MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2544 genome

Total Repeats: 36529

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_022353	GAT	2	6	183144	183149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543949164
4003	NC_022353	T	6	6	183171	183176	0 %	100 %	0 %	0 %	543949164
4004	NC_022353	T	7	7	183181	183187	0 %	100 %	0 %	0 %	543949164
4005	NC_022353	T	6	6	183259	183264	0 %	100 %	0 %	0 %	543949164
4006	NC_022353	TAT	2	6	183268	183273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949164
4007	NC_022353	T	7	7	183328	183334	0 %	100 %	0 %	0 %	543949164
4008	NC_022353	ATT	2	6	183392	183397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949164
4009	NC_022353	CAT	2	6	183405	183410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543949165
4010	NC_022353	T	6	6	183470	183475	0 %	100 %	0 %	0 %	543949165
4011	NC_022353	GTA	2	6	183490	183495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543949165
4012	NC_022353	A	6	6	183495	183500	100 %	0 %	0 %	0 %	543949165
4013	NC_022353	TCA	2	6	183517	183522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543949165
4014	NC_022353	T	8	8	183523	183530	0 %	100 %	0 %	0 %	543949165
4015	NC_022353	A	6	6	183541	183546	100 %	0 %	0 %	0 %	543949165
4016	NC_022353	ATT	2	6	183561	183566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949165
4017	NC_022353	TCA	2	6	183572	183577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543949165
4018	NC_022353	TG	3	6	183580	183585	0 %	50 %	50 %	0 %	543949165
4019	NC_022353	ATA	2	6	183630	183635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543949165
4020	NC_022353	CTC	2	6	183764	183769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	543949165
4021	NC_022353	CTGCTC	2	12	183770	183781	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	543949165
4022	NC_022353	ATA	2	6	183783	183788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543949165
4023	NC_022353	CAA	2	6	183801	183806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543949165
4024	NC_022353	TCA	2	6	183830	183835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543949165
4025	NC_022353	T	6	6	183857	183862	0 %	100 %	0 %	0 %	543949165
4026	NC_022353	TATC	2	8	183866	183873	25 %	50 %	0 %	25 %	543949165
4027	NC_022353	TAG	2	6	183875	183880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543949165
4028	NC_022353	TGC	2	6	184065	184070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543949165
4029	NC_022353	T	7	7	184156	184162	0 %	100 %	0 %	0 %	543949165
4030	NC_022353	ATT	2	6	184224	184229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949165
4031	NC_022353	CTT	2	6	184241	184246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543949165
4032	NC_022353	ATA	2	6	184258	184263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543949165
4033	NC_022353	TCC	2	6	184269	184274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	543949165
4034	NC_022353	GAT	2	6	184334	184339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543949165
4035	NC_022353	AAGC	2	8	184340	184347	50 %	0 %	25 %	25 %	543949165
4036	NC_022353	AAC	2	6	184365	184370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543949165
4037	NC_022353	T	6	6	184374	184379	0 %	100 %	0 %	0 %	543949165
4038	NC_022353	T	6	6	184381	184386	0 %	100 %	0 %	0 %	543949165
4039	NC_022353	TCAC	2	8	184393	184400	25 %	25 %	0 %	50 %	543949165
4040	NC_022353	CCACC	2	10	184418	184427	20 %	0 %	0 %	80 %	543949165
4041	NC_022353	T	8	8	184501	184508	0 %	100 %	0 %	0 %	543949165
4042	NC_022353	ACC	2	6	184594	184599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543949165
4043	NC_022353	T	6	6	184659	184664	0 %	100 %	0 %	0 %	543949166
4044	NC_022353	ATTTTC	2	12	184692	184703	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	543949166
4045	NC_022353	TCA	2	6	184726	184731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543949166
4046	NC_022353	CAAA	2	8	184843	184850	75 %	0 %	0 %	25 %	543949166
4047	NC_022353	GCT	2	6	184981	184986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543949166
4048	NC_022353	GT	3	6	184997	185002	0 %	50 %	50 %	0 %	543949166
4049	NC_022353	ATTTT	2	10	185024	185033	20 %	80 %	0 %	0 %	543949166
4050	NC_022353	T	7	7	185030	185036	0 %	100 %	0 %	0 %	543949166
4051	NC_022353	CTA	2	6	185063	185068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543949166
4052	NC_022353	TCA	2	6	185176	185181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543949166
4053	NC_022353	ATA	2	6	185212	185217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543949166
4054	NC_022353	TCTT	2	8	185223	185230	0 %	75 %	0 %	25 %	543949166
4055	NC_022353	T	7	7	185229	185235	0 %	100 %	0 %	0 %	543949166
4056	NC_022353	TGT	2	6	185280	185285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543949166
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4058	NC_022353	A	6	6	185361	185366	100 %	0 %	0 %	0 %	543949166
4059	NC_022353	TCA	2	6	185374	185379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543949166
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4061	NC_022353	TAA	2	6	185435	185440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543949166
4062	NC_022353	GTAT	2	8	185449	185456	25 %	50 %	25 %	0 %	543949166
4063	NC_022353	TAG	2	6	185543	185548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543949166
4064	NC_022353	TGT	2	6	185698	185703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543949166
4065	NC_022353	GAT	2	6	185739	185744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543949166
4066	NC_022353	TGC	2	6	185763	185768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543949166
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4069	NC_022353	TAT	2	6	185893	185898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949167
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4071	NC_022353	ATT	2	6	185963	185968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949167
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4075	NC_022353	ATT	2	6	186218	186223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949167
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4077	NC_022353	AAATC	2	10	186325	186334	60 %	20 %	0 %	20 %	543949167
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4079	NC_022353	A	6	6	186389	186394	100 %	0 %	0 %	0 %	543949167
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4082	NC_022353	ATT	2	6	186533	186538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949167
4083	NC_022353	ATA	2	6	186544	186549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543949167
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4085	NC_022353	AT	3	6	186622	186627	50 %	50 %	0 %	0 %	543949167
4086	NC_022353	AAT	3	9	186644	186652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543949167
4087	NC_022353	T	8	8	186652	186659	0 %	100 %	0 %	0 %	543949167
4088	NC_022353	TTTA	2	8	186673	186680	25 %	75 %	0 %	0 %	543949168
4089	NC_022353	CAG	2	6	186693	186698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543949168
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4091	NC_022353	CTT	2	6	186933	186938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543949168
4092	NC_022353	TCT	2	6	186968	186973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543949168
4093	NC_022353	T	7	7	186986	186992	0 %	100 %	0 %	0 %	543949168
4094	NC_022353	ATT	2	6	187027	187032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949168
4095	NC_022353	CT	3	6	187091	187096	0 %	50 %	0 %	50 %	543949168
4096	NC_022353	TTG	2	6	187121	187126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543949168
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4100	NC_022353	ATA	2	6	187252	187257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543949168
4101	NC_022353	A	6	6	187298	187303	100 %	0 %	0 %	0 %	543949168
4102	NC_022353	TTTG	2	8	187364	187371	0 %	75 %	25 %	0 %	543949168
4103	NC_022353	CTA	2	6	187506	187511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543949168
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4105	NC_022353	CTT	2	6	187554	187559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543949168
4106	NC_022353	T	7	7	187578	187584	0 %	100 %	0 %	0 %	543949168
4107	NC_022353	AGC	2	6	187625	187630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543949169
4108	NC_022353	ATT	2	6	187652	187657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949169
4109	NC_022353	CA	3	6	187673	187678	50 %	0 %	0 %	50 %	543949169
4110	NC_022353	T	7	7	187688	187694	0 %	100 %	0 %	0 %	543949169
4111	NC_022353	AAAACT	2	12	187731	187742	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	543949169
4112	NC_022353	T	6	6	187742	187747	0 %	100 %	0 %	0 %	543949169
4113	NC_022353	ATAAAA	2	12	187799	187810	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	543949169
4114	NC_022353	TTA	2	6	187831	187836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949169
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4116	NC_022353	T	8	8	188028	188035	0 %	100 %	0 %	0 %	543949169
4117	NC_022353	CTTT	2	8	188061	188068	0 %	75 %	0 %	25 %	543949169
4118	NC_022353	A	6	6	188079	188084	100 %	0 %	0 %	0 %	543949169
4119	NC_022353	TGA	2	6	188088	188093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543949169
4120	NC_022353	T	6	6	188135	188140	0 %	100 %	0 %	0 %	543949169
4121	NC_022353	TAAA	2	8	188198	188205	75 %	25 %	0 %	0 %	543949169
4122	NC_022353	A	7	7	188242	188248	100 %	0 %	0 %	0 %	543949169
4123	NC_022353	T	6	6	188329	188334	0 %	100 %	0 %	0 %	543949170
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4125	NC_022353	TTTTGC	2	12	188355	188366	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	543949170
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4367	NC_022353	TCT	2	6	200258	200263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543949187
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4372	NC_022353	TCT	2	6	200476	200481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543949187
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4376	NC_022353	T	6	6	200674	200679	0 %	100 %	0 %	0 %	543949187
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