MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia pecorum W73

Total Repeats: 21269

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_022440	GATAGG	2	12	308177	308188	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	545631945
6002	NC_022440	GCA	2	6	308216	308221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545631945
6003	NC_022440	CAG	2	6	308226	308231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545631945
6004	NC_022440	GAAA	2	8	308275	308282	75 %	0 %	25 %	0 %	545631945
6005	NC_022440	AGC	2	6	308304	308309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545631945
6006	NC_022440	GTA	2	6	308372	308377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631945
6007	NC_022440	AGG	2	6	308403	308408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545631945
6008	NC_022440	AAG	2	6	308443	308448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631945
6009	NC_022440	AAG	2	6	308466	308471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631945
6010	NC_022440	AG	3	6	308489	308494	50 %	0 %	50 %	0 %	545631945
6011	NC_022440	GA	3	6	308495	308500	50 %	0 %	50 %	0 %	545631945
6012	NC_022440	AGT	2	6	309070	309075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631946
6013	NC_022440	ATG	2	6	309144	309149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631946
6014	NC_022440	AAT	2	6	309179	309184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545631946
6015	NC_022440	GCT	2	6	309297	309302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545631946
6016	NC_022440	TCT	2	6	309321	309326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545631946
6017	NC_022440	TGG	2	6	309327	309332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545631946
6018	NC_022440	CCT	2	6	309411	309416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545631946
6019	NC_022440	CAT	2	6	309433	309438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545631946
6020	NC_022440	ACT	2	6	309446	309451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545631946
6021	NC_022440	CTT	2	6	309457	309462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545631946
6022	NC_022440	G	6	6	309463	309468	0 %	0 %	100 %	0 %	545631946
6023	NC_022440	TG	3	6	309474	309479	0 %	50 %	50 %	0 %	545631946
6024	NC_022440	ATG	2	6	309481	309486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631946
6025	NC_022440	AGGA	2	8	309572	309579	50 %	0 %	50 %	0 %	545631946
6026	NC_022440	AAT	2	6	309740	309745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545631946
6027	NC_022440	GAA	2	6	309812	309817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631946
6028	NC_022440	CTT	2	6	309870	309875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545631946
6029	NC_022440	T	6	6	309944	309949	0 %	100 %	0 %	0 %	545631946
6030	NC_022440	TGTTTG	2	12	309995	310006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545631946
6031	NC_022440	CCT	2	6	310020	310025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545631946
6032	NC_022440	TGC	2	6	310108	310113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545631946
6033	NC_022440	AG	3	6	310157	310162	50 %	0 %	50 %	0 %	545631946
6034	NC_022440	CCA	2	6	310218	310223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545631946
6035	NC_022440	GTA	2	6	310368	310373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631946
6036	NC_022440	CATC	2	8	310378	310385	25 %	25 %	0 %	50 %	545631946
6037	NC_022440	CTT	2	6	310402	310407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545631946
6038	NC_022440	AG	3	6	310452	310457	50 %	0 %	50 %	0 %	545631946
6039	NC_022440	AG	3	6	310526	310531	50 %	0 %	50 %	0 %	545631946
6040	NC_022440	A	6	6	310543	310548	100 %	0 %	0 %	0 %	545631946
6041	NC_022440	CAC	2	6	310609	310614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545631946
6042	NC_022440	TAT	2	6	310729	310734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545631946
6043	NC_022440	AG	3	6	310775	310780	50 %	0 %	50 %	0 %	545631946
6044	NC_022440	GCAATC	2	12	310800	310811	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	545631946
6045	NC_022440	CGC	2	6	310906	310911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545631946
6046	NC_022440	CTG	2	6	310918	310923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545631946
6047	NC_022440	TTAT	2	8	310929	310936	25 %	75 %	0 %	0 %	545631946
6048	NC_022440	AGTG	2	8	310964	310971	25 %	25 %	50 %	0 %	545631946
6049	NC_022440	AGG	2	6	310979	310984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545631946
6050	NC_022440	GGT	2	6	310992	310997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545631946
6051	NC_022440	TCC	2	6	311039	311044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545631946
6052	NC_022440	GCAG	2	8	311108	311115	25 %	0 %	50 %	25 %	545631946
6053	NC_022440	AGT	2	6	311123	311128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631946
6054	NC_022440	GTA	2	6	311211	311216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631946
6055	NC_022440	GAA	2	6	311250	311255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631946
6056	NC_022440	GCCATT	2	12	311351	311362	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	545631946
6057	NC_022440	AG	3	6	311402	311407	50 %	0 %	50 %	0 %	545631946
6058	NC_022440	ACT	2	6	311417	311422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545631946
6059	NC_022440	TCC	2	6	311468	311473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545631946
6060	NC_022440	TAT	2	6	311476	311481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545631946
6061	NC_022440	AGGG	2	8	311582	311589	25 %	0 %	75 %	0 %	545631946
6062	NC_022440	GAA	2	6	311598	311603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631946
6063	NC_022440	T	6	6	311711	311716	0 %	100 %	0 %	0 %	545631947
6064	NC_022440	GCC	2	6	311730	311735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545631947
6065	NC_022440	GTA	2	6	311902	311907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631947
6066	NC_022440	GTA	2	6	311953	311958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631947
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6068	NC_022440	TGG	2	6	312076	312081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545631947
6069	NC_022440	GTT	2	6	312232	312237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545631947
6070	NC_022440	AG	3	6	312303	312308	50 %	0 %	50 %	0 %	545631947
6071	NC_022440	AGT	2	6	312338	312343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631947
6072	NC_022440	TTG	2	6	312380	312385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545631947
6073	NC_022440	CAA	2	6	312398	312403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545631947
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6075	NC_022440	TTG	2	6	312521	312526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545631947
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6078	NC_022440	TGC	2	6	312723	312728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545631947
6079	NC_022440	GA	3	6	313065	313070	50 %	0 %	50 %	0 %	545631947
6080	NC_022440	TCC	2	6	313134	313139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545631947
6081	NC_022440	TTG	2	6	313163	313168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545631947
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6084	NC_022440	GTA	2	6	313255	313260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631947
6085	NC_022440	GAG	2	6	313286	313291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545631947
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6087	NC_022440	AGC	2	6	313380	313385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545631947
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6092	NC_022440	GAG	2	6	313703	313708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545631947
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6095	NC_022440	GCA	2	6	313999	314004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545631947
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6105	NC_022440	AG	3	6	314470	314475	50 %	0 %	50 %	0 %	545631947
6106	NC_022440	AAGGG	2	10	314476	314485	40 %	0 %	60 %	0 %	545631947
6107	NC_022440	AAGG	2	8	314494	314501	50 %	0 %	50 %	0 %	545631947
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6110	NC_022440	A	6	6	314726	314731	100 %	0 %	0 %	0 %	545631948
6111	NC_022440	AAC	2	6	314819	314824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545631948
6112	NC_022440	GTGA	2	8	314880	314887	25 %	25 %	50 %	0 %	545631948
6113	NC_022440	TTGC	2	8	314888	314895	0 %	50 %	25 %	25 %	545631948
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6117	NC_022440	TCT	2	6	315058	315063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545631948
6118	NC_022440	AG	3	6	315066	315071	50 %	0 %	50 %	0 %	545631948
6119	NC_022440	GCA	2	6	315093	315098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545631948
6120	NC_022440	GTT	3	9	315116	315124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545631948
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6122	NC_022440	AAAG	2	8	315237	315244	75 %	0 %	25 %	0 %	545631948
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6245	NC_022440	CAT	2	6	320876	320881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545631949
6246	NC_022440	TCC	2	6	320937	320942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545631949
6247	NC_022440	TCTT	2	8	320989	320996	0 %	75 %	0 %	25 %	545631949
6248	NC_022440	CT	3	6	321031	321036	0 %	50 %	0 %	50 %	545631949
6249	NC_022440	CTG	2	6	321051	321056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545631949
6250	NC_022440	TGC	2	6	321058	321063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545631949
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6252	NC_022440	GCT	2	6	321074	321079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545631949
6253	NC_022440	GAG	2	6	321083	321088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545631949
6254	NC_022440	GCT	3	9	321089	321097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545631949
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6260	NC_022440	GTCGTA	2	12	321232	321243	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	545631949
6261	NC_022440	GTT	2	6	321274	321279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545631949
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6263	NC_022440	TAG	2	6	321362	321367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631949
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6265	NC_022440	GTA	2	6	321385	321390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631949
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6272	NC_022440	AGT	2	6	321483	321488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631949
6273	NC_022440	GTA	3	9	321517	321525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631949
6274	NC_022440	AGA	3	9	321537	321545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631949
6275	NC_022440	CTGCGA	3	18	321576	321593	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	545631949
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6277	NC_022440	TGA	2	6	321654	321659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631949
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6282	NC_022440	A	6	6	322155	322160	100 %	0 %	0 %	0 %	545631950
6283	NC_022440	ATG	3	9	322191	322199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631950
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6289	NC_022440	TGA	2	6	322562	322567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631951
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6292	NC_022440	GA	3	6	322906	322911	50 %	0 %	50 %	0 %	545631952
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6320	NC_022440	TCCTG	2	10	324077	324086	0 %	40 %	20 %	40 %	545631952
6321	NC_022440	AGGT	2	8	324264	324271	25 %	25 %	50 %	0 %	545631952
6322	NC_022440	TGC	2	6	324440	324445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545631953
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6324	NC_022440	GA	3	6	324574	324579	50 %	0 %	50 %	0 %	545631953
6325	NC_022440	CGTT	2	8	324691	324698	0 %	50 %	25 %	25 %	545631953
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6334	NC_022440	TCT	2	6	325572	325577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545631953
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6338	NC_022440	CTT	2	6	326093	326098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545631954
6339	NC_022440	T	6	6	326105	326110	0 %	100 %	0 %	0 %	545631954
6340	NC_022440	TTG	2	6	326141	326146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545631954
6341	NC_022440	T	6	6	326174	326179	0 %	100 %	0 %	0 %	545631954
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6350	NC_022440	GGA	2	6	326417	326422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545631954
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6355	NC_022440	T	8	8	326665	326672	0 %	100 %	0 %	0 %	545631954
6356	NC_022440	CT	3	6	326687	326692	0 %	50 %	0 %	50 %	545631954
6357	NC_022440	CTTA	2	8	326714	326721	25 %	50 %	0 %	25 %	545631954
6358	NC_022440	CCT	2	6	326793	326798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545631954
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6361	NC_022440	TAA	2	6	326921	326926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545631954
6362	NC_022440	AGA	2	6	326973	326978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631954
6363	NC_022440	GCCCTT	2	12	326980	326991	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	545631954
6364	NC_022440	AAAG	2	8	327024	327031	75 %	0 %	25 %	0 %	545631954
6365	NC_022440	ACC	2	6	327054	327059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545631954
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6367	NC_022440	GA	3	6	327154	327159	50 %	0 %	50 %	0 %	545631954
6368	NC_022440	GAA	2	6	327168	327173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631954
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6480	NC_022440	GCTAT	2	10	333875	333884	20 %	40 %	20 %	20 %	545631961
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6490	NC_022440	CA	3	6	334919	334924	50 %	0 %	0 %	50 %	545631962
6491	NC_022440	T	6	6	335066	335071	0 %	100 %	0 %	0 %	545631962
6492	NC_022440	TCT	2	6	335096	335101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545631962
6493	NC_022440	GAT	2	6	335150	335155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631962
6494	NC_022440	GATA	2	8	335188	335195	50 %	25 %	25 %	0 %	545631962
6495	NC_022440	ATT	2	6	335273	335278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545631962
6496	NC_022440	ATT	2	6	335367	335372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545631962
6497	NC_022440	AG	3	6	335384	335389	50 %	0 %	50 %	0 %	545631962
6498	NC_022440	TAT	2	6	335435	335440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545631962
6499	NC_022440	AAG	2	6	335505	335510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631962
6500	NC_022440	GAT	2	6	335618	335623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631962

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