MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia pecorum W73

Total Repeats: 21269

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022440	A	6	6	49139	49144	100 %	0 %	0 %	0 %	545631716
1002	NC_022440	CAT	2	6	49159	49164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545631716
1003	NC_022440	GCT	2	6	49281	49286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545631716
1004	NC_022440	GTAA	2	8	49294	49301	50 %	25 %	25 %	0 %	545631716
1005	NC_022440	CGA	2	6	49394	49399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545631716
1006	NC_022440	GTT	2	6	49435	49440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545631716
1007	NC_022440	AAC	2	6	49450	49455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545631716
1008	NC_022440	AT	3	6	49478	49483	50 %	50 %	0 %	0 %	545631716
1009	NC_022440	AGT	2	6	49497	49502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631716
1010	NC_022440	ACT	2	6	49513	49518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545631716
1011	NC_022440	TGT	2	6	49536	49541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545631716
1012	NC_022440	GCA	2	6	49582	49587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545631716
1013	NC_022440	ATG	2	6	49616	49621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631716
1014	NC_022440	GTT	2	6	49698	49703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545631716
1015	NC_022440	ATG	2	6	49748	49753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631716
1016	NC_022440	AGA	3	9	49815	49823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631716
1017	NC_022440	TCT	2	6	49873	49878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545631716
1018	NC_022440	AGC	2	6	49901	49906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545631716
1019	NC_022440	GAT	2	6	49948	49953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631716
1020	NC_022440	G	6	6	49977	49982	0 %	0 %	100 %	0 %	545631716
1021	NC_022440	TAGC	2	8	49991	49998	25 %	25 %	25 %	25 %	545631716
1022	NC_022440	GCGTTT	2	12	50004	50015	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	545631716
1023	NC_022440	GCA	2	6	50047	50052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545631716
1024	NC_022440	GTT	2	6	50200	50205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545631716
1025	NC_022440	TA	3	6	50245	50250	50 %	50 %	0 %	0 %	545631716
1026	NC_022440	TCC	2	6	50397	50402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545631716
1027	NC_022440	ATG	2	6	50467	50472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631716
1028	NC_022440	TCGTCA	2	12	50473	50484	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	545631716
1029	NC_022440	AGG	2	6	50547	50552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545631716
1030	NC_022440	CTTA	2	8	50553	50560	25 %	50 %	0 %	25 %	545631716
1031	NC_022440	CAG	2	6	50626	50631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545631716
1032	NC_022440	ATT	2	6	50680	50685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545631716
1033	NC_022440	CGT	2	6	50772	50777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545631716
1034	NC_022440	AGACA	2	10	50844	50853	60 %	0 %	20 %	20 %	545631716
1035	NC_022440	GCA	2	6	50857	50862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545631716
1036	NC_022440	ACA	2	6	50923	50928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545631716
1037	NC_022440	TAG	2	6	50985	50990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631716
1038	NC_022440	ATG	2	6	51022	51027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631716
1039	NC_022440	ACAA	2	8	51076	51083	75 %	0 %	0 %	25 %	545631716
1040	NC_022440	AAG	2	6	51176	51181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631716
1041	NC_022440	ATG	2	6	51216	51221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631716
1042	NC_022440	AGGA	2	8	51503	51510	50 %	0 %	50 %	0 %	545631717
1043	NC_022440	GCAAG	2	10	51595	51604	40 %	0 %	40 %	20 %	545631717
1044	NC_022440	GTT	2	6	51788	51793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545631717
1045	NC_022440	T	6	6	51810	51815	0 %	100 %	0 %	0 %	545631717
1046	NC_022440	AAGAT	2	10	51862	51871	60 %	20 %	20 %	0 %	545631717
1047	NC_022440	ACA	2	6	51915	51920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545631717
1048	NC_022440	AGG	2	6	51951	51956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545631717
1049	NC_022440	GAA	2	6	52098	52103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631717
1050	NC_022440	GGA	2	6	52195	52200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545631717
1051	NC_022440	CAA	2	6	52222	52227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545631717
1052	NC_022440	AAG	2	6	52229	52234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631717
1053	NC_022440	TAA	2	6	52252	52257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545631717
1054	NC_022440	AAG	2	6	52310	52315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631717
1055	NC_022440	GAA	2	6	52351	52356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631717
1056	NC_022440	TTC	3	9	52364	52372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545631717
1057	NC_022440	TGA	2	6	52388	52393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631717
1058	NC_022440	GTT	2	6	52479	52484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545631717
1059	NC_022440	TCT	2	6	52567	52572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545631718
1060	NC_022440	T	6	6	52575	52580	0 %	100 %	0 %	0 %	545631718
1061	NC_022440	GGA	2	6	52601	52606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545631718
1062	NC_022440	AGC	2	6	52608	52613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545631718
1063	NC_022440	CT	3	6	52693	52698	0 %	50 %	0 %	50 %	545631718
1064	NC_022440	ATG	2	6	52751	52756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631718
1065	NC_022440	GCT	2	6	52772	52777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545631718
1066	NC_022440	AAT	2	6	52884	52889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545631718
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1068	NC_022440	CTC	2	6	52920	52925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545631718
1069	NC_022440	AC	3	6	52970	52975	50 %	0 %	0 %	50 %	545631718
1070	NC_022440	AAC	2	6	53036	53041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545631718
1071	NC_022440	AAG	2	6	53448	53453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631719
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1073	NC_022440	TCA	2	6	53483	53488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545631719
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1075	NC_022440	TCT	2	6	53549	53554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545631719
1076	NC_022440	T	7	7	53569	53575	0 %	100 %	0 %	0 %	545631719
1077	NC_022440	TCGT	2	8	53582	53589	0 %	50 %	25 %	25 %	545631719
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1083	NC_022440	CAT	2	6	53778	53783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545631719
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1089	NC_022440	A	6	6	54141	54146	100 %	0 %	0 %	0 %	545631720
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1094	NC_022440	AGCA	2	8	54473	54480	50 %	0 %	25 %	25 %	545631720
1095	NC_022440	GA	3	6	54621	54626	50 %	0 %	50 %	0 %	545631720
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1100	NC_022440	GTT	2	6	54830	54835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545631721
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1105	NC_022440	TC	3	6	55157	55162	0 %	50 %	0 %	50 %	545631721
1106	NC_022440	GTC	2	6	55191	55196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545631721
1107	NC_022440	GAGG	2	8	55203	55210	25 %	0 %	75 %	0 %	545631721
1108	NC_022440	ACG	2	6	55220	55225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545631721
1109	NC_022440	CTT	2	6	55271	55276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545631721
1110	NC_022440	ATT	2	6	55311	55316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545631721
1111	NC_022440	CAA	2	6	55319	55324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545631721
1112	NC_022440	TAA	2	6	55382	55387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545631721
1113	NC_022440	CTT	2	6	55391	55396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545631721
1114	NC_022440	T	6	6	55413	55418	0 %	100 %	0 %	0 %	545631721
1115	NC_022440	GCA	2	6	55423	55428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545631721
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1118	NC_022440	TC	3	6	55561	55566	0 %	50 %	0 %	50 %	545631721
1119	NC_022440	TCC	2	6	55629	55634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545631722
1120	NC_022440	TCT	3	9	55635	55643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545631722
1121	NC_022440	ATC	2	6	55652	55657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545631722
1122	NC_022440	ACC	2	6	55682	55687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545631722
1123	NC_022440	GA	3	6	55705	55710	50 %	0 %	50 %	0 %	545631722
1124	NC_022440	AAT	2	6	55742	55747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545631722
1125	NC_022440	GTC	2	6	55793	55798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545631722
1126	NC_022440	CTA	2	6	55846	55851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545631722
1127	NC_022440	CCA	2	6	55915	55920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545631722
1128	NC_022440	T	6	6	55968	55973	0 %	100 %	0 %	0 %	545631722
1129	NC_022440	T	6	6	55978	55983	0 %	100 %	0 %	0 %	545631722
1130	NC_022440	GTT	2	6	55984	55989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545631722
1131	NC_022440	TTTC	2	8	56008	56015	0 %	75 %	0 %	25 %	545631722
1132	NC_022440	TTTC	2	8	56046	56053	0 %	75 %	0 %	25 %	545631722
1133	NC_022440	TGTT	2	8	56095	56102	0 %	75 %	25 %	0 %	545631722
1134	NC_022440	CCT	2	6	56109	56114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545631722
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1140	NC_022440	CAA	2	6	56221	56226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545631722
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1143	NC_022440	ATTG	2	8	56853	56860	25 %	50 %	25 %	0 %	545631723
1144	NC_022440	TTG	2	6	56968	56973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545631723
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1148	NC_022440	TGC	2	6	57150	57155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545631723
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1150	NC_022440	TA	3	6	57425	57430	50 %	50 %	0 %	0 %	545631723
1151	NC_022440	CTA	2	6	57434	57439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545631723
1152	NC_022440	ATAC	2	8	57465	57472	50 %	25 %	0 %	25 %	545631723
1153	NC_022440	AGT	2	6	57480	57485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631723
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1163	NC_022440	CTG	2	6	58504	58509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545631724
1164	NC_022440	TAT	2	6	58530	58535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545631724
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1210	NC_022440	A	6	6	61097	61102	100 %	0 %	0 %	0 %	545631724
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1219	NC_022440	T	7	7	61816	61822	0 %	100 %	0 %	0 %	545631725
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1225	NC_022440	CCAT	2	8	62151	62158	25 %	25 %	0 %	50 %	545631725
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1238	NC_022440	CAAT	2	8	63289	63296	50 %	25 %	0 %	25 %	545631726
1239	NC_022440	A	6	6	63333	63338	100 %	0 %	0 %	0 %	545631726
1240	NC_022440	TCT	2	6	63422	63427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545631726
1241	NC_022440	AAG	2	6	63490	63495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631726
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1244	NC_022440	AAG	2	6	63712	63717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631726
1245	NC_022440	ATT	2	6	63741	63746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545631726
1246	NC_022440	G	6	6	63755	63760	0 %	0 %	100 %	0 %	545631726
1247	NC_022440	TTC	2	6	63800	63805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545631726
1248	NC_022440	TGC	2	6	63818	63823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545631726
1249	NC_022440	TGT	2	6	63824	63829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545631726
1250	NC_022440	GTTG	2	8	63833	63840	0 %	50 %	50 %	0 %	545631726
1251	NC_022440	TG	3	6	63946	63951	0 %	50 %	50 %	0 %	545631726
1252	NC_022440	GCGT	2	8	63955	63962	0 %	25 %	50 %	25 %	545631726
1253	NC_022440	AGC	2	6	63995	64000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545631726
1254	NC_022440	GAG	2	6	64033	64038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545631726
1255	NC_022440	AG	3	6	64040	64045	50 %	0 %	50 %	0 %	545631726
1256	NC_022440	CTAA	2	8	64071	64078	50 %	25 %	0 %	25 %	545631726
1257	NC_022440	ACC	2	6	64131	64136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545631726
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1261	NC_022440	GAT	2	6	64353	64358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631726
1262	NC_022440	TGT	2	6	64363	64368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545631726
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1287	NC_022440	AG	3	6	65679	65684	50 %	0 %	50 %	0 %	545631728
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1291	NC_022440	TCA	2	6	65847	65852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545631728
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1375	NC_022440	C	6	6	69739	69744	0 %	0 %	0 %	100 %	545631732
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1378	NC_022440	TAT	2	6	69781	69786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545631732
1379	NC_022440	TGT	2	6	69849	69854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545631732
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1382	NC_022440	TGC	2	6	69882	69887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545631732
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1500	NC_022440	TCT	2	6	76567	76572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545631738

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