MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia pecorum P787

Total Repeats: 13309

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022441	AGA	2	6	178	183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632603
2	NC_022441	GCA	2	6	196	201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632603
3	NC_022441	GAA	2	6	286	291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632603
4	NC_022441	TTC	2	6	432	437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632603
5	NC_022441	TAC	2	6	531	536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545632603
6	NC_022441	ATG	2	6	545	550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545632603
7	NC_022441	ATG	2	6	661	666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545632603
8	NC_022441	GAA	2	6	671	676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632603
9	NC_022441	CTT	3	9	752	760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632603
10	NC_022441	ATC	2	6	764	769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545632603
11	NC_022441	TCT	2	6	787	792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632603
12	NC_022441	GAA	2	6	1129	1134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632603
13	NC_022441	TTC	2	6	1141	1146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632603
14	NC_022441	CTT	2	6	1201	1206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632604
15	NC_022441	TCT	2	6	1263	1268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632604
16	NC_022441	TGA	2	6	1318	1323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545632604
17	NC_022441	GAA	2	6	1451	1456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632604
18	NC_022441	GTT	2	6	1535	1540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545632604
19	NC_022441	GAT	2	6	1579	1584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545632604
20	NC_022441	TGT	2	6	1685	1690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545632604
21	NC_022441	GAA	2	6	1772	1777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632604
22	NC_022441	GCT	2	6	2152	2157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545632604
23	NC_022441	AAG	2	6	2230	2235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632604
24	NC_022441	TTG	2	6	2266	2271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545632604
25	NC_022441	TTA	2	6	2275	2280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545632604
26	NC_022441	GGA	2	6	2476	2481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545632604
27	NC_022441	CCT	2	6	2677	2682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545632605
28	NC_022441	AGG	2	6	2719	2724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545632605
29	NC_022441	TTA	2	6	2775	2780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545632605
30	NC_022441	AGG	2	6	2877	2882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545632605
31	NC_022441	AGG	2	6	2926	2931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545632605
32	NC_022441	TAT	2	6	2978	2983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545632605
33	NC_022441	AGC	2	6	3161	3166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632606
34	NC_022441	TGA	2	6	3222	3227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545632606
35	NC_022441	TTC	2	6	3347	3352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632606
36	NC_022441	TCA	2	6	3552	3557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545632606
37	NC_022441	AGA	2	6	3605	3610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632606
38	NC_022441	ATG	2	6	3634	3639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545632606
39	NC_022441	CTT	2	6	3699	3704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632606
40	NC_022441	GAG	2	6	3736	3741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545632606
41	NC_022441	TGG	2	6	3865	3870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545632606
42	NC_022441	ATA	2	6	4004	4009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545632606
43	NC_022441	TTG	2	6	4256	4261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545632606
44	NC_022441	GAA	2	6	4290	4295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632606
45	NC_022441	TCT	2	6	4319	4324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632606
46	NC_022441	CCT	2	6	4343	4348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545632606
47	NC_022441	ATG	2	6	4447	4452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545632606
48	NC_022441	GAT	2	6	4656	4661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545632606
49	NC_022441	TCT	2	6	4726	4731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632606
50	NC_022441	TTC	2	6	4745	4750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632606
51	NC_022441	GGT	2	6	4764	4769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545632606
52	NC_022441	GAA	2	6	4790	4795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632606
53	NC_022441	GAA	2	6	4807	4812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632606
54	NC_022441	TTG	2	6	4871	4876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545632606
55	NC_022441	TGG	2	6	4886	4891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545632606
56	NC_022441	AGG	2	6	4985	4990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545632606
57	NC_022441	AGA	2	6	5007	5012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632606
58	NC_022441	TGT	2	6	5186	5191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545632606
59	NC_022441	TGA	2	6	5265	5270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545632606
60	NC_022441	TGC	2	6	5450	5455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545632607
61	NC_022441	AGA	2	6	5489	5494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632607
62	NC_022441	TAT	2	6	5519	5524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545632607
63	NC_022441	GAA	2	6	5598	5603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632607
64	NC_022441	CAA	2	6	5609	5614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545632607
65	NC_022441	TGG	2	6	5698	5703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545632607
66	NC_022441	TGT	2	6	5843	5848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545632607
67	NC_022441	TTG	2	6	5948	5953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545632607
68	NC_022441	TTC	2	6	6010	6015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632607
69	NC_022441	CTG	2	6	6112	6117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545632607
70	NC_022441	TTG	2	6	6130	6135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545632607
71	NC_022441	GAA	2	6	6210	6215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632607
72	NC_022441	TCT	2	6	6228	6233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632607
73	NC_022441	AGG	2	6	6347	6352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545632607
74	NC_022441	ACA	2	6	6516	6521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545632607
75	NC_022441	TCA	2	6	6566	6571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545632607
76	NC_022441	TGT	2	6	6652	6657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545632608
77	NC_022441	TTA	2	6	6796	6801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545632608
78	NC_022441	ACC	2	6	6814	6819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545632608
79	NC_022441	AGG	2	6	6842	6847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545632608
80	NC_022441	CAG	2	6	6853	6858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632608
81	NC_022441	CCT	2	6	6862	6867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545632608
82	NC_022441	AGA	2	6	6989	6994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632608
83	NC_022441	TGG	2	6	7129	7134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545632608
84	NC_022441	ACA	2	6	7137	7142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545632608
85	NC_022441	GAG	2	6	7340	7345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545632608
86	NC_022441	GAA	2	6	7360	7365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632608
87	NC_022441	TCC	2	6	7422	7427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545632608
88	NC_022441	ATT	2	6	7593	7598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545632608
89	NC_022441	GAA	2	6	7660	7665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632609
90	NC_022441	TGG	2	6	7689	7694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545632609
91	NC_022441	AGC	2	6	7721	7726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632609
92	NC_022441	TAA	2	6	7845	7850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545632609
93	NC_022441	CTT	3	9	7897	7905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632609
94	NC_022441	CCT	2	6	7924	7929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545632609
95	NC_022441	AGC	2	6	8010	8015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632609
96	NC_022441	GAT	2	6	8069	8074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545632609
97	NC_022441	AGA	2	6	8189	8194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632609
98	NC_022441	GGA	2	6	8208	8213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545632609
99	NC_022441	TAG	2	6	8225	8230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545632609
100	NC_022441	GGA	2	6	8292	8297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545632609
101	NC_022441	TTC	2	6	8387	8392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632609
102	NC_022441	TGC	2	6	8445	8450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545632609
103	NC_022441	GTG	2	6	8607	8612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545632609
104	NC_022441	CTT	2	6	8659	8664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632609
105	NC_022441	GAA	2	6	8684	8689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632609
106	NC_022441	GCA	2	6	8698	8703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632609
107	NC_022441	GAA	2	6	8721	8726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632609
108	NC_022441	AGG	2	6	8793	8798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545632609
109	NC_022441	CAA	2	6	8837	8842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545632609
110	NC_022441	TGT	2	6	8882	8887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545632609
111	NC_022441	GCT	2	6	8936	8941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545632609
112	NC_022441	AGA	2	6	8982	8987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632609
113	NC_022441	GAA	2	6	9031	9036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632609
114	NC_022441	TAA	2	6	9079	9084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545632609
115	NC_022441	TGG	2	6	9141	9146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545632609
116	NC_022441	AGA	2	6	9170	9175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632609
117	NC_022441	GAA	2	6	9234	9239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632609
118	NC_022441	AGA	2	6	9407	9412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632609
119	NC_022441	AGA	2	6	9526	9531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632609
120	NC_022441	TCA	2	6	9564	9569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545632609
121	NC_022441	AGA	2	6	9599	9604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632609
122	NC_022441	GGA	2	6	9626	9631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545632609
123	NC_022441	TCA	2	6	9660	9665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545632609
124	NC_022441	AAG	2	6	9772	9777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632609
125	NC_022441	CGA	2	6	10013	10018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632609
126	NC_022441	GAG	2	6	10070	10075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545632609
127	NC_022441	CTC	2	6	10085	10090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545632609
128	NC_022441	AGC	2	6	10104	10109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632609
129	NC_022441	TCA	2	6	10183	10188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545632609
130	NC_022441	TTG	2	6	10295	10300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545632609
131	NC_022441	AGC	2	6	10383	10388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632609
132	NC_022441	GGA	2	6	10403	10408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545632609
133	NC_022441	CTT	2	6	10467	10472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632609
134	NC_022441	GTT	2	6	10489	10494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545632609
135	NC_022441	TGC	2	6	10508	10513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545632609
136	NC_022441	GGA	2	6	10576	10581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545632609
137	NC_022441	GAT	2	6	10760	10765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545632610
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139	NC_022441	GCA	2	6	10870	10875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632610
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142	NC_022441	TTC	2	6	11412	11417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632610
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148	NC_022441	TCT	2	6	11872	11877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632610
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152	NC_022441	CTT	2	6	12332	12337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632610
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155	NC_022441	CTT	2	6	12722	12727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632610
156	NC_022441	TGT	2	6	12772	12777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545632610
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162	NC_022441	GTT	2	6	13331	13336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545632610
163	NC_022441	CGT	2	6	13581	13586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545632610
164	NC_022441	CAA	2	6	13595	13600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545632610
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242	NC_022441	ATT	2	6	19409	19414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545632615
243	NC_022441	CAT	2	6	19694	19699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545632615
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247	NC_022441	CAA	2	6	20075	20080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545632616
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253	NC_022441	CTT	2	6	20755	20760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632616
254	NC_022441	GGA	2	6	20938	20943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545632616
255	NC_022441	CAA	2	6	20981	20986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545632616
256	NC_022441	TTG	2	6	21083	21088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545632616
257	NC_022441	CTT	2	6	21137	21142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632616
258	NC_022441	GAT	2	6	21211	21216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545632616
259	NC_022441	CTT	2	6	21459	21464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632617
260	NC_022441	TGC	2	6	21547	21552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545632617
261	NC_022441	CTT	2	6	21584	21589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632617
262	NC_022441	TCT	2	6	21599	21604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632617
263	NC_022441	TGA	2	6	21658	21663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545632617
264	NC_022441	AGC	2	6	21730	21735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632617
265	NC_022441	CTT	2	6	21741	21746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632617
266	NC_022441	AGC	2	6	21751	21756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632617
267	NC_022441	TGA	2	6	21784	21789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545632617
268	NC_022441	CAG	2	6	21791	21796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632617
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270	NC_022441	GGA	2	6	21880	21885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545632617
271	NC_022441	TCT	2	6	21902	21907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632617
272	NC_022441	TGC	2	6	21940	21945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545632617
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275	NC_022441	CCT	2	6	22016	22021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545632617
276	NC_022441	CTG	2	6	22041	22046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545632617
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278	NC_022441	TGC	2	6	22189	22194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545632617
279	NC_022441	CAA	2	6	22268	22273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545632617
280	NC_022441	AGC	2	6	22300	22305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632617
281	NC_022441	CTT	2	6	22335	22340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632617
282	NC_022441	AGG	2	6	22342	22347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545632617
283	NC_022441	GAT	2	6	22418	22423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545632617
284	NC_022441	ACT	2	6	22493	22498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545632617
285	NC_022441	GGA	2	6	22502	22507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545632617
286	NC_022441	GCT	2	6	22544	22549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545632617
287	NC_022441	AGA	3	9	22567	22575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632617
288	NC_022441	GCT	2	6	22583	22588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545632617
289	NC_022441	AGA	2	6	22591	22596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632617
290	NC_022441	CTG	2	6	22680	22685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545632617
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293	NC_022441	GCA	2	6	22850	22855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632617
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341	NC_022441	CAG	2	6	26344	26349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632619
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350	NC_022441	TAC	2	6	26991	26996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545632619
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353	NC_022441	GCA	3	9	27574	27582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632619
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372	NC_022441	AGA	2	6	28548	28553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632619
373	NC_022441	CGA	2	6	28613	28618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632619
374	NC_022441	CAA	2	6	28630	28635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545632619
375	NC_022441	GCA	2	6	28695	28700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632619
376	NC_022441	GTT	2	6	28711	28716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545632619
377	NC_022441	AAG	2	6	28761	28766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632619
378	NC_022441	CTT	2	6	28962	28967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632620
379	NC_022441	AAT	2	6	29092	29097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545632621
380	NC_022441	ATC	2	6	29121	29126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545632621
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382	NC_022441	TGA	2	6	29218	29223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545632621
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497	NC_022441	GAA	2	6	39677	39682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632632
498	NC_022441	GAG	2	6	39692	39697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545632632
499	NC_022441	CTT	3	9	39714	39722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632632
500	NC_022441	GCA	2	6	39731	39736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632632

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