MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Caldiarchaeum subterraneum DNA

Total Repeats: 23033

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022786	GCT	2	6	68	73	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693446
2	NC_022786	GAG	2	6	113	118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557693446
3	NC_022786	CTT	2	6	149	154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693446
4	NC_022786	GTT	2	6	199	204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557693446
5	NC_022786	CCG	2	6	390	395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557693446
6	NC_022786	GAG	2	6	437	442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557693446
7	NC_022786	CAA	2	6	475	480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557693446
8	NC_022786	CGA	2	6	502	507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693446
9	NC_022786	GAG	2	6	527	532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557693446
10	NC_022786	AGC	2	6	563	568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693446
11	NC_022786	GAA	2	6	748	753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557693446
12	NC_022786	GCT	2	6	794	799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693446
13	NC_022786	CTG	2	6	882	887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693446
14	NC_022786	CCA	2	6	921	926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557693446
15	NC_022786	TGC	2	6	972	977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693446
16	NC_022786	CGG	2	6	981	986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557693446
17	NC_022786	GAG	2	6	1058	1063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557693446
18	NC_022786	AGG	2	6	1071	1076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557693446
19	NC_022786	TTC	2	6	1104	1109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693446
20	NC_022786	CTT	2	6	1260	1265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693447
21	NC_022786	CGC	3	9	1271	1279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557693447
22	NC_022786	CAT	2	6	1334	1339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557693447
23	NC_022786	ATT	2	6	1348	1353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557693447
24	NC_022786	TCA	2	6	1544	1549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557693447
25	NC_022786	GCT	2	6	1661	1666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693447
26	NC_022786	CCT	2	6	1730	1735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557693447
27	NC_022786	ATC	2	6	1996	2001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557693447
28	NC_022786	CAA	2	6	2051	2056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557693447
29	NC_022786	ATG	2	6	2083	2088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557693447
30	NC_022786	TCG	2	6	2143	2148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693447
31	NC_022786	GCT	2	6	2335	2340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693447
32	NC_022786	AGT	2	6	2667	2672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557693448
33	NC_022786	ACC	2	6	2751	2756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557693448
34	NC_022786	CGT	2	6	2764	2769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693448
35	NC_022786	GCT	2	6	2805	2810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693448
36	NC_022786	TCT	2	6	2911	2916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693448
37	NC_022786	CCA	2	6	2929	2934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557693448
38	NC_022786	TAT	2	6	2990	2995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557693448
39	NC_022786	TGT	2	6	3032	3037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557693448
40	NC_022786	AGG	2	6	3105	3110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557693448
41	NC_022786	CGT	2	6	3379	3384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693448
42	NC_022786	TGT	2	6	3498	3503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557693449
43	NC_022786	CAC	2	6	3684	3689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557693449
44	NC_022786	GAA	2	6	3705	3710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557693449
45	NC_022786	CGC	2	6	3732	3737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557693449
46	NC_022786	CTC	2	6	3786	3791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557693449
47	NC_022786	AGT	3	9	3923	3931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557693449
48	NC_022786	TTA	2	6	4103	4108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557693449
49	NC_022786	GGA	2	6	4119	4124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557693449
50	NC_022786	CCT	2	6	4133	4138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557693449
51	NC_022786	TGC	2	6	4202	4207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693449
52	NC_022786	TGT	2	6	4232	4237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557693450
53	NC_022786	TGC	2	6	4244	4249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693450
54	NC_022786	GCG	2	6	4259	4264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557693450
55	NC_022786	GAA	2	6	4458	4463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557693450
56	NC_022786	CGG	2	6	4503	4508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557693450
57	NC_022786	GAC	2	6	4710	4715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693451
58	NC_022786	GAC	2	6	4739	4744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693451
59	NC_022786	TCG	2	6	4747	4752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693451
60	NC_022786	GCG	2	6	4794	4799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557693451
61	NC_022786	GCC	2	6	5073	5078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557693451
62	NC_022786	CGG	2	6	5168	5173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557693451
63	NC_022786	ATT	2	6	5244	5249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557693452
64	NC_022786	CTA	2	6	5251	5256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557693452
65	NC_022786	GGT	2	6	5296	5301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557693452
66	NC_022786	GCC	2	6	5440	5445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557693452
67	NC_022786	CTT	2	6	5456	5461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693452
68	NC_022786	GAA	2	6	5507	5512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557693452
69	NC_022786	CCT	2	6	5561	5566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557693452
70	NC_022786	TCC	2	6	5632	5637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557693452
71	NC_022786	AAC	2	6	5729	5734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557693453
72	NC_022786	CCA	2	6	5755	5760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557693453
73	NC_022786	GAA	2	6	5809	5814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557693453
74	NC_022786	CCT	2	6	5917	5922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557693453
75	NC_022786	CGA	3	9	6031	6039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693453
76	NC_022786	CTT	2	6	6049	6054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693453
77	NC_022786	GCA	2	6	6101	6106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693454
78	NC_022786	CCA	2	6	6133	6138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557693454
79	NC_022786	TGC	2	6	6145	6150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693454
80	NC_022786	GCA	2	6	6235	6240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693454
81	NC_022786	AAC	2	6	6277	6282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557693454
82	NC_022786	ACA	2	6	6304	6309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557693454
83	NC_022786	TCA	2	6	6336	6341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557693455
84	NC_022786	TCC	2	6	6557	6562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557693455
85	NC_022786	GAA	2	6	6630	6635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557693455
86	NC_022786	GGC	2	6	7081	7086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557693456
87	NC_022786	CCG	2	6	7237	7242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557693457
88	NC_022786	CCG	2	6	7294	7299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557693457
89	NC_022786	GGC	2	6	7306	7311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557693457
90	NC_022786	CGC	2	6	7351	7356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557693457
91	NC_022786	TGT	2	6	7451	7456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557693457
92	NC_022786	GGA	2	6	7582	7587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557693457
93	NC_022786	CCG	2	6	7750	7755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557693457
94	NC_022786	CTC	2	6	7796	7801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557693457
95	NC_022786	TTC	2	6	7863	7868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693457
96	NC_022786	GCC	2	6	7956	7961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557693457
97	NC_022786	CTC	2	6	7983	7988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557693457
98	NC_022786	CGT	2	6	8071	8076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693457
99	NC_022786	TCC	2	6	8200	8205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557693457
100	NC_022786	GTA	2	6	8238	8243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557693457
101	NC_022786	CTT	2	6	8273	8278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693458
102	NC_022786	CTG	2	6	8279	8284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693458
103	NC_022786	TCT	2	6	8286	8291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693458
104	NC_022786	GTC	2	6	8405	8410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693458
105	NC_022786	CCT	2	6	8512	8517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557693458
106	NC_022786	CTT	2	6	8519	8524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693458
107	NC_022786	CCT	2	6	8575	8580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557693458
108	NC_022786	CGG	2	6	8717	8722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557693458
109	NC_022786	GCC	2	6	8763	8768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557693458
110	NC_022786	CTG	2	6	8818	8823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693458
111	NC_022786	ACA	2	6	8925	8930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557693458
112	NC_022786	CGC	2	6	8975	8980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557693458
113	NC_022786	CGC	2	6	9022	9027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557693458
114	NC_022786	CTG	2	6	9062	9067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693458
115	NC_022786	GAT	2	6	9068	9073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557693458
116	NC_022786	CGA	2	6	9094	9099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693458
117	NC_022786	CGA	2	6	9175	9180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693458
118	NC_022786	CGG	2	6	9378	9383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557693458
119	NC_022786	GCC	2	6	9428	9433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557693458
120	NC_022786	CCG	2	6	9448	9453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557693458
121	NC_022786	TTG	2	6	9555	9560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557693458
122	NC_022786	AGC	2	6	9575	9580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693458
123	NC_022786	TCG	2	6	9640	9645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693458
124	NC_022786	TCT	2	6	9736	9741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693458
125	NC_022786	GAA	2	6	9745	9750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557693458
126	NC_022786	GCT	2	6	9760	9765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693458
127	NC_022786	TCC	2	6	9814	9819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557693458
128	NC_022786	TCT	2	6	9863	9868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693458
129	NC_022786	ATG	2	6	9916	9921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557693458
130	NC_022786	ATG	2	6	9963	9968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557693458
131	NC_022786	CAC	2	6	9986	9991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557693458
132	NC_022786	GCA	2	6	9993	9998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693458
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253	NC_022786	ATA	2	6	19013	19018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557693468
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257	NC_022786	GCT	2	6	19878	19883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693469
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262	NC_022786	GAG	2	6	21262	21267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557693470
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378	NC_022786	CTC	2	6	29004	29009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557693474
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