MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Caldiarchaeum subterraneum DNA

Total Repeats: 31706

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_022786	TCT	2	6	241279	241284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693676
4502	NC_022786	TCT	2	6	241413	241418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693676
4503	NC_022786	GCG	2	6	241429	241434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557693676
4504	NC_022786	ATT	2	6	241465	241470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557693676
4505	NC_022786	GAG	2	6	241565	241570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557693676
4506	NC_022786	CTG	2	6	241572	241577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693676
4507	NC_022786	GGA	2	6	241779	241784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557693676
4508	NC_022786	CCT	2	6	241793	241798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557693676
4509	NC_022786	ACA	2	6	241807	241812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557693676
4510	NC_022786	TCA	2	6	241843	241848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557693676
4511	NC_022786	GCA	2	6	241879	241884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693676
4512	NC_022786	ATA	2	6	241935	241940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557693676
4513	NC_022786	CGC	2	6	242030	242035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557693676
4514	NC_022786	AAT	2	6	242122	242127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557693676
4515	NC_022786	TCT	2	6	242152	242157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693676
4516	NC_022786	T	6	6	242162	242167	0 %	100 %	0 %	0 %	557693676
4517	NC_022786	GCTG	2	8	242348	242355	0 %	25 %	50 %	25 %	557693677
4518	NC_022786	TTC	2	6	242420	242425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693677
4519	NC_022786	GTG	2	6	242490	242495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557693677
4520	NC_022786	CGG	2	6	242563	242568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557693677
4521	NC_022786	GAC	2	6	242603	242608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693677
4522	NC_022786	CCG	2	6	242737	242742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557693677
4523	NC_022786	CGG	2	6	242827	242832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557693677
4524	NC_022786	CCGC	2	8	242870	242877	0 %	0 %	25 %	75 %	557693677
4525	NC_022786	GCC	2	6	242949	242954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557693677
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4529	NC_022786	TTG	2	6	243178	243183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557693678
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4534	NC_022786	TGT	2	6	243248	243253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557693678
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4540	NC_022786	CAACGT	2	12	243434	243445	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	557693678
4541	NC_022786	TGG	2	6	243512	243517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557693678
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4543	NC_022786	T	6	6	243551	243556	0 %	100 %	0 %	0 %	557693678
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4550	NC_022786	TATC	2	8	243911	243918	25 %	50 %	0 %	25 %	557693678
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4553	NC_022786	TCA	2	6	244072	244077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557693679
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4556	NC_022786	CGA	2	6	244159	244164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693679
4557	NC_022786	GT	3	6	244192	244197	0 %	50 %	50 %	0 %	557693679
4558	NC_022786	CCT	2	6	244200	244205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557693679
4559	NC_022786	AT	3	6	244213	244218	50 %	50 %	0 %	0 %	557693679
4560	NC_022786	CAC	2	6	244247	244252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557693679
4561	NC_022786	GCT	2	6	244255	244260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693679
4562	NC_022786	ACG	2	6	244281	244286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693679
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4565	NC_022786	CGT	2	6	244491	244496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693679
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4572	NC_022786	GGC	2	6	244875	244880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557693679
4573	NC_022786	TACA	2	8	244899	244906	50 %	25 %	0 %	25 %	557693679
4574	NC_022786	TCG	2	6	244945	244950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693680
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4594	NC_022786	TCG	3	9	245719	245727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693680
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4600	NC_022786	CA	3	6	245957	245962	50 %	0 %	0 %	50 %	557693680
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4603	NC_022786	ATGC	2	8	246069	246076	25 %	25 %	25 %	25 %	557693680
4604	NC_022786	TCC	2	6	246118	246123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557693680
4605	NC_022786	CATCA	2	10	246140	246149	40 %	20 %	0 %	40 %	557693680
4606	NC_022786	ACA	2	6	246205	246210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557693680
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4608	NC_022786	GGC	2	6	246336	246341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557693680
4609	NC_022786	GAA	2	6	246396	246401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557693680
4610	NC_022786	CAC	2	6	246433	246438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557693680
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4619	NC_022786	ACT	2	6	246923	246928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557693680
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4621	NC_022786	CGA	2	6	246968	246973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693680
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4657	NC_022786	GGC	2	6	248408	248413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557693682
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4740	NC_022786	AGT	2	6	251537	251542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557693685
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4742	NC_022786	CA	3	6	251674	251679	50 %	0 %	0 %	50 %	557693685
4743	NC_022786	TTC	2	6	251736	251741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693685
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4863	NC_022786	CGA	2	6	257837	257842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693691
4864	NC_022786	GA	3	6	257841	257846	50 %	0 %	50 %	0 %	557693691
4865	NC_022786	AT	3	6	257920	257925	50 %	50 %	0 %	0 %	557693692
4866	NC_022786	CAT	2	6	258073	258078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557693692
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4982	NC_022786	GTTG	2	8	264212	264219	0 %	50 %	50 %	0 %	557693700
4983	NC_022786	TGG	2	6	264252	264257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557693700
4984	NC_022786	CGG	3	9	264358	264366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557693701
4985	NC_022786	TGC	2	6	264382	264387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693701
4986	NC_022786	TGC	2	6	264415	264420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693701
4987	NC_022786	AGC	2	6	264484	264489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693701
4988	NC_022786	TCG	2	6	264520	264525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693701
4989	NC_022786	A	6	6	264583	264588	100 %	0 %	0 %	0 %	557693701
4990	NC_022786	AGCC	2	8	264672	264679	25 %	0 %	25 %	50 %	557693701
4991	NC_022786	GAC	2	6	264732	264737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693701
4992	NC_022786	TCT	2	6	264743	264748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693701
4993	NC_022786	ATC	2	6	264765	264770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557693701
4994	NC_022786	ACA	2	6	264778	264783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557693701
4995	NC_022786	AGC	2	6	264809	264814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693701
4996	NC_022786	TCC	2	6	264838	264843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557693701
4997	NC_022786	AAACC	2	10	264899	264908	60 %	0 %	0 %	40 %	557693701
4998	NC_022786	CCTC	2	8	264948	264955	0 %	25 %	0 %	75 %	557693701
4999	NC_022786	CAT	2	6	264965	264970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557693701
5000	NC_022786	CAT	2	6	264995	265000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557693701

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