MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Carnobacterium sp. WN1359 plasmid pWNCR15

Total Repeats: 122

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022607	CAT	2	6	811	816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554650831
2	NC_022607	AAT	2	6	869	874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554650831
3	NC_022607	GAT	2	6	1037	1042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554650831
4	NC_022607	AAT	2	6	1276	1281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554650832
5	NC_022607	CAT	2	6	1531	1536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554650832
6	NC_022607	GCA	2	6	1550	1555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554650832
7	NC_022607	TAA	2	6	1816	1821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554650832
8	NC_022607	GAA	2	6	1874	1879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554650832
9	NC_022607	CAA	2	6	1911	1916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554650832
10	NC_022607	AGA	2	6	1942	1947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554650832
11	NC_022607	ATT	2	6	2315	2320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554650833
12	NC_022607	CTA	2	6	2352	2357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554650833
13	NC_022607	TTG	2	6	2395	2400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554650833
14	NC_022607	TTC	2	6	2428	2433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554650833
15	NC_022607	ATC	2	6	2497	2502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554650833
16	NC_022607	TAA	2	6	2533	2538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554650833
17	NC_022607	CTT	2	6	2616	2621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554650833
18	NC_022607	TCA	2	6	2726	2731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554650833
19	NC_022607	TTC	2	6	2734	2739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554650833
20	NC_022607	GAA	2	6	2796	2801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554650833
21	NC_022607	CTT	2	6	2886	2891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554650833
22	NC_022607	ATT	2	6	2902	2907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554650833
23	NC_022607	GAA	2	6	3043	3048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554650833
24	NC_022607	TTC	2	6	3049	3054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554650833
25	NC_022607	ATC	2	6	3103	3108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554650833
26	NC_022607	AGA	2	6	3237	3242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554650833
27	NC_022607	TTC	2	6	3274	3279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554650833
28	NC_022607	TCA	3	9	3296	3304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554650833
29	NC_022607	AAG	2	6	3305	3310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554650833
30	NC_022607	TAT	2	6	3336	3341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554650833
31	NC_022607	CTA	2	6	3492	3497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554650833
32	NC_022607	GTT	2	6	3568	3573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554650833
33	NC_022607	TCT	2	6	3623	3628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554650833
34	NC_022607	TTG	2	6	3649	3654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554650833
35	NC_022607	TAA	2	6	3704	3709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554650833
36	NC_022607	TCA	2	6	3770	3775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554650833
37	NC_022607	GTT	2	6	3793	3798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554650833
38	NC_022607	AAG	2	6	3830	3835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554650833
39	NC_022607	AAT	2	6	3884	3889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554650833
40	NC_022607	AGT	2	6	3946	3951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554650833
41	NC_022607	TGC	2	6	3952	3957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554650833
42	NC_022607	TAT	2	6	4123	4128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554650833
43	NC_022607	GTA	2	6	4162	4167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554650833
44	NC_022607	ACA	2	6	4208	4213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554650833
45	NC_022607	GAA	2	6	4315	4320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554650833
46	NC_022607	ATC	2	6	5022	5027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554650841
47	NC_022607	CTT	2	6	5101	5106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554650841
48	NC_022607	CAA	2	6	5113	5118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554650841
49	NC_022607	GCA	2	6	5133	5138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554650841
50	NC_022607	TAT	2	6	5192	5197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554650841
51	NC_022607	GTA	2	6	5235	5240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554650841
52	NC_022607	CTG	2	6	5287	5292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554650842
53	NC_022607	ACC	2	6	5550	5555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	554650843
54	NC_022607	AGC	2	6	5571	5576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554650843
55	NC_022607	AGC	2	6	5645	5650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554650843
56	NC_022607	ACC	2	6	5660	5665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	554650843
57	NC_022607	TTG	2	6	6806	6811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554650834
58	NC_022607	CCA	2	6	6832	6837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	554650834
59	NC_022607	GAT	2	6	6856	6861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554650834
60	NC_022607	AAT	2	6	6928	6933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554650834
61	NC_022607	TAT	2	6	6939	6944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554650834
62	NC_022607	AGA	2	6	7162	7167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554650835
63	NC_022607	GTT	2	6	7316	7321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554650835
64	NC_022607	GAA	2	6	8249	8254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554650836
65	NC_022607	CAA	2	6	8315	8320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554650836
66	NC_022607	CAA	2	6	8470	8475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554650836
67	NC_022607	AAC	2	6	8511	8516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554650836
68	NC_022607	AGC	2	6	8676	8681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554650844
69	NC_022607	TCC	2	6	8946	8951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	554650844
70	NC_022607	CAT	2	6	9312	9317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554650844
71	NC_022607	AAC	2	6	9359	9364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554650844
72	NC_022607	GCA	2	6	9371	9376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554650844
73	NC_022607	ACA	2	6	9604	9609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554650845
74	NC_022607	GCA	2	6	9718	9723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554650845
75	NC_022607	CAA	2	6	9731	9736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554650845
76	NC_022607	ATT	2	6	9856	9861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554650846
77	NC_022607	GTG	2	6	9955	9960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	554650846
78	NC_022607	CTT	2	6	10002	10007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554650846
79	NC_022607	TGC	2	6	10026	10031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554650846
80	NC_022607	TTA	2	6	10034	10039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554650846
81	NC_022607	CAA	3	9	10097	10105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554650846
82	NC_022607	GAA	2	6	10154	10159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554650846
83	NC_022607	GCT	2	6	10190	10195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554650846
84	NC_022607	GTT	2	6	10226	10231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554650846
85	NC_022607	TTA	2	6	10254	10259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554650846
86	NC_022607	AGA	2	6	10261	10266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554650846
87	NC_022607	CAA	2	6	10283	10288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554650846
88	NC_022607	AGA	2	6	10321	10326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554650846
89	NC_022607	ATA	2	6	10884	10889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554650837
90	NC_022607	GAT	2	6	10970	10975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554650837
91	NC_022607	GAA	2	6	11043	11048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554650837
92	NC_022607	AAG	2	6	11064	11069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554650837
93	NC_022607	TAA	2	6	11086	11091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554650837
94	NC_022607	CTT	2	6	11213	11218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554650837
95	NC_022607	CTT	2	6	11244	11249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554650837
96	NC_022607	TTA	2	6	11291	11296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554650837
97	NC_022607	TGG	2	6	11338	11343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	554650837
98	NC_022607	GAA	2	6	11484	11489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554650837
99	NC_022607	AAG	2	6	11532	11537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554650837
100	NC_022607	ATA	2	6	11806	11811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554650847
101	NC_022607	AGA	2	6	11825	11830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554650847
102	NC_022607	GCT	2	6	11889	11894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554650847
103	NC_022607	GAA	2	6	11955	11960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554650847
104	NC_022607	CAA	2	6	12000	12005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554650847
105	NC_022607	ATA	2	6	12097	12102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554650847
106	NC_022607	GAA	2	6	12180	12185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554650847
107	NC_022607	TGG	2	6	12219	12224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	554650847
108	NC_022607	AGT	2	6	12232	12237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554650847
109	NC_022607	TAA	2	6	12706	12711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554650838
110	NC_022607	ATT	3	9	12722	12730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554650838
111	NC_022607	ATA	2	6	12813	12818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554650838
112	NC_022607	AGT	2	6	12868	12873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554650838
113	NC_022607	TAA	2	6	12885	12890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554650838
114	NC_022607	CTA	2	6	12904	12909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554650838
115	NC_022607	CTT	2	6	12933	12938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554650838
116	NC_022607	TTA	2	6	13146	13151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554650838
117	NC_022607	GTT	3	9	13299	13307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554650838
118	NC_022607	TAA	2	6	13438	13443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554650839
119	NC_022607	GCT	2	6	13498	13503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554650839
120	NC_022607	AAT	2	6	13683	13688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554650839
121	NC_022607	GCT	2	6	13735	13740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554650839
122	NC_022607	TGC	2	6	13934	13939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554650839

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.