MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia pecorum P787

Total Repeats: 21316

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2234	NC_022441	CAT	2	6	114576	114581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545632710
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2236	NC_022441	AT	3	6	114627	114632	50 %	50 %	0 %	0 %	545632710
2237	NC_022441	ATT	2	6	114664	114669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545632710
2238	NC_022441	GAA	3	9	114715	114723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632710
2239	NC_022441	TGT	2	6	114759	114764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545632710
2240	NC_022441	CTTT	2	8	114847	114854	0 %	75 %	0 %	25 %	545632710
2241	NC_022441	AAG	2	6	114925	114930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632710
2242	NC_022441	AAT	2	6	114932	114937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545632710
2243	NC_022441	TCAAGC	2	12	114971	114982	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	545632711
2244	NC_022441	A	7	7	114984	114990	100 %	0 %	0 %	0 %	545632711
2245	NC_022441	TAA	2	6	115052	115057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545632711
2246	NC_022441	TATC	2	8	115066	115073	25 %	50 %	0 %	25 %	545632711
2247	NC_022441	CTG	2	6	115108	115113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545632711
2248	NC_022441	GTC	2	6	115142	115147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545632711
2249	NC_022441	GCA	2	6	115155	115160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632711
2250	NC_022441	TGC	2	6	115166	115171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545632711
2251	NC_022441	TGC	2	6	115178	115183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545632711
2252	NC_022441	GAAGTT	2	12	115212	115223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545632711
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2262	NC_022441	TAT	2	6	115627	115632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545632712
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2265	NC_022441	GCT	2	6	115763	115768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545632712
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2274	NC_022441	TTC	2	6	116211	116216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632712
2275	NC_022441	TTG	2	6	116330	116335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545632712
2276	NC_022441	A	6	6	116354	116359	100 %	0 %	0 %	0 %	545632712
2277	NC_022441	AAAAG	2	10	116449	116458	80 %	0 %	20 %	0 %	545632712
2278	NC_022441	A	6	6	116475	116480	100 %	0 %	0 %	0 %	545632712
2279	NC_022441	GCA	2	6	116512	116517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632713
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2352	NC_022441	GAA	2	6	119587	119592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632716
2353	NC_022441	ACAG	2	8	119614	119621	50 %	0 %	25 %	25 %	545632716
2354	NC_022441	GTT	2	6	119637	119642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545632716
2355	NC_022441	AGC	2	6	119676	119681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632716
2356	NC_022441	AG	3	6	119725	119730	50 %	0 %	50 %	0 %	545632716
2357	NC_022441	AAGAG	2	10	119743	119752	60 %	0 %	40 %	0 %	545632716
2358	NC_022441	AGG	3	9	119754	119762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545632716
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2360	NC_022441	AAGAG	2	10	119827	119836	60 %	0 %	40 %	0 %	545632716
2361	NC_022441	GA	3	6	119847	119852	50 %	0 %	50 %	0 %	545632716
2362	NC_022441	AATT	2	8	120118	120125	50 %	50 %	0 %	0 %	545632717
2363	NC_022441	TTC	2	6	120166	120171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632717
2364	NC_022441	GC	3	6	120180	120185	0 %	0 %	50 %	50 %	545632717
2365	NC_022441	CT	3	6	120192	120197	0 %	50 %	0 %	50 %	545632717
2366	NC_022441	GTG	2	6	120213	120218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545632717
2367	NC_022441	CTA	2	6	120237	120242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545632717
2368	NC_022441	TC	3	6	120295	120300	0 %	50 %	0 %	50 %	545632717
2369	NC_022441	GTTT	2	8	120326	120333	0 %	75 %	25 %	0 %	545632717
2370	NC_022441	AAAG	2	8	120440	120447	75 %	0 %	25 %	0 %	545632717
2371	NC_022441	TGT	2	6	120449	120454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545632717
2372	NC_022441	G	7	7	120462	120468	0 %	0 %	100 %	0 %	545632717
2373	NC_022441	CAG	2	6	120477	120482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632717
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2375	NC_022441	GAAG	2	8	120745	120752	50 %	0 %	50 %	0 %	545632718
2376	NC_022441	GAG	2	6	120818	120823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545632718
2377	NC_022441	CTCC	2	8	120892	120899	0 %	25 %	0 %	75 %	545632718
2378	NC_022441	TGC	2	6	120914	120919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545632718
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2383	NC_022441	CTT	2	6	121176	121181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632718
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2401	NC_022441	T	9	9	122057	122065	0 %	100 %	0 %	0 %	545632720
2402	NC_022441	ATA	2	6	122141	122146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545632720
2403	NC_022441	TCC	3	9	122226	122234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545632720
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2407	NC_022441	AG	3	6	122449	122454	50 %	0 %	50 %	0 %	545632720
2408	NC_022441	TTC	2	6	122623	122628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632721
2409	NC_022441	TTG	2	6	122656	122661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545632721
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2411	NC_022441	CGT	2	6	122760	122765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545632721
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2455	NC_022441	A	6	6	125434	125439	100 %	0 %	0 %	0 %	545632722
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2462	NC_022441	T	8	8	125614	125621	0 %	100 %	0 %	0 %	545632722
2463	NC_022441	GCC	2	6	125633	125638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545632722
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2470	NC_022441	CTTGT	2	10	125809	125818	0 %	60 %	20 %	20 %	545632722
2471	NC_022441	GCA	2	6	125832	125837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632722
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2473	NC_022441	TCT	2	6	125873	125878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632722
2474	NC_022441	GCA	2	6	125894	125899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632722
2475	NC_022441	GA	4	8	125970	125977	50 %	0 %	50 %	0 %	545632722
2476	NC_022441	GGA	2	6	125978	125983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545632722
2477	NC_022441	GAG	2	6	125991	125996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545632722
2478	NC_022441	TCTG	2	8	125999	126006	0 %	50 %	25 %	25 %	545632722
2479	NC_022441	GAT	2	6	126011	126016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545632722
2480	NC_022441	T	6	6	126591	126596	0 %	100 %	0 %	0 %	545632723
2481	NC_022441	GTGA	2	8	126642	126649	25 %	25 %	50 %	0 %	545632723
2482	NC_022441	TCG	2	6	126671	126676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545632723
2483	NC_022441	TTTGTA	2	12	126732	126743	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	545632723
2484	NC_022441	TTA	2	6	126748	126753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545632723
2485	NC_022441	CT	3	6	126754	126759	0 %	50 %	0 %	50 %	545632723
2486	NC_022441	TCTT	2	8	126814	126821	0 %	75 %	0 %	25 %	545632723
2487	NC_022441	TAT	2	6	126830	126835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545632723
2488	NC_022441	TGT	2	6	126905	126910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545632723
2489	NC_022441	ATC	2	6	126918	126923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545632723
2490	NC_022441	TTA	2	6	126924	126929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545632723
2491	NC_022441	CTG	2	6	126937	126942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545632723
2492	NC_022441	T	7	7	126990	126996	0 %	100 %	0 %	0 %	545632723
2493	NC_022441	GA	3	6	127005	127010	50 %	0 %	50 %	0 %	545632723
2494	NC_022441	AAG	2	6	127023	127028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632723
2495	NC_022441	TCA	2	6	127283	127288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545632724
2496	NC_022441	CTT	2	6	127366	127371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632724
2497	NC_022441	TTG	2	6	127383	127388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545632724
2498	NC_022441	ACT	2	6	127395	127400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545632724
2499	NC_022441	TCT	2	6	127402	127407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632724
2500	NC_022441	T	6	6	127468	127473	0 %	100 %	0 %	0 %	545632724

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