MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Comamonadaceae bacterium CR

Total Repeats: 39007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022576	AGC	2	6	104	109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989633
2	NC_022576	TGC	2	6	231	236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989633
3	NC_022576	GGC	2	6	298	303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550989633
4	NC_022576	GGT	2	6	322	327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550989633
5	NC_022576	GGT	2	6	331	336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550989633
6	NC_022576	CCA	2	6	410	415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	550989633
7	NC_022576	CGC	2	6	438	443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550989633
8	NC_022576	GCA	2	6	463	468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989633
9	NC_022576	GCA	2	6	493	498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989633
10	NC_022576	GCC	2	6	522	527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550989633
11	NC_022576	TTG	2	6	709	714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550989633
12	NC_022576	CGA	2	6	801	806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989633
13	NC_022576	CGA	2	6	846	851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989633
14	NC_022576	TTC	2	6	859	864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550989633
15	NC_022576	CAA	2	6	867	872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	550989633
16	NC_022576	CTG	2	6	913	918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989633
17	NC_022576	AAG	2	6	922	927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550989633
18	NC_022576	TGA	2	6	938	943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550989633
19	NC_022576	GAA	2	6	1099	1104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550989633
20	NC_022576	TCG	2	6	1115	1120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989633
21	NC_022576	AGA	2	6	1283	1288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550989633
22	NC_022576	ACT	2	6	1298	1303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550989633
23	NC_022576	AGA	2	6	1400	1405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550989633
24	NC_022576	CAG	2	6	1510	1515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989633
25	NC_022576	TCT	2	6	1651	1656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550989634
26	NC_022576	CAC	2	6	1661	1666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	550989634
27	NC_022576	TCG	2	6	1708	1713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989634
28	NC_022576	CGC	2	6	1716	1721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550989634
29	NC_022576	CGG	2	6	1826	1831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550989634
30	NC_022576	CGA	2	6	1841	1846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989634
31	NC_022576	CGT	2	6	1937	1942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989634
32	NC_022576	GAC	2	6	2016	2021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989634
33	NC_022576	GCA	2	6	2093	2098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989634
34	NC_022576	CTA	2	6	2108	2113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550989634
35	NC_022576	TCG	2	6	2158	2163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989634
36	NC_022576	CGA	2	6	2276	2281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989634
37	NC_022576	GTC	2	6	2526	2531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989634
38	NC_022576	GAA	2	6	2550	2555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550989634
39	NC_022576	CGA	2	6	2648	2653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989634
40	NC_022576	TGC	2	6	2692	2697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989634
41	NC_022576	TGA	2	6	2708	2713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550989634
42	NC_022576	CGT	2	6	2729	2734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989634
43	NC_022576	CCA	2	6	2781	2786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	550989635
44	NC_022576	GAA	2	6	2792	2797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550989635
45	NC_022576	GGA	2	6	2848	2853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	550989635
46	NC_022576	CAC	2	6	2960	2965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	550989635
47	NC_022576	GTC	2	6	2978	2983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989635
48	NC_022576	TCG	2	6	3027	3032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989635
49	NC_022576	CGT	2	6	3061	3066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989635
50	NC_022576	TGC	2	6	3130	3135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989635
51	NC_022576	CGG	2	6	3199	3204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550989635
52	NC_022576	TGC	2	6	3249	3254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989635
53	NC_022576	ACG	2	6	3336	3341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989635
54	NC_022576	CAG	2	6	3428	3433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989635
55	NC_022576	ACG	2	6	3450	3455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989635
56	NC_022576	AGG	2	6	3534	3539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	550989635
57	NC_022576	TCA	2	6	3582	3587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550989635
58	NC_022576	AAC	2	6	3689	3694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	550989635
59	NC_022576	CAA	2	6	3724	3729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	550989635
60	NC_022576	TCA	2	6	3789	3794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550989635
61	NC_022576	CGA	2	6	3805	3810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989635
62	NC_022576	CGA	2	6	3850	3855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989635
63	NC_022576	CAG	2	6	3910	3915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989635
64	NC_022576	GGA	2	6	3961	3966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	550989635
65	NC_022576	GCT	2	6	3979	3984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989635
66	NC_022576	TCG	2	6	4026	4031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989635
67	NC_022576	GCC	2	6	4064	4069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550989635
68	NC_022576	CGC	2	6	4091	4096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550989635
69	NC_022576	TCG	2	6	4179	4184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989635
70	NC_022576	CCG	2	6	4194	4199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550989635
71	NC_022576	GCT	2	6	4294	4299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989635
72	NC_022576	ACC	2	6	4404	4409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	550989635
73	NC_022576	CAT	4	12	4411	4422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550989635
74	NC_022576	TGC	2	6	4461	4466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989635
75	NC_022576	CTT	2	6	4471	4476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550989635
76	NC_022576	TGG	2	6	4497	4502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550989635
77	NC_022576	CTG	2	6	4601	4606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989635
78	NC_022576	CGA	2	6	4642	4647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989635
79	NC_022576	TGC	2	6	4659	4664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989635
80	NC_022576	ATC	2	6	4715	4720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550989635
81	NC_022576	TCG	2	6	4764	4769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989635
82	NC_022576	ATC	2	6	4898	4903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550989635
83	NC_022576	GCC	2	6	4985	4990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550989635
84	NC_022576	GCT	2	6	5203	5208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989635
85	NC_022576	CGA	2	6	5221	5226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989635
86	NC_022576	AAC	2	6	5300	5305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	550989635
87	NC_022576	GCT	2	6	5308	5313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989635
88	NC_022576	GAT	2	6	5700	5705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550989636
89	NC_022576	TTC	2	6	5719	5724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550989636
90	NC_022576	GCC	2	6	5862	5867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550989636
91	NC_022576	TTG	2	6	5919	5924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550989636
92	NC_022576	GAC	2	6	5989	5994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989636
93	NC_022576	GGT	2	6	6034	6039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550989637
94	NC_022576	GCC	2	6	6051	6056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550989637
95	NC_022576	AAC	2	6	6105	6110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	550989637
96	NC_022576	AGG	2	6	6113	6118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	550989637
97	NC_022576	GGA	2	6	6121	6126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	550989637
98	NC_022576	CCG	2	6	6138	6143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550989637
99	NC_022576	GGC	2	6	6174	6179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550989637
100	NC_022576	TTG	2	6	6203	6208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550989637
101	NC_022576	TTG	2	6	6215	6220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550989637
102	NC_022576	GAT	2	6	6465	6470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550989637
103	NC_022576	GCC	2	6	6801	6806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550989638
104	NC_022576	AGA	2	6	6858	6863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550989638
105	NC_022576	GCT	2	6	7016	7021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989638
106	NC_022576	CAG	2	6	7030	7035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989638
107	NC_022576	GTT	2	6	7100	7105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550989639
108	NC_022576	CAA	2	6	7251	7256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	550989639
109	NC_022576	GAA	2	6	7368	7373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550989639
110	NC_022576	TAG	2	6	7414	7419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550989639
111	NC_022576	GAT	2	6	7461	7466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550989639
112	NC_022576	TGG	2	6	7483	7488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550989639
113	NC_022576	TGT	2	6	7568	7573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550989639
114	NC_022576	ATT	2	6	7593	7598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550989639
115	NC_022576	GCA	2	6	7605	7610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989639
116	NC_022576	CAA	2	6	7666	7671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	550989639
117	NC_022576	TGG	2	6	7684	7689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550989639
118	NC_022576	ATG	2	6	7704	7709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550989639
119	NC_022576	TGG	2	6	7737	7742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550989639
120	NC_022576	TGA	2	6	7862	7867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550989639
121	NC_022576	CTG	2	6	7885	7890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989639
122	NC_022576	TAG	2	6	7933	7938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550989639
123	NC_022576	TAT	2	6	7955	7960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550989639
124	NC_022576	GCA	2	6	8003	8008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989639
125	NC_022576	TCT	2	6	8018	8023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550989639
126	NC_022576	CAT	2	6	8041	8046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550989639
127	NC_022576	ATT	2	6	8257	8262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550989639
128	NC_022576	TGG	2	6	8279	8284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550989639
129	NC_022576	GCA	2	6	8292	8297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989639
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134	NC_022576	GGA	2	6	8705	8710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	550989640
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137	NC_022576	GCA	2	6	8849	8854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989640
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252	NC_022576	TGC	2	6	18834	18839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989649
253	NC_022576	AGC	2	6	18843	18848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989649
254	NC_022576	CGA	2	6	18969	18974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989649
255	NC_022576	ACG	2	6	19014	19019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989649
256	NC_022576	CGT	2	6	19213	19218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989649
257	NC_022576	CGA	2	6	19300	19305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989649
258	NC_022576	CGT	2	6	19364	19369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989649
259	NC_022576	GTC	2	6	19378	19383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989649
260	NC_022576	ATC	2	6	19550	19555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550989649
261	NC_022576	GGA	2	6	19612	19617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	550989649
262	NC_022576	CGA	3	9	19689	19697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989649
263	NC_022576	TCG	2	6	19698	19703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989649
264	NC_022576	GAA	2	6	19838	19843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550989649
265	NC_022576	TTC	2	6	20087	20092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550989650
266	NC_022576	GGT	2	6	20141	20146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550989650
267	NC_022576	GCA	2	6	20175	20180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989650
268	NC_022576	TCG	2	6	20253	20258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989650
269	NC_022576	TCA	2	6	20458	20463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550989650
270	NC_022576	CAG	2	6	21059	21064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989651
271	NC_022576	TTC	2	6	21095	21100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550989651
272	NC_022576	GTC	2	6	21146	21151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989651
273	NC_022576	GCA	3	9	21234	21242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989651
274	NC_022576	TCA	2	6	21307	21312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550989651
275	NC_022576	GCA	2	6	21363	21368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989652
276	NC_022576	ACG	2	6	21503	21508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989652
277	NC_022576	ATG	2	6	21566	21571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550989652
278	NC_022576	GCC	2	6	21674	21679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550989652
279	NC_022576	CGG	2	6	21774	21779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550989652
280	NC_022576	GGA	2	6	21780	21785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	550989652
281	NC_022576	CTG	2	6	21808	21813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989652
282	NC_022576	GCG	2	6	21840	21845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550989652
283	NC_022576	TTC	2	6	22147	22152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550989652
284	NC_022576	CGA	2	6	22185	22190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989652
285	NC_022576	CCG	2	6	22258	22263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550989652
286	NC_022576	CCA	2	6	22309	22314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	550989652
287	NC_022576	CGG	2	6	22493	22498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550989653
288	NC_022576	CTG	2	6	22503	22508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989653
289	NC_022576	CAT	2	6	22521	22526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550989653
290	NC_022576	TCT	2	6	22534	22539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550989653
291	NC_022576	GCA	2	6	22543	22548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989653
292	NC_022576	TCC	2	6	22588	22593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	550989653
293	NC_022576	GCG	2	6	22639	22644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550989653
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333	NC_022576	CAC	2	6	25829	25834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	550989657
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357	NC_022576	AGG	2	6	28123	28128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	550989658
358	NC_022576	TGA	2	6	28130	28135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550989658
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373	NC_022576	GCA	2	6	29168	29173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989658
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498	NC_022576	CAG	2	6	36478	36483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989669
499	NC_022576	TGC	2	6	36516	36521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989669
500	NC_022576	GCC	2	6	36547	36552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550989669

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