MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia pecorum PV3056/3

Total Repeats: 21186

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_022439	TAG	2	6	308301	308306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631023
6003	NC_022439	AG	3	6	308320	308325	50 %	0 %	50 %	0 %	545631023
6004	NC_022439	GATAGG	2	12	308339	308350	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	545631023
6005	NC_022439	GCA	2	6	308378	308383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545631023
6006	NC_022439	CAG	2	6	308388	308393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545631023
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6010	NC_022439	GTT	2	6	308546	308551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545631023
6011	NC_022439	AGG	2	6	308565	308570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545631023
6012	NC_022439	AAG	2	6	308622	308627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631023
6013	NC_022439	AG	3	6	308645	308650	50 %	0 %	50 %	0 %	545631023
6014	NC_022439	GA	3	6	308651	308656	50 %	0 %	50 %	0 %	545631023
6015	NC_022439	AGT	2	6	309188	309193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631024
6016	NC_022439	ATG	2	6	309262	309267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631024
6017	NC_022439	AAT	2	6	309297	309302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545631024
6018	NC_022439	AGCG	2	8	309410	309417	25 %	0 %	50 %	25 %	545631024
6019	NC_022439	TCT	2	6	309439	309444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545631024
6020	NC_022439	TCC	2	6	309528	309533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545631024
6021	NC_022439	CAT	2	6	309551	309556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545631024
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6025	NC_022439	TG	3	6	309592	309597	0 %	50 %	50 %	0 %	545631024
6026	NC_022439	ATG	2	6	309599	309604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631024
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6030	NC_022439	GAA	2	6	309930	309935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631024
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6033	NC_022439	TGTTTG	2	12	310113	310124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545631024
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6037	NC_022439	TAG	2	6	310232	310237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631024
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6041	NC_022439	ATC	2	6	310341	310346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545631024
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6043	NC_022439	CATC	2	8	310496	310503	25 %	25 %	0 %	50 %	545631024
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6049	NC_022439	TAG	2	6	310835	310840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631024
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6051	NC_022439	GCAATC	2	12	310930	310941	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	545631024
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6053	NC_022439	GGA	3	9	311110	311118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545631024
6054	NC_022439	GTG	2	6	311123	311128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545631024
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6058	NC_022439	GCAG	2	8	311235	311242	25 %	0 %	50 %	25 %	545631024
6059	NC_022439	AGT	2	6	311250	311255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631024
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6061	NC_022439	AAAG	2	8	311362	311369	75 %	0 %	25 %	0 %	545631024
6062	NC_022439	ATT	2	6	311430	311435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545631024
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6069	NC_022439	GAA	2	6	311719	311724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631024
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6111	NC_022439	TTGT	2	8	314093	314100	0 %	75 %	25 %	0 %	545631025
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6122	NC_022439	TGTTCC	2	12	314527	314538	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	545631025
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6242	NC_022439	AGC	3	9	320494	320502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545631027
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6246	NC_022439	CTG	2	6	320765	320770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545631027
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6361	NC_022439	CTTA	2	8	326752	326759	25 %	50 %	0 %	25 %	545631032
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6365	NC_022439	AC	3	6	326976	326981	50 %	0 %	0 %	50 %	545631032
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6368	NC_022439	AAAG	2	8	327062	327069	75 %	0 %	25 %	0 %	545631032
6369	NC_022439	ACC	2	6	327092	327097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545631032
6370	NC_022439	CTT	2	6	327133	327138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545631032
6371	NC_022439	CCA	2	6	327179	327184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545631032
6372	NC_022439	GA	3	6	327192	327197	50 %	0 %	50 %	0 %	545631032
6373	NC_022439	GAA	2	6	327206	327211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631032
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6376	NC_022439	ATTAT	2	10	327443	327452	40 %	60 %	0 %	0 %	545631033
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6396	NC_022439	AGA	2	6	328720	328725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631034
6397	NC_022439	AGA	2	6	328761	328766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631034
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6476	NC_022439	GTT	2	6	332858	332863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545631038
6477	NC_022439	TCT	2	6	332918	332923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545631038
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6480	NC_022439	TAT	2	6	332979	332984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545631038
6481	NC_022439	TTC	2	6	333023	333028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545631038
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6483	NC_022439	T	7	7	333265	333271	0 %	100 %	0 %	0 %	545631039
6484	NC_022439	TG	4	8	333280	333287	0 %	50 %	50 %	0 %	545631039
6485	NC_022439	TGC	2	6	333311	333316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545631039
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6489	NC_022439	GAA	2	6	333464	333469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631039
6490	NC_022439	GCTAT	2	10	333938	333947	20 %	40 %	20 %	20 %	545631039
6491	NC_022439	TTA	2	6	334047	334052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545631039
6492	NC_022439	TA	3	6	334425	334430	50 %	50 %	0 %	0 %	545631040
6493	NC_022439	TCT	3	9	334462	334470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545631040
6494	NC_022439	TTTC	2	8	334550	334557	0 %	75 %	0 %	25 %	545631040
6495	NC_022439	GGT	2	6	334578	334583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545631040
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6499	NC_022439	GGA	2	6	334879	334884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545631040
6500	NC_022439	TCA	2	6	334909	334914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545631040

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