MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia pecorum PV3056/3

Total Repeats: 21186

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_022439	AGA	2	6	180069	180074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545630924
3502	NC_022439	GTT	2	6	180080	180085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545630924
3503	NC_022439	ATT	2	6	180256	180261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545630925
3504	NC_022439	TCTTT	2	10	180266	180275	0 %	80 %	0 %	20 %	545630925
3505	NC_022439	TAT	2	6	180307	180312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545630925
3506	NC_022439	TTCT	2	8	180425	180432	0 %	75 %	0 %	25 %	545630925
3507	NC_022439	GT	3	6	180479	180484	0 %	50 %	50 %	0 %	545630925
3508	NC_022439	AGA	2	6	180507	180512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545630925
3509	NC_022439	CTG	2	6	180611	180616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545630925
3510	NC_022439	GAA	2	6	180855	180860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545630925
3511	NC_022439	TTC	2	6	180864	180869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545630925
3512	NC_022439	GAT	2	6	180879	180884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545630925
3513	NC_022439	TTTC	2	8	180886	180893	0 %	75 %	0 %	25 %	545630925
3514	NC_022439	TTC	2	6	180914	180919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545630925
3515	NC_022439	TGAG	2	8	180941	180948	25 %	25 %	50 %	0 %	545630925
3516	NC_022439	CT	3	6	180958	180963	0 %	50 %	0 %	50 %	545630925
3517	NC_022439	AGA	2	6	181019	181024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545630925
3518	NC_022439	GA	3	6	181036	181041	50 %	0 %	50 %	0 %	545630925
3519	NC_022439	TG	3	6	181043	181048	0 %	50 %	50 %	0 %	545630925
3520	NC_022439	TTC	2	6	181106	181111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545630925
3521	NC_022439	TGGC	2	8	181200	181207	0 %	25 %	50 %	25 %	545630925
3522	NC_022439	AAC	2	6	181220	181225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545630925
3523	NC_022439	TTG	2	6	181346	181351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545630925
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3525	NC_022439	GGA	2	6	181572	181577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545630925
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3527	NC_022439	TG	3	6	181704	181709	0 %	50 %	50 %	0 %	545630925
3528	NC_022439	T	6	6	181724	181729	0 %	100 %	0 %	0 %	545630925
3529	NC_022439	AAG	2	6	181733	181738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545630925
3530	NC_022439	AG	3	6	181779	181784	50 %	0 %	50 %	0 %	545630925
3531	NC_022439	AGA	2	6	181799	181804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545630925
3532	NC_022439	AGTT	2	8	181817	181824	25 %	50 %	25 %	0 %	545630925
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3535	NC_022439	ATC	2	6	182018	182023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545630925
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3538	NC_022439	AT	3	6	182137	182142	50 %	50 %	0 %	0 %	545630925
3539	NC_022439	TC	3	6	182228	182233	0 %	50 %	0 %	50 %	545630925
3540	NC_022439	TCG	2	6	182311	182316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545630925
3541	NC_022439	T	6	6	182345	182350	0 %	100 %	0 %	0 %	545630925
3542	NC_022439	CCT	2	6	182371	182376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545630925
3543	NC_022439	CAAG	2	8	182403	182410	50 %	0 %	25 %	25 %	545630925
3544	NC_022439	AGA	2	6	182430	182435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545630925
3545	NC_022439	TTC	2	6	182448	182453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545630925
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3547	NC_022439	CCT	2	6	182555	182560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545630925
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3549	NC_022439	AAGT	2	8	182849	182856	50 %	25 %	25 %	0 %	545630925
3550	NC_022439	GAG	2	6	182914	182919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545630925
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3552	NC_022439	TGA	2	6	183002	183007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545630925
3553	NC_022439	GCTGC	2	10	183076	183085	0 %	20 %	40 %	40 %	545630925
3554	NC_022439	GAA	2	6	183187	183192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545630925
3555	NC_022439	A	6	6	183238	183243	100 %	0 %	0 %	0 %	545630925
3556	NC_022439	T	6	6	183356	183361	0 %	100 %	0 %	0 %	545630925
3557	NC_022439	TTC	2	6	183397	183402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545630925
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3560	NC_022439	TGGT	2	8	183499	183506	0 %	50 %	50 %	0 %	545630925
3561	NC_022439	AGG	2	6	183528	183533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545630925
3562	NC_022439	TACAG	2	10	183600	183609	40 %	20 %	20 %	20 %	545630925
3563	NC_022439	ATG	2	6	183620	183625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545630925
3564	NC_022439	CTT	2	6	183770	183775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545630925
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3567	NC_022439	AGTG	2	8	183891	183898	25 %	25 %	50 %	0 %	545630925
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3572	NC_022439	TTG	2	6	184055	184060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545630925
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3580	NC_022439	TTG	2	6	184291	184296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545630925
3581	NC_022439	TGG	2	6	184302	184307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545630925
3582	NC_022439	TCG	2	6	184366	184371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545630925
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3591	NC_022439	AGC	2	6	184886	184891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545630926
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3595	NC_022439	TA	3	6	185153	185158	50 %	50 %	0 %	0 %	545630926
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3597	NC_022439	T	6	6	185211	185216	0 %	100 %	0 %	0 %	545630926
3598	NC_022439	GA	3	6	185264	185269	50 %	0 %	50 %	0 %	545630926
3599	NC_022439	ATG	2	6	185275	185280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545630926
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3601	NC_022439	TG	3	6	185336	185341	0 %	50 %	50 %	0 %	545630926
3602	NC_022439	TAGCT	2	10	185412	185421	20 %	40 %	20 %	20 %	545630926
3603	NC_022439	CTG	2	6	185452	185457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545630926
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3605	NC_022439	A	7	7	185494	185500	100 %	0 %	0 %	0 %	545630926
3606	NC_022439	AGA	2	6	185558	185563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545630926
3607	NC_022439	TATTG	2	10	185601	185610	20 %	60 %	20 %	0 %	545630926
3608	NC_022439	ATT	2	6	185689	185694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545630926
3609	NC_022439	TTTG	2	8	185748	185755	0 %	75 %	25 %	0 %	545630926
3610	NC_022439	TTTC	2	8	185782	185789	0 %	75 %	0 %	25 %	545630926
3611	NC_022439	TGC	2	6	185808	185813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545630926
3612	NC_022439	ATT	2	6	185818	185823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545630926
3613	NC_022439	GAA	2	6	185853	185858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545630926
3614	NC_022439	A	6	6	185887	185892	100 %	0 %	0 %	0 %	545630926
3615	NC_022439	ATA	2	6	185894	185899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545630926
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3619	NC_022439	TCT	2	6	186193	186198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545630926
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3622	NC_022439	TTC	2	6	186418	186423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545630927
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3994	NC_022439	TGTT	2	8	206643	206650	0 %	75 %	25 %	0 %	545630948
3995	NC_022439	TCA	2	6	206657	206662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545630948
3996	NC_022439	TCC	2	6	206722	206727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545630948
3997	NC_022439	AG	3	6	206728	206733	50 %	0 %	50 %	0 %	545630948
3998	NC_022439	GA	3	6	206736	206741	50 %	0 %	50 %	0 %	545630948
3999	NC_022439	GA	3	6	206762	206767	50 %	0 %	50 %	0 %	545630948
4000	NC_022439	CAG	2	6	206793	206798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545630948

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