MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia pecorum W73

Total Repeats: 21269

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12502	NC_022440	TA	3	6	653303	653308	50 %	50 %	0 %	0 %	545632228
12503	NC_022440	CAC	2	6	653397	653402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545632228
12504	NC_022440	GGA	2	6	653458	653463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545632228
12505	NC_022440	GCA	2	6	653482	653487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632228
12506	NC_022440	A	7	7	653496	653502	100 %	0 %	0 %	0 %	545632228
12507	NC_022440	TTG	2	6	653616	653621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545632228
12508	NC_022440	TCC	2	6	653642	653647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545632228
12509	NC_022440	CTTGCG	2	12	653653	653664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545632228
12510	NC_022440	CTC	2	6	653700	653705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545632228
12511	NC_022440	TAAA	2	8	653720	653727	75 %	25 %	0 %	0 %	545632228
12512	NC_022440	CTCC	2	8	653758	653765	0 %	25 %	0 %	75 %	545632228
12513	NC_022440	TCC	2	6	653789	653794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545632228
12514	NC_022440	CCA	2	6	653810	653815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545632228
12515	NC_022440	TCA	2	6	653824	653829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545632228
12516	NC_022440	TAC	2	6	653838	653843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545632228
12517	NC_022440	TCT	2	6	653876	653881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632228
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12519	NC_022440	AGC	2	6	653952	653957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632228
12520	NC_022440	T	6	6	653970	653975	0 %	100 %	0 %	0 %	545632228
12521	NC_022440	A	8	8	654046	654053	100 %	0 %	0 %	0 %	545632228
12522	NC_022440	A	7	7	654055	654061	100 %	0 %	0 %	0 %	545632228
12523	NC_022440	A	6	6	654063	654068	100 %	0 %	0 %	0 %	545632228
12524	NC_022440	CA	3	6	654075	654080	50 %	0 %	0 %	50 %	545632228
12525	NC_022440	T	6	6	654249	654254	0 %	100 %	0 %	0 %	545632229
12526	NC_022440	T	7	7	654261	654267	0 %	100 %	0 %	0 %	545632229
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12530	NC_022440	TCCC	2	8	654542	654549	0 %	25 %	0 %	75 %	545632229
12531	NC_022440	TCC	2	6	654597	654602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545632229
12532	NC_022440	GGAT	2	8	654629	654636	25 %	25 %	50 %	0 %	545632229
12533	NC_022440	CTT	2	6	654671	654676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632229
12534	NC_022440	CT	3	6	654757	654762	0 %	50 %	0 %	50 %	545632229
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12541	NC_022440	GTATC	2	10	654939	654948	20 %	40 %	20 %	20 %	545632229
12542	NC_022440	GTTT	2	8	654990	654997	0 %	75 %	25 %	0 %	545632229
12543	NC_022440	ATGA	2	8	655014	655021	50 %	25 %	25 %	0 %	545632229
12544	NC_022440	ATC	2	6	655050	655055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545632230
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12550	NC_022440	CTA	2	6	655228	655233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545632230
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12552	NC_022440	CT	3	6	655316	655321	0 %	50 %	0 %	50 %	545632230
12553	NC_022440	ACA	2	6	655367	655372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545632230
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12556	NC_022440	GCT	2	6	655450	655455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545632230
12557	NC_022440	ACA	2	6	655557	655562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545632230
12558	NC_022440	GAT	2	6	655634	655639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545632230
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12561	NC_022440	TCG	2	6	655711	655716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545632230
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12592	NC_022440	AG	3	6	657528	657533	50 %	0 %	50 %	0 %	545632232
12593	NC_022440	T	6	6	657535	657540	0 %	100 %	0 %	0 %	545632232
12594	NC_022440	GGCC	2	8	657563	657570	0 %	0 %	50 %	50 %	545632232
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12602	NC_022440	T	6	6	657807	657812	0 %	100 %	0 %	0 %	545632233
12603	NC_022440	CAA	2	6	657854	657859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545632233
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12607	NC_022440	TC	3	6	658002	658007	0 %	50 %	0 %	50 %	545632233
12608	NC_022440	TGGT	2	8	658030	658037	0 %	50 %	50 %	0 %	545632233
12609	NC_022440	TTTC	2	8	658039	658046	0 %	75 %	0 %	25 %	545632233
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12617	NC_022440	AGC	2	6	658428	658433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632233
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12620	NC_022440	TCC	2	6	658491	658496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545632233
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12622	NC_022440	A	7	7	658546	658552	100 %	0 %	0 %	0 %	545632233
12623	NC_022440	CTT	2	6	658600	658605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632233
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12739	NC_022440	T	7	7	664371	664377	0 %	100 %	0 %	0 %	545632237
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12741	NC_022440	TA	3	6	664392	664397	50 %	50 %	0 %	0 %	545632237
12742	NC_022440	AG	3	6	664446	664451	50 %	0 %	50 %	0 %	545632237
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12746	NC_022440	CCT	2	6	664604	664609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545632237
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12863	NC_022440	T	7	7	670694	670700	0 %	100 %	0 %	0 %	545632241
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12866	NC_022440	TGAA	2	8	670756	670763	50 %	25 %	25 %	0 %	545632241
12867	NC_022440	GCA	2	6	670794	670799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632241
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12966	NC_022440	TCCT	2	8	675610	675617	0 %	50 %	0 %	50 %	545632242
12967	NC_022440	TTC	2	6	675713	675718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632242
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12970	NC_022440	GAC	2	6	675971	675976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632242
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12972	NC_022440	TC	3	6	676050	676055	0 %	50 %	0 %	50 %	545632242
12973	NC_022440	ATA	2	6	676073	676078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545632242
12974	NC_022440	C	6	6	676089	676094	0 %	0 %	0 %	100 %	545632242
12975	NC_022440	GCA	2	6	676096	676101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632242
12976	NC_022440	CTTTG	2	10	676138	676147	0 %	60 %	20 %	20 %	545632242
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12979	NC_022440	CCT	2	6	676214	676219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545632242
12980	NC_022440	TCC	2	6	676270	676275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545632242
12981	NC_022440	TTTCCA	2	12	676282	676293	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	545632242
12982	NC_022440	TTGC	2	8	676301	676308	0 %	50 %	25 %	25 %	545632242
12983	NC_022440	TAA	2	6	676372	676377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545632242
12984	NC_022440	CTC	2	6	676416	676421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545632242
12985	NC_022440	TTC	3	9	676425	676433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632242
12986	NC_022440	TGC	2	6	676549	676554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545632242
12987	NC_022440	ATA	2	6	676626	676631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545632242
12988	NC_022440	TCAC	2	8	676687	676694	25 %	25 %	0 %	50 %	545632242
12989	NC_022440	GC	3	6	676762	676767	0 %	0 %	50 %	50 %	545632243
12990	NC_022440	TCC	2	6	676799	676804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545632243
12991	NC_022440	AGC	2	6	676859	676864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632243
12992	NC_022440	CAC	2	6	676899	676904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545632243
12993	NC_022440	TCA	2	6	676957	676962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545632243
12994	NC_022440	GAA	2	6	676977	676982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632243
12995	NC_022440	CAC	2	6	677014	677019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545632243
12996	NC_022440	AGC	2	6	677051	677056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632243
12997	NC_022440	GCA	2	6	677100	677105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632243
12998	NC_022440	CTG	2	6	677110	677115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545632243
12999	NC_022440	CTA	2	6	677134	677139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545632243
13000	NC_022440	CGT	2	6	677184	677189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545632243

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