MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Caldiarchaeum subterraneum DNA

Total Repeats: 2940

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022786	CTTT	2	8	186	193	0 %	75 %	0 %	25 %	557693446
2	NC_022786	ATCT	2	8	545	552	25 %	50 %	0 %	25 %	557693446
3	NC_022786	AGGA	2	8	803	810	50 %	0 %	50 %	0 %	557693446
4	NC_022786	AGCG	2	8	907	914	25 %	0 %	50 %	25 %	557693446
5	NC_022786	CCAT	2	8	2372	2379	25 %	25 %	0 %	50 %	557693447
6	NC_022786	GCAT	2	8	3760	3767	25 %	25 %	25 %	25 %	557693449
7	NC_022786	TCTT	2	8	3910	3917	0 %	75 %	0 %	25 %	557693449
8	NC_022786	TGGA	2	8	4307	4314	25 %	25 %	50 %	0 %	557693450
9	NC_022786	GTCT	2	8	4371	4378	0 %	50 %	25 %	25 %	557693450
10	NC_022786	CCGG	2	8	4656	4663	0 %	0 %	50 %	50 %	557693451
11	NC_022786	TCAA	2	8	6316	6323	50 %	25 %	0 %	25 %	557693454
12	NC_022786	ATGT	2	8	7136	7143	25 %	50 %	25 %	0 %	557693456
13	NC_022786	CATC	2	8	8084	8091	25 %	25 %	0 %	50 %	557693457
14	NC_022786	CTTC	2	8	8386	8393	0 %	50 %	0 %	50 %	557693458
15	NC_022786	TTTC	2	8	8865	8872	0 %	75 %	0 %	25 %	557693458
16	NC_022786	CCTT	2	8	9894	9901	0 %	50 %	0 %	50 %	557693458
17	NC_022786	TGTT	2	8	10342	10349	0 %	75 %	25 %	0 %	557693459
18	NC_022786	CCAT	2	8	10620	10627	25 %	25 %	0 %	50 %	557693459
19	NC_022786	GCCA	2	8	11792	11799	25 %	0 %	25 %	50 %	557693460
20	NC_022786	CAAC	2	8	12555	12562	50 %	0 %	0 %	50 %	557693461
21	NC_022786	CACC	2	8	12738	12745	25 %	0 %	0 %	75 %	557693461
22	NC_022786	TGGC	2	8	13714	13721	0 %	25 %	50 %	25 %	557693462
23	NC_022786	GCTG	2	8	13790	13797	0 %	25 %	50 %	25 %	557693462
24	NC_022786	AAGG	2	8	15027	15034	50 %	0 %	50 %	0 %	557693464
25	NC_022786	GCTG	2	8	15308	15315	0 %	25 %	50 %	25 %	557693464
26	NC_022786	TGGT	2	8	15625	15632	0 %	50 %	50 %	0 %	557693464
27	NC_022786	CTGT	2	8	15921	15928	0 %	50 %	25 %	25 %	557693465
28	NC_022786	TCTT	2	8	16443	16450	0 %	75 %	0 %	25 %	557693465
29	NC_022786	TTTG	2	8	18482	18489	0 %	75 %	25 %	0 %	557693468
30	NC_022786	TAGA	2	8	18572	18579	50 %	25 %	25 %	0 %	557693468
31	NC_022786	TGTC	2	8	18943	18950	0 %	50 %	25 %	25 %	557693468
32	NC_022786	TTTC	2	8	19187	19194	0 %	75 %	0 %	25 %	557693468
33	NC_022786	GCCT	2	8	19797	19804	0 %	25 %	25 %	50 %	557693469
34	NC_022786	GCAG	2	8	19805	19812	25 %	0 %	50 %	25 %	557693469
35	NC_022786	CGCC	2	8	19837	19844	0 %	0 %	25 %	75 %	557693469
36	NC_022786	AGCC	2	8	20021	20028	25 %	0 %	25 %	50 %	557693469
37	NC_022786	GGAA	2	8	21425	21432	50 %	0 %	50 %	0 %	557693470
38	NC_022786	GGCT	2	8	21796	21803	0 %	25 %	50 %	25 %	557693470
39	NC_022786	AGGA	2	8	21893	21900	50 %	0 %	50 %	0 %	557693470
40	NC_022786	CCCT	2	8	22866	22873	0 %	25 %	0 %	75 %	557693470
41	NC_022786	ACTA	2	8	22921	22928	50 %	25 %	0 %	25 %	557693470
42	NC_022786	ATAG	2	8	23536	23543	50 %	25 %	25 %	0 %	557693470
43	NC_022786	ATAC	2	8	23784	23791	50 %	25 %	0 %	25 %	557693470
44	NC_022786	TGAT	2	8	23999	24006	25 %	50 %	25 %	0 %	557693470
45	NC_022786	AAGA	2	8	24263	24270	75 %	0 %	25 %	0 %	557693471
46	NC_022786	GGGA	2	8	24404	24411	25 %	0 %	75 %	0 %	557693471
47	NC_022786	TGGT	2	8	24624	24631	0 %	50 %	50 %	0 %	557693471
48	NC_022786	CTCC	2	8	25327	25334	0 %	25 %	0 %	75 %	557693471
49	NC_022786	TACC	2	8	25343	25350	25 %	25 %	0 %	50 %	557693471
50	NC_022786	ATCA	2	8	25377	25384	50 %	25 %	0 %	25 %	557693471
51	NC_022786	TAGA	2	8	25500	25507	50 %	25 %	25 %	0 %	557693471
52	NC_022786	GAAG	2	8	25508	25515	50 %	0 %	50 %	0 %	557693471
53	NC_022786	AATG	2	8	25988	25995	50 %	25 %	25 %	0 %	557693471
54	NC_022786	GATA	2	8	26437	26444	50 %	25 %	25 %	0 %	557693471
55	NC_022786	TCTA	2	8	29591	29598	25 %	50 %	0 %	25 %	557693475
56	NC_022786	GATT	2	8	30010	30017	25 %	50 %	25 %	0 %	557693475
57	NC_022786	GAAA	2	8	31961	31968	75 %	0 %	25 %	0 %	557693476
58	NC_022786	CTTT	2	8	32607	32614	0 %	75 %	0 %	25 %	557693476
59	NC_022786	TAGC	2	8	32675	32682	25 %	25 %	25 %	25 %	557693476
60	NC_022786	GAAA	2	8	33057	33064	75 %	0 %	25 %	0 %	557693477
61	NC_022786	ATTC	2	8	36765	36772	25 %	50 %	0 %	25 %	557693479
62	NC_022786	TATG	2	8	36777	36784	25 %	50 %	25 %	0 %	557693479
63	NC_022786	TAAT	3	12	37353	37364	50 %	50 %	0 %	0 %	557693480
64	NC_022786	TCAG	2	8	37886	37893	25 %	25 %	25 %	25 %	557693481
65	NC_022786	TATG	2	8	38416	38423	25 %	50 %	25 %	0 %	557693481
66	NC_022786	GGGT	2	8	39942	39949	0 %	25 %	75 %	0 %	557693482
67	NC_022786	CTGG	2	8	40330	40337	0 %	25 %	50 %	25 %	557693483
68	NC_022786	TCAG	2	8	40953	40960	25 %	25 %	25 %	25 %	557693483
69	NC_022786	GATG	2	8	42668	42675	25 %	25 %	50 %	0 %	557693485
70	NC_022786	CATC	2	8	43729	43736	25 %	25 %	0 %	50 %	557693485
71	NC_022786	GAAT	2	8	44083	44090	50 %	25 %	25 %	0 %	557693485
72	NC_022786	GCCT	2	8	44263	44270	0 %	25 %	25 %	50 %	557693485
73	NC_022786	GATG	2	8	44639	44646	25 %	25 %	50 %	0 %	557693485
74	NC_022786	ATGG	2	8	45285	45292	25 %	25 %	50 %	0 %	557693487
75	NC_022786	AGGC	2	8	46061	46068	25 %	0 %	50 %	25 %	557693487
76	NC_022786	CCTC	2	8	46207	46214	0 %	25 %	0 %	75 %	557693487
77	NC_022786	CCTA	2	8	47114	47121	25 %	25 %	0 %	50 %	557693488
78	NC_022786	GCTT	2	8	47736	47743	0 %	50 %	25 %	25 %	557693488
79	NC_022786	ACAG	2	8	48734	48741	50 %	0 %	25 %	25 %	557693488
80	NC_022786	CCAC	2	8	48927	48934	25 %	0 %	0 %	75 %	557693488
81	NC_022786	CGCT	2	8	49560	49567	0 %	25 %	25 %	50 %	557693489
82	NC_022786	ATAC	2	8	49754	49761	50 %	25 %	0 %	25 %	557693489
83	NC_022786	GCTG	2	8	49970	49977	0 %	25 %	50 %	25 %	557693489
84	NC_022786	ATTA	2	8	52832	52839	50 %	50 %	0 %	0 %	557693490
85	NC_022786	GTTT	2	8	53173	53180	0 %	75 %	25 %	0 %	557693490
86	NC_022786	AAAG	2	8	53317	53324	75 %	0 %	25 %	0 %	557693490
87	NC_022786	CCCT	2	8	54327	54334	0 %	25 %	0 %	75 %	557693491
88	NC_022786	GGAG	2	8	54358	54365	25 %	0 %	75 %	0 %	557693491
89	NC_022786	CCAA	2	8	54396	54403	50 %	0 %	0 %	50 %	557693491
90	NC_022786	TCCT	2	8	55395	55402	0 %	50 %	0 %	50 %	557693492
91	NC_022786	TCCA	2	8	55482	55489	25 %	25 %	0 %	50 %	557693492
92	NC_022786	TATC	2	8	55529	55536	25 %	50 %	0 %	25 %	557693492
93	NC_022786	TTCT	2	8	55601	55608	0 %	75 %	0 %	25 %	557693493
94	NC_022786	TGTT	2	8	56055	56062	0 %	75 %	25 %	0 %	557693494
95	NC_022786	CAGC	2	8	56795	56802	25 %	0 %	25 %	50 %	557693496
96	NC_022786	TTGC	2	8	57176	57183	0 %	50 %	25 %	25 %	557693496
97	NC_022786	CAGC	2	8	58028	58035	25 %	0 %	25 %	50 %	557693496
98	NC_022786	GACG	2	8	58224	58231	25 %	0 %	50 %	25 %	557693496
99	NC_022786	CAAC	2	8	59111	59118	50 %	0 %	0 %	50 %	557693496
100	NC_022786	ACAG	2	8	60049	60056	50 %	0 %	25 %	25 %	557693498
101	NC_022786	CCAG	2	8	60649	60656	25 %	0 %	25 %	50 %	557693499
102	NC_022786	AGCA	2	8	60696	60703	50 %	0 %	25 %	25 %	557693499
103	NC_022786	TAAA	2	8	60950	60957	75 %	25 %	0 %	0 %	557693499
104	NC_022786	GTAT	2	8	61731	61738	25 %	50 %	25 %	0 %	557693500
105	NC_022786	ACCC	2	8	62760	62767	25 %	0 %	0 %	75 %	557693500
106	NC_022786	ATGC	2	8	62836	62843	25 %	25 %	25 %	25 %	557693500
107	NC_022786	CTCC	2	8	63411	63418	0 %	25 %	0 %	75 %	557693500
108	NC_022786	TCTT	2	8	63854	63861	0 %	75 %	0 %	25 %	557693500
109	NC_022786	CCTG	2	8	64185	64192	0 %	25 %	25 %	50 %	557693500
110	NC_022786	ATGG	2	8	64215	64222	25 %	25 %	50 %	0 %	557693500
111	NC_022786	GGAT	2	8	64357	64364	25 %	25 %	50 %	0 %	557693500
112	NC_022786	CGAG	2	8	64428	64435	25 %	0 %	50 %	25 %	557693500
113	NC_022786	GACA	2	8	64718	64725	50 %	0 %	25 %	25 %	557693501
114	NC_022786	GCGA	2	8	65523	65530	25 %	0 %	50 %	25 %	557693501
115	NC_022786	TATG	2	8	65564	65571	25 %	50 %	25 %	0 %	557693501
116	NC_022786	ATTC	2	8	65614	65621	25 %	50 %	0 %	25 %	557693501
117	NC_022786	GCAG	2	8	65825	65832	25 %	0 %	50 %	25 %	557693502
118	NC_022786	ATGC	2	8	65927	65934	25 %	25 %	25 %	25 %	557693502
119	NC_022786	GTCT	2	8	66822	66829	0 %	50 %	25 %	25 %	557693503
120	NC_022786	CAAC	2	8	67309	67316	50 %	0 %	0 %	50 %	557693504
121	NC_022786	GTTG	2	8	67682	67689	0 %	50 %	50 %	0 %	557693504
122	NC_022786	AAGG	2	8	68861	68868	50 %	0 %	50 %	0 %	557693505
123	NC_022786	CCCA	2	8	69870	69877	25 %	0 %	0 %	75 %	557693506
124	NC_022786	TGGA	2	8	69922	69929	25 %	25 %	50 %	0 %	557693506
125	NC_022786	GATG	2	8	70701	70708	25 %	25 %	50 %	0 %	557693507
126	NC_022786	ATGG	2	8	71050	71057	25 %	25 %	50 %	0 %	557693507
127	NC_022786	TGCT	2	8	71813	71820	0 %	50 %	25 %	25 %	557693508
128	NC_022786	ATGT	2	8	71911	71918	25 %	50 %	25 %	0 %	557693508
129	NC_022786	TCTT	2	8	72166	72173	0 %	75 %	0 %	25 %	557693508
130	NC_022786	TTTC	2	8	72196	72203	0 %	75 %	0 %	25 %	557693508
131	NC_022786	GCCG	2	8	72543	72550	0 %	0 %	50 %	50 %	557693508
132	NC_022786	CCAT	2	8	73416	73423	25 %	25 %	0 %	50 %	557693509
133	NC_022786	CATC	2	8	74576	74583	25 %	25 %	0 %	50 %	557693510
134	NC_022786	AATG	2	8	74887	74894	50 %	25 %	25 %	0 %	557693511
135	NC_022786	GGGC	2	8	75366	75373	0 %	0 %	75 %	25 %	557693511
136	NC_022786	TGGT	2	8	75709	75716	0 %	50 %	50 %	0 %	557693511
137	NC_022786	AGCC	2	8	75803	75810	25 %	0 %	25 %	50 %	557693511
138	NC_022786	CCAA	2	8	76989	76996	50 %	0 %	0 %	50 %	557693511
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