MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Caldiarchaeum subterraneum DNA

Total Repeats: 31706

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_022786	ACG	2	6	189981	189986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693627
3502	NC_022786	GTC	2	6	189992	189997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693627
3503	NC_022786	CTT	2	6	190022	190027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693627
3504	NC_022786	CGA	2	6	190095	190100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693627
3505	NC_022786	GCA	2	6	190111	190116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693627
3506	NC_022786	GAT	2	6	190145	190150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557693627
3507	NC_022786	TAG	2	6	190164	190169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557693627
3508	NC_022786	GT	3	6	190405	190410	0 %	50 %	50 %	0 %	557693627
3509	NC_022786	TGG	3	9	190464	190472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557693627
3510	NC_022786	GGC	2	6	190513	190518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557693627
3511	NC_022786	AGCTG	2	10	190525	190534	20 %	20 %	40 %	20 %	557693627
3512	NC_022786	TTG	2	6	190560	190565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557693627
3513	NC_022786	CTT	2	6	190620	190625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693627
3514	NC_022786	A	6	6	190642	190647	100 %	0 %	0 %	0 %	557693627
3515	NC_022786	GAG	3	9	190691	190699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557693627
3516	NC_022786	GAG	2	6	190712	190717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557693627
3517	NC_022786	GTG	2	6	190718	190723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557693627
3518	NC_022786	GAT	2	6	190725	190730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557693627
3519	NC_022786	TC	3	6	190732	190737	0 %	50 %	0 %	50 %	557693628
3520	NC_022786	GCG	2	6	190810	190815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557693628
3521	NC_022786	TCC	2	6	190825	190830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557693628
3522	NC_022786	GCT	2	6	190842	190847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693628
3523	NC_022786	CCT	2	6	190858	190863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557693628
3524	NC_022786	TAA	2	6	190865	190870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557693628
3525	NC_022786	CTGG	2	8	190905	190912	0 %	25 %	50 %	25 %	557693628
3526	NC_022786	GCT	2	6	190917	190922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693628
3527	NC_022786	CTT	2	6	190963	190968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693628
3528	NC_022786	GCA	2	6	191002	191007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693628
3529	NC_022786	TCA	2	6	191029	191034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557693628
3530	NC_022786	CTG	2	6	191134	191139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693628
3531	NC_022786	GGA	2	6	191145	191150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557693628
3532	NC_022786	TGT	2	6	191163	191168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557693628
3533	NC_022786	AAG	2	6	191255	191260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557693628
3534	NC_022786	CAA	2	6	191301	191306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557693628
3535	NC_022786	C	6	6	191334	191339	0 %	0 %	0 %	100 %	557693628
3536	NC_022786	GCC	2	6	191398	191403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557693628
3537	NC_022786	CGC	2	6	191427	191432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557693628
3538	NC_022786	GTT	2	6	191565	191570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557693629
3539	NC_022786	AAGGAT	2	12	191592	191603	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	557693629
3540	NC_022786	GAT	2	6	191667	191672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557693629
3541	NC_022786	TCCCA	2	10	191742	191751	20 %	20 %	0 %	60 %	557693629
3542	NC_022786	TGG	2	6	191807	191812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557693629
3543	NC_022786	CAG	2	6	191852	191857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693629
3544	NC_022786	GAG	2	6	191884	191889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557693629
3545	NC_022786	AGC	2	6	191898	191903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693629
3546	NC_022786	GGT	2	6	191949	191954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557693629
3547	NC_022786	TGCA	2	8	192029	192036	25 %	25 %	25 %	25 %	557693629
3548	NC_022786	ATCC	2	8	192042	192049	25 %	25 %	0 %	50 %	557693629
3549	NC_022786	AGGA	2	8	192083	192090	50 %	0 %	50 %	0 %	557693629
3550	NC_022786	AG	3	6	192237	192242	50 %	0 %	50 %	0 %	557693629
3551	NC_022786	GTTG	2	8	192351	192358	0 %	50 %	50 %	0 %	557693629
3552	NC_022786	TGG	2	6	192401	192406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557693629
3553	NC_022786	GCC	2	6	192482	192487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557693630
3554	NC_022786	CAA	2	6	192511	192516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557693630
3555	NC_022786	CGC	2	6	192562	192567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557693630
3556	NC_022786	TCT	2	6	192604	192609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693630
3557	NC_022786	CTCA	2	8	192641	192648	25 %	25 %	0 %	50 %	557693631
3558	NC_022786	ACCC	2	8	192655	192662	25 %	0 %	0 %	75 %	557693631
3559	NC_022786	ACC	2	6	192689	192694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557693631
3560	NC_022786	CGC	2	6	192699	192704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557693631
3561	NC_022786	GCT	2	6	192755	192760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693631
3562	NC_022786	CTC	2	6	192853	192858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557693631
3563	NC_022786	TCC	2	6	192883	192888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557693631
3564	NC_022786	ATG	2	6	192962	192967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557693631
3565	NC_022786	CCA	2	6	193034	193039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557693631
3566	NC_022786	ACA	2	6	193055	193060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557693631
3567	NC_022786	AAC	2	6	193093	193098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557693631
3568	NC_022786	GCA	2	6	193151	193156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693631
3569	NC_022786	GCC	2	6	193208	193213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557693631
3570	NC_022786	AAT	2	6	193237	193242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557693631
3571	NC_022786	GAA	2	6	193248	193253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557693631
3572	NC_022786	TCT	2	6	193290	193295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693631
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3574	NC_022786	TAG	2	6	193307	193312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557693631
3575	NC_022786	GAC	2	6	193318	193323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693631
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3577	NC_022786	GAA	2	6	193507	193512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557693631
3578	NC_022786	AGCTTG	2	12	193610	193621	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	557693631
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3580	NC_022786	GCA	2	6	193644	193649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693631
3581	NC_022786	GAA	2	6	193690	193695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557693631
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3587	NC_022786	TATT	3	12	193815	193826	25 %	75 %	0 %	0 %	557693632
3588	NC_022786	TCA	2	6	193841	193846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557693632
3589	NC_022786	CTT	2	6	193860	193865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693632
3590	NC_022786	CTC	2	6	193956	193961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557693632
3591	NC_022786	TC	3	6	194003	194008	0 %	50 %	0 %	50 %	557693632
3592	NC_022786	CT	3	6	194009	194014	0 %	50 %	0 %	50 %	557693632
3593	NC_022786	TCT	2	6	194032	194037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693632
3594	NC_022786	GCC	2	6	194042	194047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557693632
3595	NC_022786	GT	3	6	194069	194074	0 %	50 %	50 %	0 %	557693632
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3599	NC_022786	CGT	2	6	194453	194458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693632
3600	NC_022786	GAA	2	6	194460	194465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557693632
3601	NC_022786	GATA	2	8	194543	194550	50 %	25 %	25 %	0 %	557693632
3602	NC_022786	GGTG	2	8	194551	194558	0 %	25 %	75 %	0 %	557693632
3603	NC_022786	GCT	2	6	194632	194637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693632
3604	NC_022786	CTC	2	6	194730	194735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557693632
3605	NC_022786	CAT	2	6	194736	194741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557693632
3606	NC_022786	CAG	2	6	194745	194750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693632
3607	NC_022786	AAC	2	6	194856	194861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557693632
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3609	NC_022786	TTC	2	6	194943	194948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693632
3610	NC_022786	TC	3	6	195017	195022	0 %	50 %	0 %	50 %	557693632
3611	NC_022786	CGA	3	9	195026	195034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693632
3612	NC_022786	GGGT	2	8	195041	195048	0 %	25 %	75 %	0 %	557693632
3613	NC_022786	GGC	2	6	195123	195128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557693632
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3617	NC_022786	CTC	3	9	195356	195364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557693632
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3619	NC_022786	CAA	2	6	195416	195421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557693632
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3621	NC_022786	CAT	2	6	195492	195497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557693632
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3741	NC_022786	TGT	2	6	204655	204660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557693641
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3987	NC_022786	A	6	6	215810	215815	100 %	0 %	0 %	0 %	557693652
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3990	NC_022786	CCG	2	6	215860	215865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557693653
3991	NC_022786	CGCTAC	2	12	215870	215881	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	557693653
3992	NC_022786	AAC	2	6	215918	215923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557693653
3993	NC_022786	CCT	2	6	215989	215994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557693653
3994	NC_022786	ACA	2	6	216033	216038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557693653
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