MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2544 genome

Total Repeats: 36529

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022353	AT	3	6	47365	47370	50 %	50 %	0 %	0 %	543949004
1002	NC_022353	CA	3	6	47394	47399	50 %	0 %	0 %	50 %	543949004
1003	NC_022353	A	6	6	47620	47625	100 %	0 %	0 %	0 %	543949004
1004	NC_022353	ATC	2	6	47663	47668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543949004
1005	NC_022353	T	6	6	47685	47690	0 %	100 %	0 %	0 %	543949004
1006	NC_022353	GAC	2	6	47734	47739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543949004
1007	NC_022353	AGCAA	2	10	47765	47774	60 %	0 %	20 %	20 %	543949004
1008	NC_022353	A	6	6	47794	47799	100 %	0 %	0 %	0 %	543949004
1009	NC_022353	CGC	2	6	47842	47847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	543949004
1010	NC_022353	AAG	2	6	47856	47861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543949004
1011	NC_022353	TA	3	6	47869	47874	50 %	50 %	0 %	0 %	543949004
1012	NC_022353	ATG	2	6	47926	47931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543949004
1013	NC_022353	T	6	6	47938	47943	0 %	100 %	0 %	0 %	543949004
1014	NC_022353	ATC	2	6	47984	47989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543949004
1015	NC_022353	A	7	7	47990	47996	100 %	0 %	0 %	0 %	543949004
1016	NC_022353	CAAA	2	8	48012	48019	75 %	0 %	0 %	25 %	543949004
1017	NC_022353	CAT	2	6	48106	48111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543949004
1018	NC_022353	CTT	2	6	48132	48137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543949004
1019	NC_022353	A	6	6	48205	48210	100 %	0 %	0 %	0 %	543949004
1020	NC_022353	ATC	2	6	48235	48240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543949004
1021	NC_022353	CA	3	6	48247	48252	50 %	0 %	0 %	50 %	543949004
1022	NC_022353	AAAC	2	8	48253	48260	75 %	0 %	0 %	25 %	543949004
1023	NC_022353	GAA	2	6	48271	48276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543949004
1024	NC_022353	AT	3	6	48331	48336	50 %	50 %	0 %	0 %	543949004
1025	NC_022353	A	7	7	48361	48367	100 %	0 %	0 %	0 %	543949004
1026	NC_022353	A	6	6	48389	48394	100 %	0 %	0 %	0 %	543949004
1027	NC_022353	GT	3	6	48524	48529	0 %	50 %	50 %	0 %	543949004
1028	NC_022353	CAAAT	2	10	48664	48673	60 %	20 %	0 %	20 %	543949005
1029	NC_022353	CAAG	2	8	48738	48745	50 %	0 %	25 %	25 %	543949005
1030	NC_022353	A	8	8	48758	48765	100 %	0 %	0 %	0 %	543949005
1031	NC_022353	TGA	3	9	48771	48779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543949005
1032	NC_022353	CTT	2	6	48880	48885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543949005
1033	NC_022353	CA	3	6	48918	48923	50 %	0 %	0 %	50 %	543949005
1034	NC_022353	ATGAAA	2	12	48971	48982	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	543949005
1035	NC_022353	AAG	2	6	48995	49000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543949005
1036	NC_022353	A	7	7	49009	49015	100 %	0 %	0 %	0 %	543949005
1037	NC_022353	AG	3	6	49069	49074	50 %	0 %	50 %	0 %	543949005
1038	NC_022353	GAA	2	6	49087	49092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543949005
1039	NC_022353	AGA	2	6	49113	49118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543949005
1040	NC_022353	A	6	6	49172	49177	100 %	0 %	0 %	0 %	543949005
1041	NC_022353	A	6	6	49193	49198	100 %	0 %	0 %	0 %	543949005
1042	NC_022353	AGA	2	6	49266	49271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543949005
1043	NC_022353	AGC	2	6	49317	49322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543949005
1044	NC_022353	ACT	2	6	49326	49331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543949005
1045	NC_022353	AGA	2	6	49335	49340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543949005
1046	NC_022353	ATAC	2	8	49341	49348	50 %	25 %	0 %	25 %	543949005
1047	NC_022353	AAG	2	6	49376	49381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543949005
1048	NC_022353	TAA	2	6	49485	49490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543949005
1049	NC_022353	TAAACT	2	12	49503	49514	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	543949005
1050	NC_022353	A	6	6	49580	49585	100 %	0 %	0 %	0 %	543949005
1051	NC_022353	AAG	2	6	49595	49600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543949005
1052	NC_022353	A	7	7	49706	49712	100 %	0 %	0 %	0 %	543949005
1053	NC_022353	AGA	2	6	49794	49799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543949005
1054	NC_022353	A	6	6	49811	49816	100 %	0 %	0 %	0 %	543949005
1055	NC_022353	AT	3	6	49829	49834	50 %	50 %	0 %	0 %	543949005
1056	NC_022353	A	7	7	49837	49843	100 %	0 %	0 %	0 %	543949005
1057	NC_022353	GAA	2	6	49942	49947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543949005
1058	NC_022353	TGT	2	6	50089	50094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543949006
1059	NC_022353	ATG	2	6	50120	50125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543949006
1060	NC_022353	GCT	2	6	50209	50214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543949006
1061	NC_022353	CCA	2	6	50320	50325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543949006
1062	NC_022353	GATA	2	8	50330	50337	50 %	25 %	25 %	0 %	543949006
1063	NC_022353	TTGT	2	8	50367	50374	0 %	75 %	25 %	0 %	543949006
1064	NC_022353	T	6	6	50383	50388	0 %	100 %	0 %	0 %	543949006
1065	NC_022353	GCAA	2	8	50412	50419	50 %	0 %	25 %	25 %	543949006
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1068	NC_022353	A	7	7	50490	50496	100 %	0 %	0 %	0 %	543949006
1069	NC_022353	CTT	2	6	50534	50539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543949006
1070	NC_022353	GAT	2	6	50643	50648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543949006
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1072	NC_022353	T	6	6	50785	50790	0 %	100 %	0 %	0 %	543949006
1073	NC_022353	ATT	2	6	50880	50885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949006
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1075	NC_022353	TTC	2	6	50970	50975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543949006
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1077	NC_022353	T	6	6	51048	51053	0 %	100 %	0 %	0 %	543949006
1078	NC_022353	ATT	2	6	51233	51238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949007
1079	NC_022353	GTTT	2	8	51245	51252	0 %	75 %	25 %	0 %	543949007
1080	NC_022353	T	6	6	51250	51255	0 %	100 %	0 %	0 %	543949007
1081	NC_022353	TCT	2	6	51271	51276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543949007
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1083	NC_022353	AAAG	2	8	51318	51325	75 %	0 %	25 %	0 %	543949007
1084	NC_022353	GATAA	2	10	51342	51351	60 %	20 %	20 %	0 %	543949007
1085	NC_022353	TTTG	2	8	51441	51448	0 %	75 %	25 %	0 %	543949007
1086	NC_022353	A	7	7	51476	51482	100 %	0 %	0 %	0 %	543949007
1087	NC_022353	GTTT	2	8	51485	51492	0 %	75 %	25 %	0 %	543949007
1088	NC_022353	ACG	2	6	51636	51641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543949007
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1091	NC_022353	GAAA	2	8	51710	51717	75 %	0 %	25 %	0 %	543949007
1092	NC_022353	A	7	7	51715	51721	100 %	0 %	0 %	0 %	543949007
1093	NC_022353	A	6	6	51781	51786	100 %	0 %	0 %	0 %	543949007
1094	NC_022353	TA	3	6	51843	51848	50 %	50 %	0 %	0 %	543949007
1095	NC_022353	TAT	2	6	51854	51859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949007
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1097	NC_022353	TCT	3	9	51975	51983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543949008
1098	NC_022353	CAT	2	6	52039	52044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543949008
1099	NC_022353	ATT	2	6	52244	52249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949008
1100	NC_022353	ACCGC	2	10	52260	52269	20 %	0 %	20 %	60 %	543949008
1101	NC_022353	TCA	2	6	52300	52305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543949008
1102	NC_022353	CGCCTT	2	12	52306	52317	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	543949008
1103	NC_022353	TTGT	2	8	52384	52391	0 %	75 %	25 %	0 %	543949008
1104	NC_022353	CTTTT	2	10	52426	52435	0 %	80 %	0 %	20 %	543949008
1105	NC_022353	ACCGC	2	10	52452	52461	20 %	0 %	20 %	60 %	543949008
1106	NC_022353	TTC	2	6	52466	52471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543949008
1107	NC_022353	ACG	2	6	52571	52576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543949008
1108	NC_022353	TTTCA	2	10	52673	52682	20 %	60 %	0 %	20 %	543949008
1109	NC_022353	CAT	2	6	52747	52752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543949008
1110	NC_022353	CTT	2	6	52891	52896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543949008
1111	NC_022353	T	6	6	52906	52911	0 %	100 %	0 %	0 %	543949008
1112	NC_022353	TTC	2	6	52995	53000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543949008
1113	NC_022353	TCA	2	6	53088	53093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543949008
1114	NC_022353	T	6	6	53187	53192	0 %	100 %	0 %	0 %	543949008
1115	NC_022353	GCA	2	6	53196	53201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543949008
1116	NC_022353	CAG	2	6	53287	53292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543949008
1117	NC_022353	TTG	2	6	53307	53312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543949008
1118	NC_022353	T	6	6	53348	53353	0 %	100 %	0 %	0 %	543949008
1119	NC_022353	CTT	2	6	53383	53388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543949008
1120	NC_022353	CTA	2	6	53395	53400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543949008
1121	NC_022353	ATCA	2	8	53414	53421	50 %	25 %	0 %	25 %	543949008
1122	NC_022353	ATG	2	6	53475	53480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543949008
1123	NC_022353	T	6	6	53514	53519	0 %	100 %	0 %	0 %	543949008
1124	NC_022353	TAA	2	6	53615	53620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543949008
1125	NC_022353	GA	3	6	53878	53883	50 %	0 %	50 %	0 %	543949009
1126	NC_022353	A	6	6	53883	53888	100 %	0 %	0 %	0 %	543949009
1127	NC_022353	A	6	6	53945	53950	100 %	0 %	0 %	0 %	543949009
1128	NC_022353	GAA	2	6	53992	53997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543949009
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1130	NC_022353	AGA	2	6	54030	54035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543949009
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1242	NC_022353	TA	3	6	58266	58271	50 %	50 %	0 %	0 %	543949012
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1258	NC_022353	ATTTC	2	10	58903	58912	20 %	60 %	0 %	20 %	543949013
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1382	NC_022353	T	6	6	64802	64807	0 %	100 %	0 %	0 %	543949020
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