793	AAAAT	2	10	161893	161902	80 %	20 %	0 %	0 %	557822287
100	NC_022793	GAAAA	2	10	162138	162147	80 %	0 %	20 %	0 %	557822287
101	NC_022793	AAAAT	2	10	162896	162905	80 %	20 %	0 %	0 %	557822287
102	NC_022793	ACAAA	2	10	163225	163234	80 %	0 %	0 %	20 %	557822287
103	NC_022793	GAGCA	2	10	164931	164940	40 %	0 %	40 %	20 %	557822288
104	NC_022793	ATTTA	2	10	165553	165562	40 %	60 %	0 %	0 %	557822288
105	NC_022793	TTATT	2	10	167381	167390	20 %	80 %	0 %	0 %	557822289
106	NC_022793	CTTTT	2	10	168239	168248	0 %	80 %	0 %	20 %	557822290
107	NC_022793	AGCAT	2	10	169096	169105	40 %	20 %	20 %	20 %	557822291
108	NC_022793	TATCT	2	10	170223	170232	20 %	60 %	0 %	20 %	557822292
109	NC_022793	AAGTA	2	10	170814	170823	60 %	20 %	20 %	0 %	557822292
110	NC_022793	GTCCT	2	10	170901	170910	0 %	40 %	20 %	40 %	557822292
111	NC_022793	AACAA	2	10	173512	173521	80 %	0 %	0 %	20 %	557822294
112	NC_022793	TTTTA	2	10	173633	173642	20 %	80 %	0 %	0 %	557822294
113	NC_022793	ATTTT	2	10	176537	176546	20 %	80 %	0 %	0 %	557822298
114	NC_022793	AACAA	2	10	179446	179455	80 %	0 %	0 %	20 %	557822301
115	NC_022793	TTGAT	2	10	179807	179816	20 %	60 %	20 %	0 %	557822301
116	NC_022793	ATATT	2	10	180725	180734	40 %	60 %	0 %	0 %	557822301
117	NC_022793	TGGAT	2	10	181966	181975	20 %	40 %	40 %	0 %	557822302
118	NC_022793	AAAAT	2	10	182519	182528	80 %	20 %	0 %	0 %	557822302
119	NC_022793	ATATT	2	10	182663	182672	40 %	60 %	0 %	0 %	557822303
120	NC_022793	CCAAT	2	10	188563	188572	40 %	20 %	0 %	40 %	557822308
121	NC_022793	AATAT	2	10	189126	189135	60 %	40 %	0 %	0 %	557822308
122	NC_022793	CAAAA	2	10	189479	189488	80 %	0 %	0 %	20 %	557822309
123	NC_022793	AAATC	2	10	190493	190502	60 %	20 %	0 %	20 %	557822310
124	NC_022793	ATATA	2	10	194766	194775	60 %	40 %	0 %	0 %	557822314
125	NC_022793	TATTT	2	10	195317	195326	20 %	80 %	0 %	0 %	557822315
126	NC_022793	CTCTT	2	10	195341	195350	0 %	60 %	0 %	40 %	557822315
127	NC_022793	ATTTT	2	10	195803	195812	20 %	80 %	0 %	0 %	557822316
128	NC_022793	TGAAA	2	10	198318	198327	60 %	20 %	20 %	0 %	557822318
129	NC_022793	TTTCT	2	10	199894	199903	0 %	80 %	0 %	20 %	557822320
130	NC_022793	TAAAC	2	10	200919	200928	60 %	20 %	0 %	20 %	557822322
131	NC_022793	CAATT	2	10	201461	201470	40 %	40 %	0 %	20 %	557822322
132	NC_022793	TGGCA	2	10	202088	202097	20 %	20 %	40 %	20 %	557822322
133	NC_022793	TTGCA	2	10	202749	202758	20 %	40 %	20 %	20 %	557822323
134	NC_022793	ATTAT	2	10	204122	204131	40 %	60 %	0 %	0 %	557822324
135	NC_022793	ATATT	2	10	204468	204477	40 %	60 %	0 %	0 %	557822324
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