MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia pecorum PV3056/3

Total Repeats: 21186

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_022439	C	6	6	207016	207021	0 %	0 %	0 %	100 %	545630948
4002	NC_022439	AAT	2	6	207034	207039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545630948
4003	NC_022439	CT	3	6	207094	207099	0 %	50 %	0 %	50 %	545630948
4004	NC_022439	TTC	2	6	207195	207200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545630949
4005	NC_022439	TAC	3	9	207251	207259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545630949
4006	NC_022439	AGA	2	6	207288	207293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545630949
4007	NC_022439	GGGA	2	8	207341	207348	25 %	0 %	75 %	0 %	545630949
4008	NC_022439	T	7	7	207441	207447	0 %	100 %	0 %	0 %	545630949
4009	NC_022439	TAG	2	6	207498	207503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545630949
4010	NC_022439	T	6	6	207592	207597	0 %	100 %	0 %	0 %	545630949
4011	NC_022439	AG	3	6	207690	207695	50 %	0 %	50 %	0 %	545630949
4012	NC_022439	TGC	2	6	207701	207706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545630949
4013	NC_022439	CAA	2	6	207842	207847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545630949
4014	NC_022439	TTTG	2	8	207898	207905	0 %	75 %	25 %	0 %	545630949
4015	NC_022439	A	6	6	207935	207940	100 %	0 %	0 %	0 %	545630949
4016	NC_022439	A	7	7	207947	207953	100 %	0 %	0 %	0 %	545630949
4017	NC_022439	AGA	2	6	208231	208236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545630950
4018	NC_022439	GT	3	6	208270	208275	0 %	50 %	50 %	0 %	545630950
4019	NC_022439	TTG	2	6	208334	208339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545630950
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4021	NC_022439	AGAA	2	8	208406	208413	75 %	0 %	25 %	0 %	545630950
4022	NC_022439	AGA	2	6	208444	208449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545630950
4023	NC_022439	TGC	2	6	208460	208465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545630950
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4027	NC_022439	AAAAG	2	10	208679	208688	80 %	0 %	20 %	0 %	545630950
4028	NC_022439	AACC	2	8	208701	208708	50 %	0 %	0 %	50 %	545630950
4029	NC_022439	T	7	7	208731	208737	0 %	100 %	0 %	0 %	545630950
4030	NC_022439	GTT	2	6	208755	208760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545630950
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4033	NC_022439	GTT	2	6	208904	208909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545630950
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4035	NC_022439	TAAAA	2	10	208961	208970	80 %	20 %	0 %	0 %	545630950
4036	NC_022439	GCA	2	6	209094	209099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545630950
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4038	NC_022439	TAA	2	6	209131	209136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545630950
4039	NC_022439	CTA	2	6	209152	209157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545630950
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4041	NC_022439	T	7	7	209306	209312	0 %	100 %	0 %	0 %	545630950
4042	NC_022439	ATTG	2	8	209348	209355	25 %	50 %	25 %	0 %	545630950
4043	NC_022439	C	6	6	209357	209362	0 %	0 %	0 %	100 %	545630950
4044	NC_022439	TCT	2	6	209391	209396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545630950
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4046	NC_022439	ATC	2	6	209432	209437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545630950
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4049	NC_022439	TGG	2	6	209610	209615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545630950
4050	NC_022439	ACT	2	6	209643	209648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545630950
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4052	NC_022439	TCTGTG	2	12	209830	209841	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	545630950
4053	NC_022439	GTA	2	6	209850	209855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545630950
4054	NC_022439	T	6	6	209856	209861	0 %	100 %	0 %	0 %	545630950
4055	NC_022439	CAG	2	6	209902	209907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545630950
4056	NC_022439	TAC	2	6	209941	209946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545630950
4057	NC_022439	ATT	2	6	210068	210073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545630950
4058	NC_022439	ACC	2	6	210092	210097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545630950
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4060	NC_022439	CAT	2	6	210202	210207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545630950
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4071	NC_022439	TGGT	2	8	210505	210512	0 %	50 %	50 %	0 %	545630950
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4105	NC_022439	CTG	2	6	211981	211986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545630950
4106	NC_022439	TTCTT	2	10	211998	212007	0 %	80 %	0 %	20 %	545630950
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4109	NC_022439	T	6	6	212075	212080	0 %	100 %	0 %	0 %	545630950
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4111	NC_022439	GGCTC	2	10	212116	212125	0 %	20 %	40 %	40 %	545630950
4112	NC_022439	ATTT	2	8	212158	212165	25 %	75 %	0 %	0 %	545630950
4113	NC_022439	T	6	6	212163	212168	0 %	100 %	0 %	0 %	545630950
4114	NC_022439	TTA	2	6	212190	212195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545630950
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4118	NC_022439	TTGA	2	8	212248	212255	25 %	50 %	25 %	0 %	545630950
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4121	NC_022439	GA	3	6	212335	212340	50 %	0 %	50 %	0 %	545630950
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4123	NC_022439	AGA	2	6	212447	212452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545630950
4124	NC_022439	CTT	2	6	212458	212463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545630950
4125	NC_022439	CTA	2	6	212476	212481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545630950
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4127	NC_022439	CTC	2	6	212551	212556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545630950
4128	NC_022439	GCT	2	6	212589	212594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545630950
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4201	NC_022439	AG	3	6	216319	216324	50 %	0 %	50 %	0 %	545630951
4202	NC_022439	CT	3	6	216485	216490	0 %	50 %	0 %	50 %	545630952
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4224	NC_022439	AGA	2	6	217335	217340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545630954
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4229	NC_022439	CGA	2	6	217484	217489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545630954
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4233	NC_022439	GGA	2	6	217607	217612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545630954
4234	NC_022439	AGG	2	6	217634	217639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545630954
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4237	NC_022439	GATG	2	8	217865	217872	25 %	25 %	50 %	0 %	545630954
4238	NC_022439	TCC	2	6	217899	217904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545630954
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4240	NC_022439	GAA	2	6	218024	218029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545630954
4241	NC_022439	C	7	7	218061	218067	0 %	0 %	0 %	100 %	545630954
4242	NC_022439	AAG	2	6	218085	218090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545630954
4243	NC_022439	AGCA	2	8	218097	218104	50 %	0 %	25 %	25 %	545630954
4244	NC_022439	ATA	2	6	218189	218194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545630954
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4246	NC_022439	AT	3	6	218247	218252	50 %	50 %	0 %	0 %	545630954
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4493	NC_022439	A	6	6	231957	231962	100 %	0 %	0 %	0 %	545630969
4494	NC_022439	TCA	2	6	231968	231973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545630969
4495	NC_022439	AGATG	2	10	232232	232241	40 %	20 %	40 %	0 %	545630969
4496	NC_022439	AGC	2	6	232250	232255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545630969
4497	NC_022439	GAA	2	6	232341	232346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545630969
4498	NC_022439	GAA	2	6	232354	232359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545630969
4499	NC_022439	CT	3	6	232384	232389	0 %	50 %	0 %	50 %	545630969
4500	NC_022439	TCG	2	6	232499	232504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545630970

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