MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia pecorum W73

Total Repeats: 21269

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022440	AG	3	6	23961	23966	50 %	0 %	50 %	0 %	545631692
502	NC_022440	CAC	2	6	24058	24063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545631692
503	NC_022440	CTT	2	6	24079	24084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545631692
504	NC_022440	GTA	2	6	24113	24118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631692
505	NC_022440	GATA	2	8	24146	24153	50 %	25 %	25 %	0 %	545631692
506	NC_022440	TGC	2	6	24173	24178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545631692
507	NC_022440	GTT	2	6	24182	24187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545631692
508	NC_022440	AATT	2	8	24190	24197	50 %	50 %	0 %	0 %	545631692
509	NC_022440	TTAA	2	8	24201	24208	50 %	50 %	0 %	0 %	545631692
510	NC_022440	TGCT	2	8	24224	24231	0 %	50 %	25 %	25 %	545631692
511	NC_022440	TAAA	2	8	24258	24265	75 %	25 %	0 %	0 %	545631692
512	NC_022440	TGT	2	6	24384	24389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545631692
513	NC_022440	GCT	2	6	24411	24416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545631692
514	NC_022440	TTG	2	6	24425	24430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545631692
515	NC_022440	CACCTA	2	12	24472	24483	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	545631692
516	NC_022440	ATTT	2	8	24502	24509	25 %	75 %	0 %	0 %	545631692
517	NC_022440	T	7	7	24531	24537	0 %	100 %	0 %	0 %	545631692
518	NC_022440	ATA	2	6	24542	24547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545631692
519	NC_022440	A	6	6	24603	24608	100 %	0 %	0 %	0 %	545631692
520	NC_022440	TGT	2	6	24609	24614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545631692
521	NC_022440	TATG	2	8	24679	24686	25 %	50 %	25 %	0 %	545631692
522	NC_022440	AGT	2	6	24688	24693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631692
523	NC_022440	CCAA	2	8	24728	24735	50 %	0 %	0 %	50 %	545631692
524	NC_022440	TCC	2	6	24746	24751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545631692
525	NC_022440	GTAT	2	8	24785	24792	25 %	50 %	25 %	0 %	545631692
526	NC_022440	AGA	2	6	24795	24800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631692
527	NC_022440	T	6	6	24802	24807	0 %	100 %	0 %	0 %	545631692
528	NC_022440	CATAAG	2	12	24826	24837	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	545631692
529	NC_022440	AGC	2	6	24851	24856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545631692
530	NC_022440	TCCA	2	8	24933	24940	25 %	25 %	0 %	50 %	545631692
531	NC_022440	GTT	2	6	24979	24984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545631692
532	NC_022440	CTTTT	2	10	24994	25003	0 %	80 %	0 %	20 %	545631692
533	NC_022440	ATTAAG	2	12	25028	25039	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	545631692
534	NC_022440	TGC	2	6	25082	25087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545631692
535	NC_022440	TTG	2	6	25122	25127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545631692
536	NC_022440	TCC	2	6	25232	25237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545631692
537	NC_022440	AAG	2	6	25240	25245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631692
538	NC_022440	CTT	2	6	25309	25314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545631692
539	NC_022440	TGA	2	6	25381	25386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631692
540	NC_022440	AAG	2	6	25412	25417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631692
541	NC_022440	AGG	2	6	25456	25461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545631692
542	NC_022440	GCT	2	6	25470	25475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545631692
543	NC_022440	TCT	2	6	25494	25499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545631692
544	NC_022440	TCTG	2	8	25533	25540	0 %	50 %	25 %	25 %	545631692
545	NC_022440	CTG	2	6	25555	25560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545631692
546	NC_022440	AAG	2	6	25648	25653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631692
547	NC_022440	AAG	2	6	25673	25678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631692
548	NC_022440	TGT	2	6	25685	25690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545631692
549	NC_022440	CGC	2	6	25781	25786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545631692
550	NC_022440	T	6	6	25856	25861	0 %	100 %	0 %	0 %	545631692
551	NC_022440	AGA	2	6	25865	25870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631692
552	NC_022440	TAA	2	6	25909	25914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545631692
553	NC_022440	TTC	2	6	25988	25993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545631692
554	NC_022440	AGA	2	6	26099	26104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631692
555	NC_022440	AGA	2	6	26108	26113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631692
556	NC_022440	ATG	2	6	26324	26329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631693
557	NC_022440	TTC	2	6	26335	26340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545631693
558	NC_022440	AGA	2	6	26357	26362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631693
559	NC_022440	TCTT	2	8	26374	26381	0 %	75 %	0 %	25 %	545631693
560	NC_022440	CAG	2	6	26396	26401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545631693
561	NC_022440	CAG	2	6	26405	26410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545631693
562	NC_022440	TTA	2	6	26411	26416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545631693
563	NC_022440	ATT	2	6	26441	26446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545631693
564	NC_022440	AG	3	6	26521	26526	50 %	0 %	50 %	0 %	545631693
565	NC_022440	GCAGA	2	10	26543	26552	40 %	0 %	40 %	20 %	545631693
566	NC_022440	TCT	3	9	26606	26614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545631693
567	NC_022440	CAGGGA	2	12	26643	26654	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	545631693
568	NC_022440	TAT	2	6	26681	26686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545631693
569	NC_022440	TCA	2	6	26718	26723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545631693
570	NC_022440	GGA	2	6	26782	26787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545631693
571	NC_022440	TAA	2	6	26791	26796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545631693
572	NC_022440	GAAT	2	8	26944	26951	50 %	25 %	25 %	0 %	545631693
573	NC_022440	TAC	2	6	27052	27057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545631693
574	NC_022440	T	7	7	27072	27078	0 %	100 %	0 %	0 %	545631693
575	NC_022440	GA	3	6	27162	27167	50 %	0 %	50 %	0 %	545631693
576	NC_022440	CAG	3	9	27485	27493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545631693
577	NC_022440	CAA	2	6	27603	27608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545631693
578	NC_022440	GCA	3	9	27635	27643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545631693
579	NC_022440	ACA	2	6	27737	27742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545631693
580	NC_022440	ATAC	2	8	27750	27757	50 %	25 %	0 %	25 %	545631693
581	NC_022440	TAT	2	6	27810	27815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545631693
582	NC_022440	TTC	2	6	27837	27842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545631693
583	NC_022440	ACT	2	6	27878	27883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545631693
584	NC_022440	AGC	2	6	27913	27918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545631693
585	NC_022440	GAG	2	6	27950	27955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545631693
586	NC_022440	CAG	2	6	28007	28012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545631693
587	NC_022440	TTG	2	6	28014	28019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545631693
588	NC_022440	CAAG	2	8	28022	28029	50 %	0 %	25 %	25 %	545631693
589	NC_022440	GC	3	6	28036	28041	0 %	0 %	50 %	50 %	545631693
590	NC_022440	CTTC	2	8	28049	28056	0 %	50 %	0 %	50 %	545631693
591	NC_022440	CTT	2	6	28105	28110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545631693
592	NC_022440	TTC	2	6	28150	28155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545631693
593	NC_022440	GAT	2	6	28168	28173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631693
594	NC_022440	CTG	2	6	28242	28247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545631693
595	NC_022440	CTGGGT	2	12	28254	28265	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	545631693
596	NC_022440	GGA	2	6	28268	28273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545631693
597	NC_022440	AG	3	6	28297	28302	50 %	0 %	50 %	0 %	545631693
598	NC_022440	AGC	2	6	28336	28341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545631693
599	NC_022440	AGC	2	6	28351	28356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545631693
600	NC_022440	AAC	2	6	28428	28433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545631693
601	NC_022440	ACG	2	6	28436	28441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545631693
602	NC_022440	GGT	2	6	28571	28576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545631693
603	NC_022440	AGA	2	6	28609	28614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631693
604	NC_022440	CGA	2	6	28674	28679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545631693
605	NC_022440	CAA	2	6	28691	28696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545631693
606	NC_022440	GCA	2	6	28756	28761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545631693
607	NC_022440	GTT	2	6	28772	28777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545631693
608	NC_022440	AAG	2	6	28822	28827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631693
609	NC_022440	CA	3	6	28941	28946	50 %	0 %	0 %	50 %	545631694
610	NC_022440	CTT	2	6	29023	29028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545631694
611	NC_022440	AAT	2	6	29153	29158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545631695
612	NC_022440	ATC	2	6	29182	29187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545631695
613	NC_022440	A	8	8	29205	29212	100 %	0 %	0 %	0 %	545631695
614	NC_022440	ATA	2	6	29224	29229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545631695
615	NC_022440	AG	3	6	29250	29255	50 %	0 %	50 %	0 %	545631695
616	NC_022440	TGA	2	6	29279	29284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631695
617	NC_022440	TCA	2	6	29368	29373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545631695
618	NC_022440	AGA	2	6	29374	29379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631695
619	NC_022440	T	6	6	29454	29459	0 %	100 %	0 %	0 %	545631695
620	NC_022440	CAA	2	6	29489	29494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545631695
621	NC_022440	TTG	2	6	29514	29519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545631695
622	NC_022440	AAG	2	6	29748	29753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631695
623	NC_022440	GAAA	2	8	29781	29788	75 %	0 %	25 %	0 %	545631695
624	NC_022440	T	6	6	29805	29810	0 %	100 %	0 %	0 %	545631695
625	NC_022440	T	6	6	29817	29822	0 %	100 %	0 %	0 %	545631695
626	NC_022440	AG	3	6	29877	29882	50 %	0 %	50 %	0 %	545631696
627	NC_022440	TCT	2	6	29910	29915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545631696
628	NC_022440	TCTA	2	8	30023	30030	25 %	50 %	0 %	25 %	545631696
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739	NC_022440	TTAA	2	8	35932	35939	50 %	50 %	0 %	0 %	545631703
740	NC_022440	GTTT	2	8	35966	35973	0 %	75 %	25 %	0 %	545631703
741	NC_022440	GAA	2	6	35998	36003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631703
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744	NC_022440	CCT	2	6	36095	36100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545631703
745	NC_022440	TCC	2	6	36120	36125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545631703
746	NC_022440	GAA	2	6	36216	36221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631703
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750	NC_022440	TTG	2	6	36450	36455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545631703
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753	NC_022440	AAT	2	6	36581	36586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545631703
754	NC_022440	CAAT	2	8	36634	36641	50 %	25 %	0 %	25 %	545631703
755	NC_022440	ATG	2	6	36730	36735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631703
756	NC_022440	TCA	2	6	36739	36744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545631703
757	NC_022440	CTT	2	6	36761	36766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545631703
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885	NC_022440	C	6	6	43544	43549	0 %	0 %	0 %	100 %	545631711
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