MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia pecorum PV3056/3

Total Repeats: 21186

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022439	AGATGC	2	12	49090	49101	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	545630794
1002	NC_022439	A	6	6	49117	49122	100 %	0 %	0 %	0 %	545630794
1003	NC_022439	A	6	6	49146	49151	100 %	0 %	0 %	0 %	545630794
1004	NC_022439	CAT	2	6	49166	49171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545630794
1005	NC_022439	GCT	2	6	49288	49293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545630794
1006	NC_022439	GTAA	2	8	49301	49308	50 %	25 %	25 %	0 %	545630794
1007	NC_022439	CGA	2	6	49401	49406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545630794
1008	NC_022439	GTT	2	6	49442	49447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545630794
1009	NC_022439	AAC	2	6	49457	49462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545630794
1010	NC_022439	AT	3	6	49485	49490	50 %	50 %	0 %	0 %	545630794
1011	NC_022439	AGT	2	6	49504	49509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545630794
1012	NC_022439	ACT	2	6	49520	49525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545630794
1013	NC_022439	GCA	2	6	49589	49594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545630794
1014	NC_022439	ATG	2	6	49623	49628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545630794
1015	NC_022439	GTT	2	6	49705	49710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545630794
1016	NC_022439	ATG	2	6	49755	49760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545630794
1017	NC_022439	CTG	2	6	49776	49781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545630794
1018	NC_022439	AGA	3	9	49822	49830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545630794
1019	NC_022439	TCT	2	6	49880	49885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545630794
1020	NC_022439	AGC	2	6	49908	49913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545630794
1021	NC_022439	GAT	2	6	49955	49960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545630794
1022	NC_022439	G	6	6	49984	49989	0 %	0 %	100 %	0 %	545630794
1023	NC_022439	TAGC	2	8	49998	50005	25 %	25 %	25 %	25 %	545630794
1024	NC_022439	GCGTTT	2	12	50011	50022	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	545630794
1025	NC_022439	GCA	2	6	50054	50059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545630794
1026	NC_022439	GTT	2	6	50207	50212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545630794
1027	NC_022439	TA	4	8	50250	50257	50 %	50 %	0 %	0 %	545630794
1028	NC_022439	TCC	2	6	50404	50409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545630794
1029	NC_022439	ATG	2	6	50474	50479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545630794
1030	NC_022439	TCGTCA	2	12	50480	50491	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	545630794
1031	NC_022439	CTTA	2	8	50560	50567	25 %	50 %	0 %	25 %	545630794
1032	NC_022439	CAG	2	6	50633	50638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545630794
1033	NC_022439	ATT	2	6	50687	50692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545630794
1034	NC_022439	CGT	2	6	50779	50784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545630794
1035	NC_022439	AGACA	2	10	50851	50860	60 %	0 %	20 %	20 %	545630794
1036	NC_022439	GCA	2	6	50864	50869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545630794
1037	NC_022439	ACA	2	6	50930	50935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545630794
1038	NC_022439	TAG	2	6	50992	50997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545630794
1039	NC_022439	ATG	2	6	51029	51034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545630794
1040	NC_022439	ACAA	2	8	51083	51090	75 %	0 %	0 %	25 %	545630794
1041	NC_022439	AAG	2	6	51183	51188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545630794
1042	NC_022439	ATG	2	6	51223	51228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545630794
1043	NC_022439	GCAAG	2	10	51602	51611	40 %	0 %	40 %	20 %	545630795
1044	NC_022439	GTT	2	6	51795	51800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545630795
1045	NC_022439	T	6	6	51817	51822	0 %	100 %	0 %	0 %	545630795
1046	NC_022439	CAA	2	6	51836	51841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545630795
1047	NC_022439	AAGAT	2	10	51869	51878	60 %	20 %	20 %	0 %	545630795
1048	NC_022439	ACA	2	6	51922	51927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545630795
1049	NC_022439	GAG	2	6	51957	51962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545630795
1050	NC_022439	GAA	2	6	52105	52110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545630795
1051	NC_022439	GGA	2	6	52202	52207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545630795
1052	NC_022439	CAA	2	6	52229	52234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545630795
1053	NC_022439	AAG	2	6	52236	52241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545630795
1054	NC_022439	TAA	2	6	52259	52264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545630795
1055	NC_022439	AAG	2	6	52317	52322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545630795
1056	NC_022439	AAG	3	9	52353	52361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545630795
1057	NC_022439	TTC	3	9	52371	52379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545630795
1058	NC_022439	TGA	2	6	52395	52400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545630795
1059	NC_022439	GTT	2	6	52486	52491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545630795
1060	NC_022439	TCT	2	6	52574	52579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545630796
1061	NC_022439	T	6	6	52582	52587	0 %	100 %	0 %	0 %	545630796
1062	NC_022439	GGA	2	6	52608	52613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545630796
1063	NC_022439	AGC	2	6	52615	52620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545630796
1064	NC_022439	CT	3	6	52700	52705	0 %	50 %	0 %	50 %	545630796
1065	NC_022439	ATG	2	6	52758	52763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545630796
1066	NC_022439	GCT	2	6	52779	52784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545630796
1067	NC_022439	AAT	2	6	52891	52896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545630796
1068	NC_022439	AGA	2	6	52909	52914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545630796
1069	NC_022439	CTC	2	6	52927	52932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545630796
1070	NC_022439	AC	3	6	52977	52982	50 %	0 %	0 %	50 %	545630796
1071	NC_022439	AAC	2	6	53043	53048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545630796
1072	NC_022439	AAG	2	6	53455	53460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545630797
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1074	NC_022439	TCA	2	6	53490	53495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545630797
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1076	NC_022439	TCT	2	6	53556	53561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545630797
1077	NC_022439	TCTT	2	8	53574	53581	0 %	75 %	0 %	25 %	545630797
1078	NC_022439	TCGT	2	8	53589	53596	0 %	50 %	25 %	25 %	545630797
1079	NC_022439	ACG	2	6	53642	53647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545630797
1080	NC_022439	TAA	2	6	53656	53661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545630797
1081	NC_022439	GCA	2	6	53745	53750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545630797
1082	NC_022439	ATT	2	6	53777	53782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545630797
1083	NC_022439	CAT	2	6	53785	53790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545630797
1084	NC_022439	ACC	2	6	53799	53804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545630797
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1088	NC_022439	A	6	6	54148	54153	100 %	0 %	0 %	0 %	545630798
1089	NC_022439	TTG	2	6	54233	54238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545630798
1090	NC_022439	TTG	2	6	54407	54412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545630798
1091	NC_022439	AGCA	2	8	54480	54487	50 %	0 %	25 %	25 %	545630798
1092	NC_022439	GA	3	6	54628	54633	50 %	0 %	50 %	0 %	545630798
1093	NC_022439	AAACA	2	10	54690	54699	80 %	0 %	0 %	20 %	545630798
1094	NC_022439	T	6	6	54752	54757	0 %	100 %	0 %	0 %	545630799
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1097	NC_022439	GTT	2	6	54837	54842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545630799
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1099	NC_022439	GAA	2	6	54929	54934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545630799
1100	NC_022439	CAA	2	6	55005	55010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545630799
1101	NC_022439	CTTT	2	8	55112	55119	0 %	75 %	0 %	25 %	545630799
1102	NC_022439	TC	3	6	55164	55169	0 %	50 %	0 %	50 %	545630799
1103	NC_022439	GTC	2	6	55198	55203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545630799
1104	NC_022439	GAGG	2	8	55210	55217	25 %	0 %	75 %	0 %	545630799
1105	NC_022439	ACG	2	6	55227	55232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545630799
1106	NC_022439	ATT	2	6	55318	55323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545630799
1107	NC_022439	CAA	2	6	55326	55331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545630799
1108	NC_022439	TAA	2	6	55389	55394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545630799
1109	NC_022439	CTT	2	6	55398	55403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545630799
1110	NC_022439	T	6	6	55420	55425	0 %	100 %	0 %	0 %	545630799
1111	NC_022439	GCA	2	6	55430	55435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545630799
1112	NC_022439	TAC	2	6	55459	55464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545630799
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1114	NC_022439	TC	3	6	55568	55573	0 %	50 %	0 %	50 %	545630799
1115	NC_022439	TCC	2	6	55636	55641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545630800
1116	NC_022439	TCT	3	9	55642	55650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545630800
1117	NC_022439	ATC	2	6	55659	55664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545630800
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1119	NC_022439	GA	3	6	55712	55717	50 %	0 %	50 %	0 %	545630800
1120	NC_022439	T	6	6	55734	55739	0 %	100 %	0 %	0 %	545630800
1121	NC_022439	ATG	2	6	55750	55755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545630800
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1126	NC_022439	T	6	6	55985	55990	0 %	100 %	0 %	0 %	545630800
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