MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Caldiarchaeum subterraneum DNA

Total Repeats: 31706

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022786	CTA	2	6	26105	26110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557693471
502	NC_022786	AAG	2	6	26113	26118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557693471
503	NC_022786	GGC	2	6	26252	26257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557693471
504	NC_022786	GTA	2	6	26411	26416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557693471
505	NC_022786	AG	3	6	26424	26429	50 %	0 %	50 %	0 %	557693471
506	NC_022786	GATA	2	8	26437	26444	50 %	25 %	25 %	0 %	557693471
507	NC_022786	GAC	2	6	26507	26512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693471
508	NC_022786	AG	3	6	26515	26520	50 %	0 %	50 %	0 %	557693471
509	NC_022786	GAT	2	6	26569	26574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557693471
510	NC_022786	ATTGG	2	10	26585	26594	20 %	40 %	40 %	0 %	557693471
511	NC_022786	GAG	2	6	26612	26617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557693471
512	NC_022786	ACG	2	6	26661	26666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693471
513	NC_022786	GA	3	6	26768	26773	50 %	0 %	50 %	0 %	557693471
514	NC_022786	GGC	2	6	26856	26861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557693471
515	NC_022786	TAG	2	6	26913	26918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557693471
516	NC_022786	GA	3	6	26934	26939	50 %	0 %	50 %	0 %	557693471
517	NC_022786	GA	3	6	26952	26957	50 %	0 %	50 %	0 %	557693471
518	NC_022786	CT	3	6	26982	26987	0 %	50 %	0 %	50 %	557693471
519	NC_022786	AAG	2	6	27011	27016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557693471
520	NC_022786	GAG	2	6	27034	27039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557693471
521	NC_022786	A	7	7	27074	27080	100 %	0 %	0 %	0 %	557693471
522	NC_022786	CGA	2	6	27115	27120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693471
523	NC_022786	AGG	2	6	27216	27221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557693471
524	NC_022786	CAA	2	6	27258	27263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557693471
525	NC_022786	CTG	2	6	27295	27300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693471
526	NC_022786	CGC	2	6	27493	27498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557693472
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528	NC_022786	TCT	2	6	27522	27527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693472
529	NC_022786	ACA	2	6	27680	27685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557693472
530	NC_022786	TCA	2	6	27689	27694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557693472
531	NC_022786	GCA	2	6	27710	27715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693472
532	NC_022786	CTC	2	6	27718	27723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557693472
533	NC_022786	AGA	2	6	27727	27732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557693472
534	NC_022786	GGC	2	6	27782	27787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557693472
535	NC_022786	GA	3	6	28223	28228	50 %	0 %	50 %	0 %	557693473
536	NC_022786	ACC	2	6	28289	28294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557693473
537	NC_022786	ACT	2	6	28295	28300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557693473
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539	NC_022786	ACT	2	6	28331	28336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557693473
540	NC_022786	TG	3	6	28384	28389	0 %	50 %	50 %	0 %	557693473
541	NC_022786	CCA	2	6	28454	28459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557693473
542	NC_022786	AAT	2	6	28868	28873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557693474
543	NC_022786	GAT	3	9	28931	28939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557693474
544	NC_022786	ATG	2	6	28951	28956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557693474
545	NC_022786	TTA	2	6	28972	28977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557693474
546	NC_022786	CTC	2	6	29004	29009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557693474
547	NC_022786	TAT	4	12	29039	29050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557693474
548	NC_022786	AAC	2	6	29070	29075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557693474
549	NC_022786	T	6	6	29095	29100	0 %	100 %	0 %	0 %	557693474
550	NC_022786	TCTA	2	8	29591	29598	25 %	50 %	0 %	25 %	557693475
551	NC_022786	T	6	6	29656	29661	0 %	100 %	0 %	0 %	557693475
552	NC_022786	TTC	2	6	29677	29682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693475
553	NC_022786	TTC	2	6	29689	29694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693475
554	NC_022786	ATC	2	6	29755	29760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557693475
555	NC_022786	TA	3	6	29785	29790	50 %	50 %	0 %	0 %	557693475
556	NC_022786	GGA	2	6	29802	29807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557693475
557	NC_022786	CTTCG	2	10	29866	29875	0 %	40 %	20 %	40 %	557693475
558	NC_022786	TTC	2	6	29929	29934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693475
559	NC_022786	GTA	2	6	29995	30000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557693475
560	NC_022786	GATT	2	8	30010	30017	25 %	50 %	25 %	0 %	557693475
561	NC_022786	ACA	2	6	30101	30106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557693475
562	NC_022786	TAA	2	6	30211	30216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557693475
563	NC_022786	AAC	2	6	30308	30313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557693475
564	NC_022786	TTA	2	6	31886	31891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557693476
565	NC_022786	ACT	2	6	31915	31920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557693476
566	NC_022786	GCT	3	9	31936	31944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693476
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568	NC_022786	CTT	2	6	31972	31977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693476
569	NC_022786	TAA	2	6	32015	32020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557693476
570	NC_022786	A	7	7	32045	32051	100 %	0 %	0 %	0 %	557693476
571	NC_022786	AT	3	6	32069	32074	50 %	50 %	0 %	0 %	557693476
572	NC_022786	AGC	2	6	32140	32145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693476
573	NC_022786	A	6	6	32254	32259	100 %	0 %	0 %	0 %	557693476
574	NC_022786	ATTACG	2	12	32282	32293	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	557693476
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576	NC_022786	TTC	2	6	32411	32416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693476
577	NC_022786	TTA	2	6	32420	32425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557693476
578	NC_022786	ATG	2	6	32447	32452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557693476
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582	NC_022786	A	6	6	32648	32653	100 %	0 %	0 %	0 %	557693476
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591	NC_022786	AGA	2	6	32975	32980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557693477
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593	NC_022786	GAAA	2	8	33057	33064	75 %	0 %	25 %	0 %	557693477
594	NC_022786	TTTTGA	2	12	33104	33115	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	557693477
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596	NC_022786	CAA	2	6	35303	35308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557693478
597	NC_022786	TTC	2	6	35315	35320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693478
598	NC_022786	CA	3	6	35328	35333	50 %	0 %	0 %	50 %	557693478
599	NC_022786	TAC	2	6	35373	35378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557693478
600	NC_022786	CT	3	6	35450	35455	0 %	50 %	0 %	50 %	557693478
601	NC_022786	TGG	3	9	35517	35525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557693478
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609	NC_022786	TGG	2	6	36075	36080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557693478
610	NC_022786	GGCCGC	2	12	36084	36095	0 %	0 %	50 %	50 %	557693478
611	NC_022786	TTA	2	6	36105	36110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557693478
612	NC_022786	TC	3	6	36207	36212	0 %	50 %	0 %	50 %	557693478
613	NC_022786	GGT	2	6	36217	36222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557693478
614	NC_022786	TTC	2	6	36224	36229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693478
615	NC_022786	TTCAAC	2	12	36385	36396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557693478
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620	NC_022786	ACA	2	6	36620	36625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557693478
621	NC_022786	ACC	2	6	36637	36642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557693478
622	NC_022786	TGT	2	6	36675	36680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557693478
623	NC_022786	AAT	2	6	36724	36729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557693479
624	NC_022786	ATTC	2	8	36765	36772	25 %	50 %	0 %	25 %	557693479
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