MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Caldiarchaeum subterraneum DNA

Total Repeats: 31706

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_022786	CCA	2	6	315385	315390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557693761
6002	NC_022786	GAA	2	6	315418	315423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557693761
6003	NC_022786	CA	3	6	315431	315436	50 %	0 %	0 %	50 %	557693761
6004	NC_022786	CAAG	2	8	315439	315446	50 %	0 %	25 %	25 %	557693761
6005	NC_022786	GTT	2	6	315528	315533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557693762
6006	NC_022786	GGT	2	6	315545	315550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557693762
6007	NC_022786	GAG	2	6	315603	315608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557693762
6008	NC_022786	CGC	2	6	315651	315656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557693762
6009	NC_022786	CT	3	6	315758	315763	0 %	50 %	0 %	50 %	557693762
6010	NC_022786	GCC	2	6	315805	315810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557693762
6011	NC_022786	CAGA	2	8	315843	315850	50 %	0 %	25 %	25 %	557693762
6012	NC_022786	GCC	2	6	315881	315886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557693762
6013	NC_022786	GAAA	2	8	315887	315894	75 %	0 %	25 %	0 %	557693762
6014	NC_022786	A	6	6	315892	315897	100 %	0 %	0 %	0 %	557693762
6015	NC_022786	TC	3	6	315938	315943	0 %	50 %	0 %	50 %	557693762
6016	NC_022786	TGG	2	6	315947	315952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557693762
6017	NC_022786	GCG	2	6	315990	315995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557693762
6018	NC_022786	AC	3	6	316003	316008	50 %	0 %	0 %	50 %	557693762
6019	NC_022786	GC	3	6	316045	316050	0 %	0 %	50 %	50 %	557693762
6020	NC_022786	GGC	2	6	316073	316078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557693762
6021	NC_022786	CGA	2	6	316148	316153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693762
6022	NC_022786	GAC	2	6	316218	316223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693762
6023	NC_022786	AAG	2	6	316273	316278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557693762
6024	NC_022786	AC	3	6	316294	316299	50 %	0 %	0 %	50 %	557693762
6025	NC_022786	TAC	2	6	316300	316305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557693762
6026	NC_022786	TCA	2	6	316324	316329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557693762
6027	NC_022786	TCA	2	6	316366	316371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557693762
6028	NC_022786	TC	3	6	316597	316602	0 %	50 %	0 %	50 %	557693763
6029	NC_022786	CAT	2	6	316610	316615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557693763
6030	NC_022786	CTT	2	6	316620	316625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693763
6031	NC_022786	ATG	2	6	316698	316703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557693763
6032	NC_022786	TCT	3	9	316803	316811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693763
6033	NC_022786	TCC	2	6	316827	316832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557693763
6034	NC_022786	ATC	2	6	316965	316970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557693763
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6036	NC_022786	TC	3	6	317021	317026	0 %	50 %	0 %	50 %	557693763
6037	NC_022786	TC	3	6	317028	317033	0 %	50 %	0 %	50 %	557693764
6038	NC_022786	GA	3	6	317038	317043	50 %	0 %	50 %	0 %	557693764
6039	NC_022786	TCAG	2	8	317102	317109	25 %	25 %	25 %	25 %	557693764
6040	NC_022786	CTC	2	6	317110	317115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557693764
6041	NC_022786	CTC	2	6	317143	317148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557693764
6042	NC_022786	CTT	2	6	317203	317208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693764
6043	NC_022786	TC	3	6	317223	317228	0 %	50 %	0 %	50 %	557693764
6044	NC_022786	GCT	2	6	317242	317247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693764
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6046	NC_022786	CT	3	6	317501	317506	0 %	50 %	0 %	50 %	557693765
6047	NC_022786	TGC	2	6	317540	317545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693765
6048	NC_022786	ATG	2	6	317699	317704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557693766
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6050	NC_022786	AACGAG	2	12	317800	317811	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	557693766
6051	NC_022786	AG	3	6	317861	317866	50 %	0 %	50 %	0 %	557693766
6052	NC_022786	CAT	2	6	317994	317999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557693766
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6054	NC_022786	ACT	2	6	318033	318038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557693766
6055	NC_022786	CAA	2	6	318073	318078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557693767
6056	NC_022786	GCC	2	6	318094	318099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557693767
6057	NC_022786	GCC	2	6	318166	318171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557693767
6058	NC_022786	GT	3	6	318216	318221	0 %	50 %	50 %	0 %	557693767
6059	NC_022786	CCG	2	6	318364	318369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557693767
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6061	NC_022786	TCA	2	6	318413	318418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557693767
6062	NC_022786	CGC	2	6	318441	318446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557693767
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6065	NC_022786	CA	3	6	318518	318523	50 %	0 %	0 %	50 %	557693767
6066	NC_022786	CCTCT	2	10	318586	318595	0 %	40 %	0 %	60 %	557693767
6067	NC_022786	CCA	2	6	318600	318605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557693767
6068	NC_022786	ACTGGG	2	12	318880	318891	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	557693768
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6070	NC_022786	T	6	6	318943	318948	0 %	100 %	0 %	0 %	557693768
6071	NC_022786	AGG	2	6	318999	319004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557693768
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6073	NC_022786	TGA	2	6	319060	319065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557693768
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6107	NC_022786	TGT	2	6	321233	321238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557693770
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6123	NC_022786	CAA	2	6	321944	321949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557693770
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6243	NC_022786	ACG	2	6	327257	327262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693775
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6489	NC_022786	CGAC	2	8	339667	339674	25 %	0 %	25 %	50 %	557693788
6490	NC_022786	CGG	2	6	339695	339700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557693788
6491	NC_022786	CTC	2	6	339790	339795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557693788
6492	NC_022786	CA	3	6	339893	339898	50 %	0 %	0 %	50 %	557693788
6493	NC_022786	ATG	2	6	339957	339962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557693788
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