MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Carnobacterium sp. WN1359 plasmid pWNCR47

Total Repeats: 139

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022602	TTAA	2	8	2234	2241	50 %	50 %	0 %	0 %	554639538
2	NC_022602	CTAT	2	8	2558	2565	25 %	50 %	0 %	25 %	554639539
3	NC_022602	AACC	2	8	2953	2960	50 %	0 %	0 %	50 %	554639539
4	NC_022602	GAAA	2	8	3356	3363	75 %	0 %	25 %	0 %	554639513
5	NC_022602	ACCA	2	8	3705	3712	50 %	0 %	0 %	50 %	554639514
6	NC_022602	AAAC	2	8	3774	3781	75 %	0 %	0 %	25 %	554639514
7	NC_022602	TTGA	2	8	3855	3862	25 %	50 %	25 %	0 %	554639514
8	NC_022602	GAAA	2	8	4393	4400	75 %	0 %	25 %	0 %	554639515
9	NC_022602	ATCA	2	8	4420	4427	50 %	25 %	0 %	25 %	554639515
10	NC_022602	TTTA	2	8	4818	4825	25 %	75 %	0 %	0 %	554639515
11	NC_022602	GAAT	2	8	5270	5277	50 %	25 %	25 %	0 %	554639515
12	NC_022602	AATC	2	8	5342	5349	50 %	25 %	0 %	25 %	554639515
13	NC_022602	GATT	2	8	5399	5406	25 %	50 %	25 %	0 %	554639515
14	NC_022602	AAAC	2	8	5619	5626	75 %	0 %	0 %	25 %	554639515
15	NC_022602	TACT	2	8	6745	6752	25 %	50 %	0 %	25 %	554639540
16	NC_022602	GAAT	2	8	6886	6893	50 %	25 %	25 %	0 %	554639540
17	NC_022602	CAAG	2	8	7582	7589	50 %	0 %	25 %	25 %	554639540
18	NC_022602	GAAT	2	8	7594	7601	50 %	25 %	25 %	0 %	554639540
19	NC_022602	GATC	2	8	8115	8122	25 %	25 %	25 %	25 %	554639516
20	NC_022602	TCCT	2	8	8262	8269	0 %	50 %	0 %	50 %	554639516
21	NC_022602	ATCC	2	8	8467	8474	25 %	25 %	0 %	50 %	554639516
22	NC_022602	ACTA	2	8	8610	8617	50 %	25 %	0 %	25 %	554639516
23	NC_022602	AATG	2	8	8804	8811	50 %	25 %	25 %	0 %	554639516
24	NC_022602	AATC	2	8	8978	8985	50 %	25 %	0 %	25 %	554639541
25	NC_022602	ACTG	2	8	9026	9033	25 %	25 %	25 %	25 %	554639541
26	NC_022602	CAAC	2	8	9370	9377	50 %	0 %	0 %	50 %	554639541
27	NC_022602	CAAC	2	8	9834	9841	50 %	0 %	0 %	50 %	554639542
28	NC_022602	GGGA	2	8	9847	9854	25 %	0 %	75 %	0 %	554639542
29	NC_022602	ATCA	2	8	10602	10609	50 %	25 %	0 %	25 %	554639517
30	NC_022602	AAGG	2	8	11376	11383	50 %	0 %	50 %	0 %	554639517
31	NC_022602	GATT	2	8	12132	12139	25 %	50 %	25 %	0 %	554639544
32	NC_022602	AATT	2	8	12268	12275	50 %	50 %	0 %	0 %	554639544
33	NC_022602	TATC	2	8	12385	12392	25 %	50 %	0 %	25 %	554639544
34	NC_022602	AATA	2	8	12750	12757	75 %	25 %	0 %	0 %	554639544
35	NC_022602	ATTA	2	8	13084	13091	50 %	50 %	0 %	0 %	554639518
36	NC_022602	AAAC	2	8	13216	13223	75 %	0 %	0 %	25 %	554639518
37	NC_022602	TGAT	2	8	13259	13266	25 %	50 %	25 %	0 %	554639518
38	NC_022602	TTCT	2	8	13529	13536	0 %	75 %	0 %	25 %	554639518
39	NC_022602	CGTT	2	8	14001	14008	0 %	50 %	25 %	25 %	554639518
40	NC_022602	AAGA	2	8	14317	14324	75 %	0 %	25 %	0 %	554639518
41	NC_022602	CATG	2	8	14572	14579	25 %	25 %	25 %	25 %	554639518
42	NC_022602	AGTT	2	8	14676	14683	25 %	50 %	25 %	0 %	554639519
43	NC_022602	ATTT	2	8	16005	16012	25 %	75 %	0 %	0 %	554639546
44	NC_022602	AATT	2	8	16101	16108	50 %	50 %	0 %	0 %	554639546
45	NC_022602	AGAT	2	8	16509	16516	50 %	25 %	25 %	0 %	554639546
46	NC_022602	ATTA	2	8	16866	16873	50 %	50 %	0 %	0 %	554639547
47	NC_022602	TTAT	2	8	16991	16998	25 %	75 %	0 %	0 %	554639547
48	NC_022602	CAAA	2	8	17069	17076	75 %	0 %	0 %	25 %	554639547
49	NC_022602	AATT	2	8	17360	17367	50 %	50 %	0 %	0 %	554639547
50	NC_022602	TTTA	2	8	17393	17400	25 %	75 %	0 %	0 %	554639547
51	NC_022602	ACTT	2	8	18164	18171	25 %	50 %	0 %	25 %	554639547
52	NC_022602	ATTT	2	8	18445	18452	25 %	75 %	0 %	0 %	554639547
53	NC_022602	TGGT	2	8	18510	18517	0 %	50 %	50 %	0 %	554639547
54	NC_022602	CTTA	2	8	18799	18806	25 %	50 %	0 %	25 %	554639520
55	NC_022602	GTTT	2	8	19110	19117	0 %	75 %	25 %	0 %	554639520
56	NC_022602	ATTT	2	8	19497	19504	25 %	75 %	0 %	0 %	554639520
57	NC_022602	AAAG	2	8	19558	19565	75 %	0 %	25 %	0 %	554639520
58	NC_022602	ACAA	2	8	20088	20095	75 %	0 %	0 %	25 %	554639520
59	NC_022602	TGAT	2	8	20216	20223	25 %	50 %	25 %	0 %	554639520
60	NC_022602	TGAA	2	8	20787	20794	50 %	25 %	25 %	0 %	554639549
61	NC_022602	GAAA	2	8	20852	20859	75 %	0 %	25 %	0 %	554639549
62	NC_022602	CTTT	2	8	20879	20886	0 %	75 %	0 %	25 %	554639549
63	NC_022602	ATGT	2	8	20963	20970	25 %	50 %	25 %	0 %	554639549
64	NC_022602	AATC	2	8	21081	21088	50 %	25 %	0 %	25 %	554639549
65	NC_022602	CTAC	2	8	21227	21234	25 %	25 %	0 %	50 %	554639549
66	NC_022602	TCTT	2	8	21767	21774	0 %	75 %	0 %	25 %	554639521
67	NC_022602	GAAA	2	8	22936	22943	75 %	0 %	25 %	0 %	554639550
68	NC_022602	CATA	2	8	23672	23679	50 %	25 %	0 %	25 %	554639550
69	NC_022602	AAAT	2	8	23707	23714	75 %	25 %	0 %	0 %	554639550
70	NC_022602	AATT	2	8	23778	23785	50 %	50 %	0 %	0 %	554639550
71	NC_022602	TATT	2	8	23945	23952	25 %	75 %	0 %	0 %	554639550
72	NC_022602	AAAT	2	8	24006	24013	75 %	25 %	0 %	0 %	554639550
73	NC_022602	TTCA	2	8	24412	24419	25 %	50 %	0 %	25 %	554639522
74	NC_022602	TAAA	2	8	25148	25155	75 %	25 %	0 %	0 %	554639523
75	NC_022602	ATGA	2	8	25555	25562	50 %	25 %	25 %	0 %	554639523
76	NC_022602	GCTG	2	8	25700	25707	0 %	25 %	50 %	25 %	554639523
77	NC_022602	GTTT	2	8	25833	25840	0 %	75 %	25 %	0 %	554639523
78	NC_022602	GTTC	2	8	25857	25864	0 %	50 %	25 %	25 %	554639523
79	NC_022602	ATCA	2	8	25947	25954	50 %	25 %	0 %	25 %	554639523
80	NC_022602	TTTA	2	8	26046	26053	25 %	75 %	0 %	0 %	554639523
81	NC_022602	CTTC	2	8	26075	26082	0 %	50 %	0 %	50 %	554639523
82	NC_022602	AATC	2	8	26250	26257	50 %	25 %	0 %	25 %	554639523
83	NC_022602	TTAC	2	8	26850	26857	25 %	50 %	0 %	25 %	554639551
84	NC_022602	AAAT	2	8	27196	27203	75 %	25 %	0 %	0 %	554639551
85	NC_022602	TAAT	2	8	27289	27296	50 %	50 %	0 %	0 %	554639551
86	NC_022602	CAAT	2	8	27853	27860	50 %	25 %	0 %	25 %	554639551
87	NC_022602	ATTT	2	8	28075	28082	25 %	75 %	0 %	0 %	554639551
88	NC_022602	TTAT	2	8	28303	28310	25 %	75 %	0 %	0 %	554639551
89	NC_022602	AATT	2	8	28628	28635	50 %	50 %	0 %	0 %	554639551
90	NC_022602	TTAA	2	8	28908	28915	50 %	50 %	0 %	0 %	554639551
91	NC_022602	GTTT	2	8	29117	29124	0 %	75 %	25 %	0 %	554639551
92	NC_022602	ATTT	2	8	29533	29540	25 %	75 %	0 %	0 %	554639551
93	NC_022602	TGCT	2	8	29912	29919	0 %	50 %	25 %	25 %	554639551
94	NC_022602	ATAA	2	8	30294	30301	75 %	25 %	0 %	0 %	554639551
95	NC_022602	AAAT	2	8	30382	30389	75 %	25 %	0 %	0 %	554639551
96	NC_022602	ATAA	2	8	30558	30565	75 %	25 %	0 %	0 %	554639551
97	NC_022602	ATGA	2	8	30783	30790	50 %	25 %	25 %	0 %	554639551
98	NC_022602	AAAT	2	8	31669	31676	75 %	25 %	0 %	0 %	554639551
99	NC_022602	GATT	2	8	32046	32053	25 %	50 %	25 %	0 %	554639524
100	NC_022602	AATT	2	8	32304	32311	50 %	50 %	0 %	0 %	554639524
101	NC_022602	GCTT	2	8	32500	32507	0 %	50 %	25 %	25 %	554639524
102	NC_022602	GTTA	2	8	32941	32948	25 %	50 %	25 %	0 %	554639525
103	NC_022602	GCGT	2	8	32950	32957	0 %	25 %	50 %	25 %	554639525
104	NC_022602	ATGG	2	8	33187	33194	25 %	25 %	50 %	0 %	554639525
105	NC_022602	CTTG	2	8	33517	33524	0 %	50 %	25 %	25 %	554639526
106	NC_022602	GTGG	2	8	33733	33740	0 %	25 %	75 %	0 %	554639526
107	NC_022602	AATT	2	8	33783	33790	50 %	50 %	0 %	0 %	554639526
108	NC_022602	AGCA	2	8	33984	33991	50 %	0 %	25 %	25 %	554639526
109	NC_022602	GTTG	2	8	35722	35729	0 %	50 %	50 %	0 %	554639527
110	NC_022602	GAAA	2	8	35925	35932	75 %	0 %	25 %	0 %	554639527
111	NC_022602	AGTC	2	8	35959	35966	25 %	25 %	25 %	25 %	554639527
112	NC_022602	TATT	2	8	36159	36166	25 %	75 %	0 %	0 %	554639552
113	NC_022602	AGTT	2	8	36256	36263	25 %	50 %	25 %	0 %	554639552
114	NC_022602	TCTT	2	8	36425	36432	0 %	75 %	0 %	25 %	554639552
115	NC_022602	TACA	2	8	37349	37356	50 %	25 %	0 %	25 %	554639553
116	NC_022602	GAAA	2	8	37627	37634	75 %	0 %	25 %	0 %	554639528
117	NC_022602	GCAA	2	8	38618	38625	50 %	0 %	25 %	25 %	554639528
118	NC_022602	TGCG	2	8	38650	38657	0 %	25 %	50 %	25 %	554639528
119	NC_022602	GAAT	2	8	39022	39029	50 %	25 %	25 %	0 %	554639529
120	NC_022602	GTTG	2	8	39376	39383	0 %	50 %	50 %	0 %	554639529
121	NC_022602	AAGG	2	8	39416	39423	50 %	0 %	50 %	0 %	554639529
122	NC_022602	AATT	2	8	40309	40316	50 %	50 %	0 %	0 %	554639531
123	NC_022602	ATTT	2	8	40467	40474	25 %	75 %	0 %	0 %	554639531
124	NC_022602	TTTA	2	8	41083	41090	25 %	75 %	0 %	0 %	554639554
125	NC_022602	ACTG	2	8	41353	41360	25 %	25 %	25 %	25 %	554639532
126	NC_022602	TATT	2	8	41990	41997	25 %	75 %	0 %	0 %	554639555
127	NC_022602	TTTG	2	8	42575	42582	0 %	75 %	25 %	0 %	554639533
128	NC_022602	GCAC	2	8	42899	42906	25 %	0 %	25 %	50 %	554639533
129	NC_022602	TAAT	2	8	43735	43742	50 %	50 %	0 %	0 %	554639534
130	NC_022602	GAAA	2	8	44039	44046	75 %	0 %	25 %	0 %	554639556
131	NC_022602	AATC	2	8	44722	44729	50 %	25 %	0 %	25 %	554639557
132	NC_022602	AGTA	2	8	44763	44770	50 %	25 %	25 %	0 %	554639557
133	NC_022602	ATTG	2	8	45117	45124	25 %	50 %	25 %	0 %	554639557
134	NC_022602	AACA	2	8	45146	45153	75 %	0 %	0 %	25 %	554639557
135	NC_022602	CAAT	2	8	45246	45253	50 %	25 %	0 %	25 %	554639557
136	NC_022602	AATG	2	8	45430	45437	50 %	25 %	25 %	0 %	554639557
137	NC_022602	TTCT	2	8	45894	45901	0 %	75 %	0 %	25 %	554639535
138	NC_022602	TTCA	2	8	46037	46044	25 %	50 %	0 %	25 %	554639536
139	NC_022602	ATTA	2	8	46127	46134	50 %	50 %	0 %	0 %	554639536

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.