MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia pecorum PV3056/3

Total Repeats: 21186

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_022439	GA	3	6	284011	284016	50 %	0 %	50 %	0 %	545631014
5502	NC_022439	AAG	2	6	284058	284063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631014
5503	NC_022439	TGA	3	9	284068	284076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631014
5504	NC_022439	GTT	2	6	284189	284194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545631014
5505	NC_022439	AGG	2	6	284224	284229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545631014
5506	NC_022439	CCT	3	9	284237	284245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545631014
5507	NC_022439	CCT	2	6	284249	284254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545631014
5508	NC_022439	AAG	2	6	284367	284372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631014
5509	NC_022439	AGA	2	6	284374	284379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631014
5510	NC_022439	GGAAGA	2	12	284380	284391	50 %	0 %	50 %	0 %	545631014
5511	NC_022439	TCC	3	9	284395	284403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545631014
5512	NC_022439	CT	3	6	284438	284443	0 %	50 %	0 %	50 %	545631014
5513	NC_022439	TCC	2	6	284470	284475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545631014
5514	NC_022439	AG	3	6	284522	284527	50 %	0 %	50 %	0 %	545631014
5515	NC_022439	AGGAAG	2	12	284581	284592	50 %	0 %	50 %	0 %	545631014
5516	NC_022439	CTC	2	6	284607	284612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545631014
5517	NC_022439	AG	3	6	284624	284629	50 %	0 %	50 %	0 %	545631014
5518	NC_022439	CCTCC	2	10	284696	284705	0 %	20 %	0 %	80 %	545631014
5519	NC_022439	CTC	2	6	284728	284733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545631014
5520	NC_022439	AGGA	2	8	284746	284753	50 %	0 %	50 %	0 %	545631014
5521	NC_022439	AGG	2	6	284785	284790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545631014
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5523	NC_022439	GCA	2	6	284930	284935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545631014
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5526	NC_022439	A	6	6	284970	284975	100 %	0 %	0 %	0 %	545631014
5527	NC_022439	GAAG	2	8	284996	285003	50 %	0 %	50 %	0 %	545631014
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5533	NC_022439	GTG	2	6	285290	285295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545631015
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5535	NC_022439	AAGA	2	8	285476	285483	75 %	0 %	25 %	0 %	545631015
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5541	NC_022439	TGA	2	6	286105	286110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631015
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5544	NC_022439	TGT	2	6	286220	286225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545631015
5545	NC_022439	AGA	2	6	286247	286252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631015
5546	NC_022439	T	8	8	286257	286264	0 %	100 %	0 %	0 %	545631015
5547	NC_022439	TCG	3	9	286307	286315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545631015
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5549	NC_022439	AGT	2	6	286369	286374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631015
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5552	NC_022439	GTAATT	2	12	286466	286477	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	545631015
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5554	NC_022439	CTC	2	6	286521	286526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545631015
5555	NC_022439	TCC	2	6	286540	286545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545631015
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5557	NC_022439	A	6	6	286683	286688	100 %	0 %	0 %	0 %	545631015
5558	NC_022439	G	6	6	286728	286733	0 %	0 %	100 %	0 %	545631015
5559	NC_022439	TTC	2	6	286779	286784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545631015
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5562	NC_022439	TTGT	2	8	286961	286968	0 %	75 %	25 %	0 %	545631015
5563	NC_022439	TA	3	6	286973	286978	50 %	50 %	0 %	0 %	545631015
5564	NC_022439	GTA	2	6	287006	287011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631015
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5593	NC_022439	AAGC	2	8	288180	288187	50 %	0 %	25 %	25 %	545631016
5594	NC_022439	CTT	2	6	288303	288308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545631016
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5604	NC_022439	TGAA	2	8	288722	288729	50 %	25 %	25 %	0 %	545631016
5605	NC_022439	A	6	6	288756	288761	100 %	0 %	0 %	0 %	545631016
5606	NC_022439	GGA	2	6	288763	288768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545631016
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5621	NC_022439	AGA	2	6	289488	289493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631016
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5623	NC_022439	AACAT	2	10	289652	289661	60 %	20 %	0 %	20 %	545631016
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5989	NC_022439	CTG	3	9	307689	307697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545631023
5990	NC_022439	CTC	2	6	307713	307718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545631023
5991	NC_022439	CTG	2	6	307719	307724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545631023
5992	NC_022439	TTG	2	6	307750	307755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545631023
5993	NC_022439	TCC	2	6	307771	307776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545631023
5994	NC_022439	TGT	2	6	307836	307841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545631023
5995	NC_022439	CCA	2	6	307919	307924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545631023
5996	NC_022439	TTTG	2	8	307945	307952	0 %	75 %	25 %	0 %	545631023
5997	NC_022439	T	7	7	308104	308110	0 %	100 %	0 %	0 %	545631023
5998	NC_022439	AGAAAG	2	12	308155	308166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631023
5999	NC_022439	CAT	2	6	308190	308195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545631023
6000	NC_022439	TTC	2	6	308207	308212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545631023

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